| 摘要 | 第6-7页 |
| 1 文献综述 | 第7-15页 |
| 1.1 miRNA的相关研究进展 | 第8-9页 |
| 1.1.1 miRNA的发现 | 第8页 |
| 1.1.2 miRNA的生物学特点 | 第8-9页 |
| 1.2 miRNA的生物合成及作用机制 | 第9-11页 |
| 1.2.1 miRNA的生物合成 | 第9-10页 |
| 1.2.2 miRNA的作用机制 | 第10-11页 |
| 1.3 miRNA的鉴定方法 | 第11-12页 |
| 1.3.1 传统克隆测序的方法鉴定miRNA | 第11页 |
| 1.3.2 传生物信息学方法鉴定miRNA | 第11页 |
| 1.3.3 高通量测序的方法鉴定miRNA | 第11-12页 |
| 1.4 托鲁巴姆植物生理学特征及其应用 | 第12-14页 |
| 1.4.1 托鲁巴姆在医药和农业方面应用 | 第12-13页 |
| 1.4.2 托鲁巴姆响应Cd毒害生理分子机制研究进展 | 第13-14页 |
| 1.5 本项目的研究背景及意义 | 第14-15页 |
| 2 利用Solexa技术对Cd胁迫托鲁巴姆miRNA的分离和鉴定 | 第15-27页 |
| 2.1 实验材料培养及胁迫处理培养 | 第15-16页 |
| 2.1.1 茄子托鲁巴姆的培养 | 第15页 |
| 2.1.2 托鲁巴姆Cd胁迫处理培养 | 第15-16页 |
| 2.2 植物总RNA的提取 | 第16-17页 |
| 2.2.1 提取RNA所用材料及试剂 | 第16页 |
| 2.2.2 提取RNA的方法 | 第16-17页 |
| 2.3 小RNA的分离 | 第17-18页 |
| 2.4 miRNA文库构建 | 第18-20页 |
| 2.4.1 样品制备流程 | 第19页 |
| 2.4.2 初级分析流程 | 第19页 |
| 2.4.3 高级分析流程 | 第19-20页 |
| 2.5 miRNA分析 | 第20-22页 |
| 2.5.1 miRNA鉴定 | 第20页 |
| 2.5.2 miRNA碱基偏好性分析 | 第20-21页 |
| 2.5.3 miRNA碱基编辑分析 | 第21-22页 |
| 2.6 miRNA家族分析 | 第22页 |
| 2.7 miRNA表达量分析 | 第22-24页 |
| 2.7.1 miRNA定量 | 第22页 |
| 2.7.2 miRNA表达量总体分布 | 第22-23页 |
| 2.7.3 miRNA样品间相关性比较 | 第23-24页 |
| 2.8 miRNA差异表达分析 | 第24-26页 |
| 2.8.1 小RNA提取 | 第24页 |
| 2.8.2 反转录为cDNA | 第24-26页 |
| 2.9 靶基因预测 | 第26-27页 |
| 3 实验结果和分析 | 第27-41页 |
| 3.1 Solexa测序结果初步统计 | 第27-29页 |
| 3.2 已知miRNA对Cd胁迫的响应 | 第29-32页 |
| 3.3 系统分析miRNA家族 | 第32-35页 |
| 3.4 miRNA表达谱分析 | 第35-36页 |
| 3.5 差异表达的miRNA靶基因功能的生物信息学分析 | 第36-37页 |
| 3.6 讨论 | 第37-41页 |
| 3.6.1 预测miRNA靶基因功能的多样性与保守性分析 | 第37-38页 |
| 3.6.2 讨论 | 第38-40页 |
| 3.6.3 总结 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-44页 |
| 附录1 软件列表 | 第44-45页 |
| 附录2 数据库列表 | 第45-46页 |
| Abstract | 第46页 |
| 致谢 | 第48页 |
