| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 1.前言 | 第8-15页 |
| ·转座子 | 第8-11页 |
| ·反转录转座子 | 第9页 |
| ·SINEs是存在于真核生物的基因组序列中反转录转座子的一种 | 第9页 |
| ·SINEs来源以及组成结构 | 第9-10页 |
| ·SINEs在基因组中的功能 | 第10-11页 |
| ·生态型 | 第11-13页 |
| ·生态型的概念 | 第11页 |
| ·生态型的划分 | 第11-13页 |
| ·青藏高原的气候特征，植物分布特征以及适应性特征的介绍 | 第13-14页 |
| ·青藏高原拟南芥的发现以及生态型鉴定 | 第14-15页 |
| ·拟南芥作为植物模式种的特征 | 第14页 |
| ·青藏高原拟南芥的发现以及表型生境的描述 | 第14页 |
| ·已有拟南芥生态型鉴定的方法以及其优缺点的分析 | 第14-15页 |
| ·研究目的 | 第15页 |
| 2. 实验材料和方法 | 第15-28页 |
| ·实验材料 | 第15-16页 |
| ·实验方法 | 第16-24页 |
| ·全基因测序结果 | 第16页 |
| ·SINEs的存在与缺失统计 | 第16页 |
| ·拟南芥总DNA提取 | 第16-17页 |
| ·拟南芥总DNA检测 | 第17-18页 |
| ·SINEs的引物合成与PCR扩增 | 第18-22页 |
| ·纯化克隆目的片段 | 第22-24页 |
| ·数据分析 | 第24-28页 |
| ·测序结果 | 第24页 |
| ·将实验所得数据与全基因组所得数据相比较，探讨全基因测序的准确性 | 第24-25页 |
| ·获得能鉴定出拟南芥不同生态型的SINEs的分子标记组合 | 第25-28页 |
| 3.结果分析 | 第28-34页 |
| ·扩增结果 | 第28页 |
| ·西藏个体的实验所得序列与全基因组测序结果比较 | 第28页 |
| ·西藏个体的实验所得序列与其余19个拟南芥生态型相应SINEs的序列比较 | 第28-29页 |
| ·筛选出可以用来鉴定出不同拟南芥生态型的标记 | 第29-34页 |
| ·根据SINE片段的缺失筛选出8个分子标记区分8个拟南芥生态型 | 第29页 |
| ·根据SINEs在20个拟南芥生态型中的存在和缺失情况，筛选出两组可以区分出20个不同拟南芥生态型的组合 | 第29-34页 |
| 4.讨论 | 第34-39页 |
| ·拟南芥西藏个体是一个新的拟南芥生态型 | 第34-39页 |
| ·表型鉴定拟南芥西藏个体生态型 | 第34-35页 |
| ·海拔鉴定拟南芥西藏个体生态型 | 第35-36页 |
| ·系统进化树鉴定拟南芥西藏个体生态型 | 第36-37页 |
| ·SINEs鉴定拟南芥西藏个体生态型 | 第37-39页 |
| ·根据所得SINEs在每个生态型中的存在和缺失情况比较不同生态型之间的差异 | 第39页 |
| ·全基因组测序与实验验证 | 第39页 |
| 5.展望 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-44页 |
| 附录1 131 个SINEs在20个拟南芥生态型中的存在和缺失统计结果 | 第44-50页 |
| 附录2 实验补充30个SINEs扩增成功的西藏个体(Tibet)和哥伦比亚生态型（Col_0）序列 | 第50-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
