| 摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-16页 |
| 缩略语及专有词汇检索表 | 第16-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-56页 |
| 1 植物根际促生菌研究进展 | 第18-26页 |
| ·植物营养与土壤微生物 | 第18页 |
| ·植物根际促生菌 | 第18-19页 |
| ·根际促生菌促生机制 | 第19-26页 |
| ·直接促生作用 | 第20-24页 |
| ·间接促生作用 | 第24-26页 |
| 2 细菌中IAA的生物合成途径 | 第26-31页 |
| ·微生物合成IAA | 第27-28页 |
| ·细菌IAA生物合成途径 | 第28-30页 |
| ·吲哚-3-丙酮酸途径(Indole-3-pyruvate pathway,IPyA途径) | 第28页 |
| ·吲哚乙酰胺合成途径(Indole-3-acetamide pathway,IAM途径) | 第28-29页 |
| ·色胺途径(Tryptamine pathway,TAM途径) | 第29页 |
| ·吲哚-3-乙腈途径(Indole-3-acetonitrile pathway,IAN途径) | 第29-30页 |
| ·色氨酸侧链氧化酶途径(Tryptophan side-chain oxidase pathway,TSO途径) | 第30页 |
| ·非色氨酸依赖型途径(Tryptophan-independent pathway) | 第30页 |
| ·IAA结合和储藏 | 第30-31页 |
| 3 基于基因组的IAA生物合成关键基因的筛选 | 第31页 |
| 4 细菌IAA生物合成的影响因素 | 第31-33页 |
| ·IAA生物合成的环境调节因子 | 第31-33页 |
| ·IAA生物合成的遗传调节因子 | 第33页 |
| 5 革兰氏阳性菌的IAA合成 | 第33-35页 |
| 6 本研究的目的、意义和技术路线 | 第35-37页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第35-36页 |
| ·研究的技术路线图 | 第36-37页 |
| 参考文献 | 第37-56页 |
| 第二章 解淀粉芽孢杆菌SQR9促生效果研究 | 第56-70页 |
| 1 材料方法 | 第56-58页 |
| ·材料 | 第56页 |
| ·方法 | 第56-58页 |
| ·SQR9菌悬液制备 | 第56-57页 |
| ·试验设计 | 第57页 |
| ·测定项目 | 第57-58页 |
| 2 结果与分析 | 第58-63页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌对黄瓜和玉米株高的影响 | 第58-60页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌SQR9对黄瓜和玉米根系的影响 | 第60-62页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌SQR9对黄瓜和玉米生物量的影响 | 第62-63页 |
| 3 讨论 | 第63-64页 |
| 4 小结 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-70页 |
| 第三章 解淀粉芽孢杆菌SQR9主要促生机理的研究 | 第70-98页 |
| 1 材料方法 | 第71-77页 |
| ·材料 | 第71-73页 |
| ·方法 | 第73-77页 |
| ·基因组分析 | 第73页 |
| ·菌株种子液培养 | 第73页 |
| ·气体物质促生试验 | 第73-74页 |
| ·挥发性气体物质测定 | 第74页 |
| ·植酸酶活性检测 | 第74-75页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌SQR9产植物激素IAA的测定 | 第75-76页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌SQR9产赤霉素GAs测定 | 第76-77页 |
| 2 结果与分析 | 第77-84页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌SQR9基因组促生相关基因 | 第77页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌SQR9产生的挥发性气体物质对拟南芥生长的影响 | 第77-79页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌SQR9产半挥发性气体 | 第79-80页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌SQR9产植酸酶能力 | 第80-82页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌SQR9产植物激素IAA检测 | 第82-83页 |
| ·定量分析SQR9 IAA和GA_3产量曲线 | 第83-84页 |
| 3 讨论 | 第84-87页 |
| 4 小结 | 第87-90页 |
| 参考文献 | 第90-98页 |
| 第四章 解淀粉芽孢杆菌SQR9 IAA合成途径的研究 | 第98-140页 |
| 1 材料方法 | 第100-118页 |
| ·材料 | 第100-101页 |
| ·方法 | 第101-118页 |
| ·菌株种子液培养 | 第101页 |
| ·基因组分析筛选IAA相关功能基因 | 第101-102页 |
| ·细菌质粒、基因组和RNA的提取 | 第102页 |
| ·反转录分析 | 第102-104页 |
| ·基因的敲除 | 第104-110页 |
| ·突变子质粒pXKZ消除 | 第110页 |
| ·突变子IAA产量测定 | 第110页 |
| ·突变基因的互补及相关菌株的IAA产量 | 第110-112页 |
| ·可能的吲哚丙酮酸途径(IPyA)的途径的同源和异源表达 | 第112-116页 |
| ·蛋白提取和SDS-PAGE分析 | 第116-118页 |
| ·同源表达和异源表达菌株的IAA产量检测 | 第118页 |
| 2 结果与分析 | 第118-128页 |
| ·通过基因组分析的IAA合成相关基因 | 第118页 |
| ·转录结果分析 | 第118-119页 |
| ·相关基因的敲除 | 第119页 |
| ·基因敲除的突变子pXKZ的消除 | 第119-124页 |
| ·野生型SQR9与突变子的生长曲线测定 | 第124页 |
| ·突变子及相应的互补菌株与野生型SQR9产IAA的差异 | 第124-125页 |
| ·表达载体的构建及转化 | 第125-127页 |
| ·表达菌株蛋白差异分析 | 第127-128页 |
| ·同源和异源表达菌株IAA产量升高 | 第128页 |
| 3 讨论 | 第128-131页 |
| 4 小结 | 第131-134页 |
| 参考文献 | 第134-140页 |
| 第五章 采用转座子TnYLB-1构建解淀粉芽孢杆菌SQR9的突变体文库筛选IAA产量变化的突变株 | 第140-158页 |
| 1 材料方法 | 第140-146页 |
| ·材料 | 第140-141页 |
| ·方法 | 第141-146页 |
| ·菌株种子液培养 | 第141-142页 |
| ·细菌质粒和基因组的提取 | 第142页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞制备 | 第142-143页 |
| ·pMarA质粒的制备 | 第143页 |
| ·pMarA质粒转化SQR9 | 第143-144页 |
| ·转化子中质粒pXKZ的消除 | 第144-145页 |
| ·高温诱导pMarA质粒转座反应 | 第145页 |
| ·初步筛选IAA合成变化的突变体株 | 第145页 |
| ·初筛突变体株抗性验证 | 第145页 |
| ·IAA产量变化的突变子株复筛 | 第145页 |
| ·突变体转座位点分析 | 第145-146页 |
| 2 结果与分析 | 第146-153页 |
| ·pMarA质粒转入SQR9kz | 第146-148页 |
| ·转化子中质粒pXKZ的消除 | 第148-149页 |
| ·IAA合成变化突变菌株初筛以及初筛菌株抗性验证 | 第149-150页 |
| ·IAA合成变化的突变子复筛 | 第150-151页 |
| ·IAA合成变化的突变子株转座子插入位点分析 | 第151-153页 |
| 3 讨论 | 第153-154页 |
| 4 小结 | 第154-155页 |
| 参考文献 | 第155-158页 |
| 第六章 IAA合成变化对SQR9菌株促生作用的影响 | 第158-170页 |
| 1 材料方法 | 第158-160页 |
| ·材料 | 第158页 |
| ·方法 | 第158-160页 |
| ·菌株种子液培养 | 第158-159页 |
| ·突变子及过表达菌株植酸酶和气生物质的测定 | 第159页 |
| ·SQR9及IAA产量变化的菌株对黄瓜根系发育的影响 | 第159页 |
| ·LAA产量变化的菌株对黄瓜和玉米生长的影响 | 第159-160页 |
| ·测定项目 | 第160页 |
| 2 结果与分析 | 第160-165页 |
| ·不同浓度的IAA标准品对黄瓜根际发育的影响 | 第160-161页 |
| ·不同浓度的SQR9对黄瓜根际发育的影响 | 第161页 |
| ·IAA产量变化的菌株对黄瓜根际发育的影响 | 第161-162页 |
| ·IAA产量变化的菌株对黄瓜的促生效果 | 第162-164页 |
| ·IAA产量变化的菌株对玉米的促生效果 | 第164-165页 |
| 3 讨论 | 第165-166页 |
| 4 小结 | 第166-167页 |
| 参考文献 | 第167-170页 |
| 全文结论及展望 | 第170-172页 |
| 一 全文结论 | 第170-171页 |
| 二 展望 | 第171-172页 |
| 创新点 | 第172-174页 |
| 附录 | 第174-176页 |
| 博士期间发表及待发表论文 | 第176-178页 |
| 致谢 | 第178-179页 |
