| 摘要 | 第4-7页 |
| abstract | 第7-11页 |
| 引言 | 第14-18页 |
| 第一章 亚东鲑规模化人工繁育研究 | 第18-31页 |
| 1 前言 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-21页 |
| 2.1 设备与器材 | 第19页 |
| 2.2 试验地点 | 第19页 |
| 2.3 亲鱼的挑选 | 第19页 |
| 2.4 亲鱼的强化培育 | 第19页 |
| 2.5 亲鱼的人工孵化 | 第19-20页 |
| 2.6 鱼苗的开口驯食 | 第20-21页 |
| 3 结果与分析 | 第21-28页 |
| 3.1 亲鱼雌雄鉴别、挑选及强化培育 | 第21-22页 |
| 3.2 亚东鲑亲鱼卵粒的采集、授精及人工繁育效果 | 第22-23页 |
| 3.3 亚东鲑胚胎发育积温统计 | 第23-26页 |
| 3.4 胚胎发育分期 | 第26页 |
| 3.5 胚胎发育期间的管理措施 | 第26-27页 |
| 3.6 鱼苗的开口驯食 | 第27-28页 |
| 4 讨论 | 第28-31页 |
| 4.1 亚东鲑人工孵化关键技术 | 第28-29页 |
| 4.2 鱼苗开口驯食关键技术 | 第29-31页 |
| 第二章 基于高通量测序的亚东鲑转录组学研究 | 第31-44页 |
| 1 前言 | 第31-32页 |
| 2 材料与方法 | 第32-35页 |
| 2.1 样本采集 | 第32页 |
| 2.2 组织总RNA的提取 | 第32-33页 |
| 2.3 cDNA文库的构建和测序 | 第33页 |
| 2.4 原始数据raw reads的过滤 | 第33-34页 |
| 2.5 转录组拼接 | 第34页 |
| 2.6 转录组的注释 | 第34-35页 |
| 3 结果与分析 | 第35-41页 |
| 3.1 亚东鲑转录组测序及组装 | 第35-38页 |
| 3.2 拼接序列的注释 | 第38-39页 |
| 3.3 KEGG代谢通路注释 | 第39-41页 |
| 4 讨论 | 第41-44页 |
| 4.1 亚东鲑转录组高通量测序分析 | 第41页 |
| 4.2 功能注释及高原水域环境适应性的分子机制探讨 | 第41-44页 |
| 第三章 翘嘴红鲌育种群体的遗传差异与亲缘关系分析 | 第44-53页 |
| 1 前言 | 第44-45页 |
| 2 材料与方法 | 第45-48页 |
| 2.1 样本采集 | 第45页 |
| 2.2 基因组DNA的提取 | 第45-46页 |
| 2.3 微卫星标记的PCR扩增及核酸分析系统检测 | 第46-47页 |
| 2.4 数据处理与分析 | 第47-48页 |
| 3 结果与分析 | 第48-51页 |
| 3.1 群体内遗传变异分析 | 第48页 |
| 3.2 群体间遗传差异分析 | 第48-50页 |
| 3.3 群体间遗传结构分析 | 第50-51页 |
| 4 讨论 | 第51-53页 |
| 4.1 群体遗传多样性 | 第51页 |
| 4.2 群体间遗传差异分析 | 第51-52页 |
| 4.3 群体间遗传结构分析 | 第52-53页 |
| 第四章 翘嘴红鲌免疫相关基因与通路的转录组学分析 | 第53-71页 |
| 1 前言 | 第53-54页 |
| 2 材料与方法 | 第54-55页 |
| 2.1 样本采集 | 第54页 |
| 2.2 组织总RNA的提取 | 第54页 |
| 2.3 cDNA文库的构建和测序 | 第54-55页 |
| 2.4 测序数据的过滤与拼接组装 | 第55页 |
| 2.5 转录本的注释 | 第55页 |
| 3 结果与分析 | 第55-66页 |
| 3.1 翘嘴红鲌RNA-seq测序数据统计 | 第55-56页 |
| 3.2 转录组从头测序数据的组装 | 第56-57页 |
| 3.3 序列的同源性比对 | 第57-59页 |
| 3.4 转录本的GO功能注释聚类 | 第59-61页 |
| 3.5 KEGG代谢通路注释结果 | 第61页 |
| 3.6 免疫相关基因与其涉及主要通路的分析结果 | 第61-66页 |
| 4 讨论 | 第66-71页 |
| 4.1 测序数据质量与注释 | 第66-67页 |
| 4.2 免疫相关基因表达与调控的分子机制 | 第67-71页 |
| 小结 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-81页 |
| 硕士期间科研成果及获奖情况 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82页 |