| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-30页 |
| 1.1 引言 | 第15-16页 |
| 1.2 生物信息学 | 第16-18页 |
| 1.2.1 基因电子克隆 | 第16页 |
| 1.2.2 基因表达分析 | 第16-17页 |
| 1.2.3 基因结构分析 | 第17页 |
| 1.2.4 生物信息学与基因功能分析 | 第17页 |
| 1.2.5 基因家族的进化分析 | 第17-18页 |
| 1.3 拟南芥脂类代谢过程 | 第18-25页 |
| 1.3.1 脂类代谢相关基因 | 第18-25页 |
| 1.3.2 脂类代谢转录因子 | 第25页 |
| 1.4 芸薹属脂类代谢相关基因和转录因子的研究进展 | 第25-26页 |
| 1.5 油体钙蛋白研究进展 | 第26-28页 |
| 1.5.1 油体 | 第26-27页 |
| 1.5.2 油体蛋白的结构 | 第27页 |
| 1.5.3 油体钙蛋白的鉴定及其功能 | 第27-28页 |
| 1.6 研究意义与内容 | 第28-30页 |
| 1.6.1 研究意义 | 第28-29页 |
| 1.6.2 研究内容 | 第29-30页 |
| 第二章 白菜脂类代谢基因及转录因子 | 第30-56页 |
| 2.1 引言 | 第30页 |
| 2.2 材料与方法 | 第30-32页 |
| 2.2.1 白菜脂类代谢基因和转录因子的鉴定 | 第30-31页 |
| 2.2.2 串联复制、部分复制及部分复制时间的推断 | 第31页 |
| 2.2.3 拟南芥在白菜中同源基因 | 第31页 |
| 2.2.4 多重对比及基因结构分析 | 第31页 |
| 2.2.5 脂类代谢基因的表达模式及统计分析 | 第31-32页 |
| 2.3 结果与分析 | 第32-53页 |
| 2.3.1 白菜基因组中脂类代谢基因及转录因子的鉴定 | 第32-38页 |
| 2.3.2 单个拟南芥基因对应的白菜同源基因数 | 第38-39页 |
| 2.3.3 白菜中脂类代谢基因及转录因子的复制 | 第39-43页 |
| 2.3.4 白菜型酰基脂类代谢基因及转录因子的表达模式 | 第43-53页 |
| 2.4 讨论 | 第53-55页 |
| 2.4.1 拟南芥与白菜脂类脂类代谢基因及转录因子的复制及进化 | 第53-54页 |
| 2.4.2 白菜中的脂类代谢基因 | 第54页 |
| 2.4.3 白菜中重要的脂类代谢基因及基因家族的研究 | 第54-55页 |
| 2.5 小结 | 第55-56页 |
| 第三章 甘蓝及甘蓝型油菜中脂类代谢基因及转录因子 | 第56-88页 |
| 3.1 引言 | 第56-57页 |
| 3.2 材料与方法 | 第57-59页 |
| 3.2.1 甘蓝及甘蓝型油菜中脂类代谢基因和转录因子的鉴定 | 第57-58页 |
| 3.2.2 串联复制、部分复制及部分复制时间的推断 | 第58页 |
| 3.2.3 甘蓝型油菜中脂类代谢基因和转录因子的鉴定 | 第58页 |
| 3.2.4 基因多重对比 | 第58页 |
| 3.2.5 表达模式分析和统计分析 | 第58-59页 |
| 3.3 结果与分析 | 第59-85页 |
| 3.3.1 甘蓝及甘蓝型油菜中脂类代谢基因及转录因子的鉴定 | 第59-69页 |
| 3.3.2 单个拟南芥基因在甘蓝中同源基因个数及脂类代谢基因的复制 | 第69-70页 |
| 3.3.3 甘蓝及甘蓝型油菜中脂类代谢基因的复制方式 | 第70-73页 |
| 3.3.4 甘蓝及甘蓝型油菜的表达模式 | 第73-75页 |
| 3.3.5 直系同源基因及旁系同源基因的表达分析 | 第75页 |
| 3.3.6 甘蓝型油菜古老脂类代谢基因的表达模式 | 第75-77页 |
| 3.3.7 甘蓝型油菜中脂类代谢基因表达模式的统计分析 | 第77-84页 |
| 3.3.8 甘蓝型油菜基因家族的表达分析 | 第84-85页 |
| 3.4 讨论 | 第85-87页 |
| 3.4.1 芸薹属中脂类代谢基因的复制及进化 | 第85-86页 |
| 3.4.2 基因家族的功能分析旁系同源与直系同源的表达模式分析 | 第86页 |
| 3.4.3 值得研究的重要基因 | 第86-87页 |
| 3.5 小结 | 第87-88页 |
| 第四章 拟南芥油体钙蛋白生物信息学分析 | 第88-102页 |
| 4.1 引言 | 第88页 |
| 4.2 材料与方法 | 第88-90页 |
| 4.2.1 拟南芥油体钙蛋白编码基因的鉴定及氨基酸序列分析 | 第88-89页 |
| 4.2.2 多重对比及进化树的构建 | 第89页 |
| 4.2.3 染色体定位及基因复制事件分析 | 第89-90页 |
| 4.2.4 拟南芥油体钙蛋白基因的启动子序列分析 | 第90页 |
| 4.2.5 拟南芥油体钙蛋白编码基因的表达模式分析 | 第90页 |
| 4.3 结果与分析 | 第90-99页 |
| 4.3.1 拟南芥油体钙蛋白的鉴定、分类及特性 | 第90-93页 |
| 4.3.2 拟南芥中油体钙蛋白的基序分析 | 第93-94页 |
| 4.3.3 拟南芥中油体钙蛋白的系统发生、染色体位置及复制方式分析 | 第94-96页 |
| 4.3.4 编码油体钙蛋白基因的启动子序列分析 | 第96-97页 |
| 4.3.5 拟南芥油体钙蛋白在不同组织中的表达模式 | 第97-98页 |
| 4.3.6 拟南芥油体钙蛋白在胁迫条件中的表达模式 | 第98-99页 |
| 4.4 讨论 | 第99-101页 |
| 4.4.1 拟南芥中的两类油体钙蛋白 | 第99-100页 |
| 4.4.2 拟南芥中油体钙蛋白的进化 | 第100页 |
| 4.4.3 拟南芥油体钙蛋白家族的扩张方式 | 第100页 |
| 4.4.4 拟南芥中油体钙蛋白可能与信号转导及脂类累积相关 | 第100-101页 |
| 4.5 小结 | 第101-102页 |
| 第五章 芸薹属植物及琴叶拟南芥油体钙蛋白生物信息学分析 | 第102-126页 |
| 5.1 引言 | 第102-103页 |
| 5.2 材料与方法 | 第103-106页 |
| 5.2.1 琴叶拟南芥和三种芸薹属植物中油体钙蛋白的鉴定及命名 | 第103-104页 |
| 5.2.2 油体钙蛋白理化性质分析 | 第104页 |
| 5.2.3 油体钙蛋白的多重对比、分类及进化分析 | 第104-105页 |
| 5.2.4 油体钙蛋白在染色体上的分布及复制方式 | 第105页 |
| 5.2.5 甘蓝型油菜基因上游顺势元件分析 | 第105页 |
| 5.2.6 表达模式分析 | 第105-106页 |
| 5.2.7 基因结构分析 | 第106页 |
| 5.3 结果与分析 | 第106-121页 |
| 5.3.1 琴叶拟南芥及三种芸薹属植物中的油体钙蛋白及其分类 | 第106-111页 |
| 5.3.2 琴叶拟南芥与三种芸薹属植物中油体钙蛋白的基序分析及理化特性 | 第111-112页 |
| 5.3.3 琴叶拟南芥与三种芸薹属植物中油体钙蛋白基因家族的扩张分析 | 第112-115页 |
| 5.3.4 十字花科植物中油体钙蛋白基因家族的进化分析 | 第115-116页 |
| 5.3.5 芸薹属植物中油体钙蛋白编码基因的表达分析 | 第116-118页 |
| 5.3.6 甘蓝型油菜中重要基因的顺式元件分析 | 第118-119页 |
| 5.3.7 油体钙蛋白的基因结构 | 第119-121页 |
| 5.4 讨论 | 第121-125页 |
| 5.4.1 十字花科中油体钙蛋白的进化 | 第121-122页 |
| 5.4.2 十字花科中的油体钙蛋白家族及其扩张的原因 | 第122-123页 |
| 5.4.3 十字花科油体钙蛋白中的重要基序 | 第123页 |
| 5.4.4 十字花科中油体钙蛋白的表达 | 第123-124页 |
| 5.4.5 甘蓝型油菜中重要油体钙蛋白的功能 | 第124-125页 |
| 5.5 小结 | 第125-126页 |
| 第六章 大豆、蚕豆及苜蓿中油体钙蛋白生物信息学分析 | 第126-144页 |
| 6.1 引言 | 第126-127页 |
| 6.2 材料与方法 | 第127-128页 |
| 6.2.1 三种豆科植物中的油体钙蛋白的鉴定及特点分析 | 第127页 |
| 6.2.2 多重对比及系统发生分析 | 第127页 |
| 6.2.3 油体钙蛋白编码基因的染色体定位及复制方式 | 第127-128页 |
| 6.2.4 油体钙蛋白的表达模式分析 | 第128页 |
| 6.3 结果与分析 | 第128-141页 |
| 6.3.1 三种豆科植物中油体钙蛋白的鉴定及分类 | 第128-130页 |
| 6.3.2 三种豆科植物中油体钙蛋白的特性分析及基序分析 | 第130-133页 |
| 6.3.3 三种豆科植物中油体钙蛋白的系统发生关系 | 第133页 |
| 6.3.4 三种豆科植物中油体钙蛋白编码基因的染色体定位及复制方式分析 | 第133-134页 |
| 6.3.5 三种豆科植物及拟南芥中油体钙蛋白编码基因的进化 | 第134-135页 |
| 6.3.6 三种豆科植物中油体钙蛋白在不同组织中的表达模式 | 第135-140页 |
| 6.3.7 豆科植物油体钙蛋白的顺式元件分析 | 第140-141页 |
| 6.4 讨论 | 第141-143页 |
| 6.4.1 大豆中的油体钙蛋白 | 第141页 |
| 6.4.2 三种豆科植物中的两类油体钙蛋白 | 第141-142页 |
| 6.4.3 三种豆科植物中油体钙蛋白家族的扩张模式 | 第142页 |
| 6.4.4 三种豆科植物及拟南芥中油体钙蛋白的进化分析 | 第142页 |
| 6.4.5 豆科中油体钙蛋白的表达分析 | 第142-143页 |
| 6.4.6 豆科重要的油体钙蛋白的功能预测 | 第143页 |
| 6.5 小结 | 第143-144页 |
| 第七章 结论、创新点与展望 | 第144-146页 |
| 7.1 结论 | 第144-145页 |
| 7.2 创新点 | 第145页 |
| 7.3 展望 | 第145-146页 |
| 参考文献 | 第146-159页 |
| 附录 | 第159-176页 |
| 附录1 白菜中部分复制基因及其发生时间 | 第159-165页 |
| 附录2 种子与叶片中差异表达的白菜脂类代谢基因及相关转录因子 | 第165-167页 |
| 附录3 在种子与花中差异表达的白菜脂类代谢基因及相关转录因子 | 第167-170页 |
| 附录4 在甘蓝型油菜种子及小孢子胚中特异表达的基因 | 第170-174页 |
| 附录5 在甘蓝型油菜种子及小孢子胚中特异表达的转录因子 | 第174-175页 |
| 附录6 甘蓝型油菜中逆境/愈伤组织中特异表达的基因及相关转录因子 | 第175-176页 |
| 缩略词 | 第176-177页 |
| 致谢 | 第177-178页 |
| 作者简介 | 第178页 |
