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人类胚胎干细胞5-羟甲基胞嘧啶识别蛋白HMCES以及大肠杆菌单链DNA结合蛋白RecT的结构初探

摘要第1-7页
Abstract第7-14页
第一篇 人类胚胎干细胞5-羟甲基胞嘧啶识别蛋白 HMCES的结构初探第14-52页
 第一章 研究背景概述第14-20页
   ·表观遗传学简介第14-15页
   ·DNA的甲基化第15-16页
   ·DNA的去甲基化与5-羟甲基胞嘧啶第16-18页
   ·5hmC的识别蛋白HMCES第18-20页
 第二章 实验材料与方法第20-38页
   ·材料第20-22页
     ·质粒,菌类及酶类第20页
     ·试剂盒第20页
     ·试剂第20-22页
   ·仪器设备第22页
   ·方法第22-38页
     ·基因克隆和载体构建第22-29页
       ·引物设计第22-24页
       ·PCR扩增第24-25页
       ·目的基因片段鉴定回收,双酶切及连接载体第25-27页
       ·感受态细胞的制备第27页
       ·连接产物转化第27-28页
       ·挑单克隆和质粒抽提、鉴定第28-29页
     ·HMCES及HMCES-MBP蛋白的表达鉴定第29-30页
       ·转化Rosetta菌株第29页
       ·挑单克隆第29页
       ·保菌、取样、诱导和鉴定表达第29-30页
     ·HMCES-MBP蛋白纯化第30-32页
       ·扩大培养第30页
       ·诱导收菌破碎第30页
       ·Ni-NTA亲和柱纯化HMCES-MBP蛋白第30-31页
       ·TEV酶酶切除MBP助溶标签第31-32页
     ·HMCES蛋白纯化第32-34页
       ·扩大培养第32页
       ·诱导收菌破碎第32-33页
       ·Ni-NTA亲和柱纯化HMCES蛋白第33页
       ·HMCES蛋白浓缩第33页
       ·HMCES蛋白的Superdcx 200分子筛纯化第33-34页
     ·HMCES蛋白稳定降解片段的确定第34页
       ·质谱分析第34页
       ·二级结构预测第34页
       ·同源蛋白结构分析第34页
     ·HMCES-276蛋白纯化第34-35页
       ·HMCES-276的克隆第34-35页
       ·HMCES-276的表达第35页
       ·HMCES-276的纯化第35页
       ·HMCES-276的纯化优化第35页
     ·HMCES-276蛋白的晶体初筛第35-36页
       ·HMCES-276晶体初筛第35页
       ·HMCES-276晶体的捞取第35-36页
     ·分子排阻层析实验第36-38页
 第三章 实验结果与讨论第38-49页
   ·HMCES基因的克隆及质粒构建第38-40页
   ·HMCES及HMCES-MBP蛋白的表达鉴定第40页
   ·HMCES-MBP蛋白纯化第40-42页
     ·HMCES-MBP蛋白的Ni-NTA亲和柱纯化第40-41页
     ·TEV酶酶切HMCES-MBP第41-42页
   ·HMCES蛋白纯化第42-43页
     ·HMCES蛋白的Ni-NTA亲和柱纯化第42-43页
     ·HMCES蛋白的Superdex 200分子筛纯化第43页
   ·HMCES蛋白稳定降解片段的确定第43-46页
   ·HMCES-276蛋白的纯化第46-48页
     ·HMCES-276蛋白的Ni-NTA亲和柱纯化第46页
     ·HMCES-276的Superdex 200分子筛纯化第46-48页
   ·HMCES-276蛋白的晶体初筛第48-49页
 本篇小结第49-50页
 参考文献第50-52页
第二篇 的大肠杆菌单链DNA结合蛋白RecT的初步纯化第52-76页
 第一章 研究背景概述第52-58页
   ·DNA损伤修复简介第52页
   ·DNA重组修复简介第52-56页
     ·RecA第53页
     ·RecBCD第53-54页
     ·RecFOR第54-55页
     ·RecET第55-56页
   ·本篇拟解决的问题第56-58页
 第二章 实验材料与方法第58-66页
   ·材料第58页
   ·仪器设备第58页
   ·方法第58-66页
     ·基因克隆和载体构建第58-61页
       ·引物设计第58-60页
       ·PCR扩增第60-61页
       ·目的基因片段鉴定回收,双酶切及连接载体第61页
     ·RecT及RecT-MBP蛋白的表达鉴定第61页
       ·转化Rosetta菌株第61页
       ·挑单克隆第61页
       ·保菌、取样、诱导和鉴定表达第61页
     ·RecT-MBP蛋白的初步纯化第61-63页
       ·扩大培养第62页
       ·诱导收菌破碎第62页
       ·Ni-NTA亲和柱纯化RecT-MBP蛋白第62页
       ·TEV酶酶切除MBP助溶标签第62-63页
     ·RecT-MBP蛋白的进一步纯化第63页
       ·确定分离MBP的方法第63页
       ·QFF阴离子交换柱纯化第63页
       ·Superdex 200分子筛纯化第63页
     ·RecT的晶体初筛第63-64页
     ·RecT结晶优化第64页
     ·确定RecT蛋白的截短片段第64页
     ·RecT截短片段的纯化第64-65页
       ·RecT截短片段的克隆第64页
       ·RecT截短片段的表达第64页
       ·RecT-C的纯化第64-65页
     ·RecT-C的晶体初筛第65-66页
 第三章 实验结果与讨论第66-73页
   ·RecT基因的克隆及质粒构建第66页
   ·RecT及RecT-MBP蛋白的表达鉴定第66-67页
   ·RecT-MBP蛋白的初步纯化第67页
   ·RecT-MBP蛋白的进一步纯化第67-70页
     ·确定分离MBP的方法第67-68页
     ·QFF阴离子交换柱纯化第68-70页
     ·Superdex 200分子筛纯化第70页
   ·RecT的晶体初筛第70-71页
   ·RecT结晶优化第71页
   ·确定RecT蛋白的截短片段第71-72页
   ·RecT截短片段的纯化第72页
   ·RecT-C的晶体初筛第72-73页
 本篇小结第73-74页
 参考文献第74-76页
附录第76-82页
 附录1:实验室使用的未改造载体pET28a图谱及多克隆位点第76-79页
  实验室使用的改造载体pET28a图谱及多克隆位点第77-78页
  实验室普遍使用的未改造载体pET22b图谱及多克隆位点第78-79页
 附录2 酶切位点选择第79-80页
 附录3:实验过程使用的缓冲液配方第80-81页
 附录4:分子排阻层析实验过程第81-82页
致谢第82-83页

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