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集胞藻PCC 6803中组氨酸激酶Hik33功能蛋白质组学研究

摘要第8-13页
ABSTRACT第13-17页
符号说明及缩略词第18-20页
第一章 绪论第20-40页
    1.1 蓝藻(Cyanobacteria)第20-24页
        1.1.1 蓝藻的细胞结构第20-21页
        1.1.2 蓝藻的光合作用第21-22页
        1.1.3 蓝藻光合系统与高等植物的区别第22-23页
        1.1.4 集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803简介第23页
        1.1.5 集胞藻6803的代谢模式第23-24页
        1.1.6 集胞藻6803的遗传信息及研究现状第24页
    1.2 蓝藻中的信号转导系统第24-29页
        1.2.1 二元信号转导系统第25-26页
        1.2.2 丝氨酸/苏氨酸激酶(STK)系统第26-27页
        1.2.3 集胞藻6803中的信号转导系统第27-29页
    1.3 集胞藻6803中组氨酸激酶Hik33的调控功能第29-32页
        1.3.1 Hik33参与集胞藻6803低温胁迫应答调控第30页
        1.3.2 Hik33参与集胞藻6803盐胁迫应答调控第30-31页
        1.3.3 Hik33参与集胞藻6803高渗透压胁迫应答调控第31页
        1.3.4 Hik33参与集胞藻6803氧化胁迫应答调控第31页
        1.3.5 Hik33参与集胞藻6803高光胁迫应答调控第31-32页
    1.4 集胞藻6803功能蛋白质组学研究进展第32-36页
        1.4.1 二维电泳偶联的肽指纹图谱(PMF)技术第32-34页
        1.4.2 鸟枪法蛋白质组学技术第34-35页
        1.4.3 集胞藻6803蛋白质组学研究第35-36页
    1.5 立题依据与研究内容第36-40页
        1.5.1 立题依据第36-37页
        1.5.2 研究内容第37-40页
第二章 集胞藻Hik33突变株功能蛋白质组学研究第40-62页
    2.1 引言第40页
    2.2 材料和方法第40-49页
        2.2.1 实验菌株第40-41页
        2.2.2 主要仪器设备第41页
        2.2.3 集胞藻6803的培养第41页
        2.2.4 集胞藻6803生长速率和细胞浓度的测定第41-42页
        2.2.5 集胞藻6803全基因组DNA的制备第42页
        2.2.6 集胞藻6803突变体的鉴定第42页
        2.2.7 集胞藻6803总蛋白、膜组分和可溶性组分蛋白的分离制备第42-43页
        2.2.8 蔗糖-尿素-SDS-PAGE凝胶制备及电泳第43-45页
        2.2.9 色素含量的测定第45页
        2.2.10 活细胞全光谱吸收扫描第45页
        2.2.11 蛋白质组学分析质谱样品制备第45-47页
        2.2.12 标记肽段质谱仪分析第47-48页
        2.2.13 质谱数据分析第48-49页
        2.2.14 生物信息学和统计学分析第49页
    2.3 结果与分析第49-60页
        2.3.1 Hik33缺失显著影响了集胞藻6803光自养生长第49-50页
        2.3.2 Hik33缺失导致突变株细胞内蛋白的差异表达第50-52页
        2.3.3 Hik33缺失突变体蛋白质组学分析流程第52-53页
        2.3.4 Hik33突变体细胞中差异表达蛋白质的定量鉴定第53-60页
    2.4 讨论第60-62页
第三章 Hik33调控机理分析第62-86页
    3.1 引言第62-63页
    3.2 材料和方法第63-65页
        3.2.1 实验菌株第63页
        3.2.2 主要仪器设备第63页
        3.2.3 集胞藻6803的培养第63页
        3.2.4 集胞藻6803生长速率和细胞浓度的测定第63页
        3.2.5 集胞藻6803总蛋白提取及western blot实验第63-64页
        3.2.6 蔗糖梯度离心分离集胞藻6803光合系统复合物第64-65页
        3.2.7 生物信息学分析第65页
    3.3 结果与分析第65-83页
        3.3.1 Hik33突变体细胞中显著下调蛋白分析第65-71页
        3.3.2 Hik33的缺失影响了碳代谢网络和氮同化系统蛋白的表达第71-74页
        3.3.3 Hik33的缺失显著影响了集胞藻6803中质粒来源蛋白的表达第74-75页
        3.3.4 Hik33广泛性的调节了集胞藻6803中应激反应蛋白的表达第75-79页
        3.3.5 Hik33调控的通用型应激响应(Common Stress-Responsive CSR)蛋白第79-83页
    3.4 讨论第83-86页
第四章 Hik33突变体还原性碳源的同化策略第86-102页
    4.1 引言第86页
    4.2 材料方法第86-89页
        4.2.1 实验菌株第86-87页
        4.2.2 主要仪器设备第87页
        4.2.3 集胞藻6803的培养第87页
        4.2.4 集胞藻6803生长速率和细胞浓度的测定第87页
        4.2.5 色素含量的测定第87页
        4.2.6 蛋白质组学分析质谱样品制备第87页
        4.2.7 标记肽段质谱仪分析第87页
        4.2.8 质谱数据分析第87页
        4.2.9 生物信息学和统计学分析第87页
        4.2.10 Glucose-6-Phosphate Dehydrogenase (G6PDH)活性的测定第87-89页
    4.3 结果与分析第89-99页
        4.3.1 葡萄糖显著提高Hik33突变体生长水平第89-90页
        4.3.2 葡萄糖培养条件下Hik33突变体的定量蛋白质组学分析第90-92页
        4.3.3 葡萄糖部分影响了Hik33敲除导致的功能蛋白质的差异表达第92-95页
        4.3.4 Hik33突变体上调OPP途经关键酶实现对葡萄糖的高效降解第95-99页
        4.3.5 Hik33高效降解和利用葡萄糖的通路模型第99页
    4.4 讨论第99-102页
第五章 Hik33突变体无机碳源的同化策略第102-114页
    5.1 引言第102页
    5.2 材料法法第102-103页
        5.2.1 实验菌株第102页
        5.2.2 主要仪器设备第102页
        5.2.3 集胞藻6803的培养第102-103页
        5.2.4 集胞藻6803生长速率和细胞浓度的测定第103页
        5.2.5 色素含量的测定第103页
        5.2.6 蛋白质组学分析质谱样品制备第103页
        5.2.7 标记肽段质谱仪分析第103页
        5.2.8 质谱数据分析第103页
        5.2.9 生物信息学和统计学分析第103页
    5.3 结果与分析第103-111页
        5.3.1 高浓度CO_2显著提高Hik33突变体生长水平第103-104页
        5.3.2 高浓度CO_2培养条件下,Hik33突变体的定量蛋白质组学分析第104-105页
        5.3.3 高浓度CO_2没有消除Hik33突变体的应急反应第105-108页
        5.3.4 Hik33突变体调控PetE和PetJ表达水平实现高CO_2浓度下快速生长第108-111页
    5.4 讨论第111-114页
全文总结与展望第114-118页
参考文献第118-134页
攻读学位期间发表论文第134-136页
致谢第136-138页
附录第138-188页
学位论文评阅及答辩情况表第188页

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