酸马奶瑞士乳杆菌AJT全基因组测序和分析
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 1 引言 | 第8-15页 |
| ·酸马奶 | 第8-11页 |
| ·酸马奶简述 | 第8-9页 |
| ·酸马奶食疗历史简述 | 第9页 |
| ·酸马奶的食疗作用 | 第9-11页 |
| ·瑞士乳杆菌 | 第11-12页 |
| ·瑞士乳杆菌的促进健康特性 | 第11页 |
| ·瑞士乳杆菌对传染病的预防和治疗 | 第11-12页 |
| ·微生物基因组学 | 第12-14页 |
| ·微生物基因组学的研究背景 | 第12页 |
| ·微生物基因组测序技术的发展 | 第12-13页 |
| ·微生物基因组学的应用 | 第13-14页 |
| ·研究的目的和意义 | 第14-15页 |
| 2 材料和方法 | 第15-20页 |
| ·材料 | 第15-16页 |
| ·菌株 | 第15页 |
| ·主要试剂 | 第15页 |
| ·主要培养基的配制 | 第15页 |
| ·主要仪器与设备 | 第15-16页 |
| ·方法 | 第16-20页 |
| ·测序菌株保存和复苏 | 第16页 |
| ·细菌全基因组的提取 | 第16页 |
| ·构建基因组DNA文库 | 第16-19页 |
| ·全基因组测序 | 第19-20页 |
| 3 结果与分析 | 第20-37页 |
| ·数据概况 | 第20-21页 |
| ·有效数据的碱基含量和质量分布情况 | 第21-24页 |
| ·基因组概况 | 第24-26页 |
| ·基因组大小估计 | 第24-25页 |
| ·组装安装 | 第25页 |
| ·组装结果评价 | 第25-26页 |
| ·基因组组分分析 | 第26-30页 |
| ·编码基因 | 第26-27页 |
| ·重复序列 | 第27-28页 |
| ·非编码RNA | 第28-29页 |
| ·基因岛(GIs) | 第29页 |
| ·前噬菌体(Prophage) | 第29-30页 |
| ·CRISPR | 第30页 |
| ·通用功能注释 | 第30-33页 |
| ·GO数据库注释 | 第30-32页 |
| ·KEGG数据库注释 | 第32页 |
| ·COG数据库注释 | 第32-33页 |
| ·比较基因组分析 | 第33-35页 |
| ·编码细菌素基因序列分析 | 第35-37页 |
| 4 讨论 | 第37页 |
| 5 结论 | 第37-39页 |
| 致谢 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-44页 |
| 作者简介 | 第44页 |
