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稻曲病菌接种技术、群体遗传结构及致病力分化研究

摘要第11-14页
Abstract第14-17页
缩略词表(Abbreviation)第18-20页
第一章 文献综述第20-37页
    1 稻曲病症状、分布及其危害第20-21页
        1.1 症状第20页
        1.2 分布与危害第20-21页
    2 稻曲病病原学研究第21-27页
        2.1 病原菌形态特征第21-23页
            2.1.1 无性阶段第22页
            2.1.2 有性阶段第22-23页
        2.2 病原菌生物学特性第23-24页
            2.2.1 菌丝第23页
            2.2.2 厚垣孢子第23-24页
            2.2.3 分生孢子第24页
            2.2.4 菌核第24页
        2.3 病原菌的致病力分化第24-25页
        2.4 毒素研究第25-27页
            2.4.1 毒素的种类和结构第25-26页
            2.4.2 毒素作用第26-27页
    3 稻曲病病害循环研究第27-28页
        3.1 侵染源及初侵染第27页
        3.2 侵染部位第27-28页
        3.3 侵染时期第28页
    4 稻曲病流行规律及防治方法第28-34页
        4.1 田间流行动态和分布第28-29页
        4.2 病害严重度的分级标准第29页
        4.3 流行因素第29-31页
            4.3.1 田间病原菌数量第29-30页
            4.3.2 品种抗性第30页
            4.3.3 气候环境因素第30页
            4.3.4 栽培管理第30-31页
        4.4 防治措施第31-34页
            4.4.1 抗病品种第31-33页
            4.4.2 农业防治第33页
            4.4.3 化学防治第33-34页
            4.4.4 生物防治第34页
    5 稻曲病菌的群体遗传研究第34-35页
    6 稻曲病致病机理研究第35-36页
    7 本研究的目的和意义第36-37页
第二章 稻曲病菌室内人工接种技术研究第37-53页
    1 前言第37-38页
    2 材料与方法第38-42页
        2.1 材料第38-39页
            2.1.1 供试菌株第38页
            2.1.2 供试品种第38页
            2.1.3 培养基第38-39页
            2.1.4 仪器第39页
        2.2 方法第39-42页
            2.2.1 接种体制备第39页
            2.2.2 水稻种植第39-40页
            2.2.3 接种方法第40-41页
            2.2.4 病穗率调查及统计分析第41页
            2.2.5 模型构建第41-42页
    3 结果与分析第42-50页
        3.1 水稻幼穗分化期对稻曲病接种效率的影响第42-43页
        3.2 不同温度和保湿时间对稻曲病接种效率的影响第43-45页
        3.3 稻曲病病穗率对温度和保湿时间二元模型构建及其响应面分析第45-49页
        3.4 接种后期温湿度培养条件对稻曲病接种效率的影响第49-50页
    4 讨论第50-53页
第三章 稻曲病抗病品种评价第53-81页
    1 前言第53-54页
    2 材料与方法第54-56页
        2.1 材料第54页
            2.1.1 供试水稻品种第54页
            2.1.2 供试菌株及接种体制备第54页
        2.2 方法第54-56页
            2.2.1 不同水稻品种对稻曲病的田间抗性评价第54-55页
            2.2.2 不同年份和地区稻曲病发病严重度的差异比较第55页
            2.2.3 田间表现高抗性水稻品种的稻曲病菌室内人工接种第55-56页
    3 结果与分析第56-70页
        3.1 不同水稻品种对稻曲病田间抗病性评价第56-59页
            3.1.1 宜昌市远安县试验场水稻品种对稻曲病的抗性评价第57页
            3.1.2 黄石市阳新县试验场水稻品种对稻曲病抗性评价第57-59页
        3.2 不同年份和地区稻曲病发病差异及其气候条件原因分析第59-67页
            3.2.1 不同年份稻曲病发病差异及其原因分析第59-63页
            3.2.2 不同地区稻曲病发病差异及其原因分析第63-67页
        3.3 八个高抗稻曲病水稻品种的室内人工接种鉴定第67-70页
    4 讨论第70-81页
第四章 基于Illumina测序技术的稻曲病菌SSR标记开发及遗传结构研究第81-107页
    1 前言第81-82页
    2 材料与方法第82-90页
        2.1 材料第82-85页
            2.1.1 供试菌株第82-83页
            2.1.2 培养基和试剂第83-84页
            2.1.3 仪器第84-85页
        2.2 方法第85-89页
            2.2.1 稻曲病菌株分离与纯化第85页
            2.2.2 基因组DNA提取第85-86页
            2.2.3 稻曲病菌基因组测序及拼接第86-87页
            2.2.4 微卫星标记引物设计第87页
            2.2.5 微卫星标记引物筛选第87-88页
            2.2.6 微卫星标记片段的PCR扩增及其检测第88-89页
        2.3 数据分析第89-90页
            2.3.1 稻曲病菌不同微卫星位点多态性及地理群体的遗传多样性分析第89页
            2.3.2 稻曲病菌群体遗传结构分析第89-90页
            2.3.3 空间遗传分析第90页
    3 结果与分析第90-105页
        3.1 不同地理来源的稻曲病菌的分离及纯化第90-93页
        3.2 稻曲病菌的全基因组序列拼接第93-94页
        3.3 微卫星标记的开发第94-98页
            3.3.1 多态性微卫星标记的筛选第94-97页
            3.3.2 微卫星标记的多态性鉴定第97-98页
        3.4 不同地区稻曲病菌的群体多样性第98-99页
        3.5 群体遗传结构第99-102页
            3.5.1 系统进化分析第99-100页
            3.5.2 贝叶斯聚类第100-102页
        3.6 空间遗传结构分析第102-105页
            3.6.1 分子方差分析第102-104页
            3.6.2 主坐标分析第104-105页
    4 讨论第105-107页
第五章 湖北省稻曲病菌生物学特性和致病力分化研究第107-130页
    1 前言第107-108页
    2 材料与方法第108-115页
        2.1 材料第108-111页
            2.1.1 供试菌株及接种体制备第108-110页
            2.1.2 供试品种第110页
            2.1.3 培养基和试剂第110-111页
            2.1.4 仪器第111页
        2.2 方法第111-114页
            2.2.1 稻曲病菌株的分离及纯化第111-112页
            2.2.2 稻曲病菌生物量、产孢量及粗毒素对水稻幼芽抑制率的测定第112页
            2.2.3 不同稻曲病菌株的微卫星标记分型第112-114页
            2.2.4 稻曲病菌株致病力测定及致病类型划分第114页
        2.3 数据分析第114-115页
    3 结果与分析第115-128页
        3.1 不同稻曲病菌生物量、产孢量及粗毒素对水稻幼芽抑制率第115-116页
        3.2 湖北省不同地理来源稻曲病菌的群体遗传多样性第116-121页
            3.2.1 湖北省稻曲病菌株的微卫星标记引物扩增检测结果第116-119页
            3.2.2 湖北省稻曲病菌的遗传多样性第119-121页
        3.3 湖北省稻曲病菌的致病力分化第121-128页
            3.3.1 湖北省稻曲病菌株的致病力差异第121-123页
            3.3.2 湖北省稻曲病菌株致病型群体的划分及其分布第123-126页
            3.3.3 不同致病型稻曲病菌群体生物量、产孢量及粗毒素对水稻幼芽抑制率的差异第126-127页
            3.3.4 稻曲病菌的致病力与其遗传特性之间的相关性第127-128页
    4 讨论第128-130页
第六章 结论、创新点与展望第130-133页
    1 结论第130-131页
    2 创新点第131页
    3 展望第131-133页
参考文献第133-147页
附录1 稻曲病菌室内人工接种流程第147-148页
附录2 不同水稻幼穗分化期水稻小花形态第148-149页
附录3 不同水稻幼穗分化期花粉细胞形态第149-150页
附录4 博士期间发表的论文和专利申请第150-152页
致谢第152页

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