| 摘要 | 第7-9页 |
| abstract | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第11-19页 |
| 1.1 引言 | 第11-12页 |
| 1.2 赖草属植物介绍 | 第12-13页 |
| 1.2.1 赖草属简介及分类 | 第12-13页 |
| 1.2.2 地理分布与形态特征 | 第13页 |
| 1.2.3 根茎型克隆植物在天然草地中的重要性 | 第13页 |
| 1.3 赖草属和克隆植物研究进展以及赖草属植物的开发利用前景 | 第13-16页 |
| 1.3.1 赖草属基因应用研究进展 | 第13-15页 |
| 1.3.2 克隆植物的研究进展 | 第15-16页 |
| 1.3.3 赖草属植物的开发利用前景 | 第16页 |
| 1.4 RNA-Seq技术以及在牧草中的研究进展 | 第16-18页 |
| 1.4.1 RNA-Seq技术 | 第16-17页 |
| 1.4.2 RNA-Seq原理 | 第17页 |
| 1.4.3 RNA-Seq技术在根茎型植物研究中的应用 | 第17-18页 |
| 1.5 本研究目的及意义 | 第18-19页 |
| 第二章 赖草根茎发育形态解剖学研究 | 第19-25页 |
| 2.1 前言 | 第19页 |
| 2.2 实验材料与方法 | 第19-21页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第19-20页 |
| 2.2.2 实验方法 | 第20-21页 |
| 2.3 结果及分析 | 第21-23页 |
| 2.4 讨论 | 第23-25页 |
| 第三章 赖草根茎转录组测序 | 第25-42页 |
| 3.1 前言 | 第25页 |
| 3.2 实验材料与方法 | 第25-27页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第25页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第25-27页 |
| 3.3 结果生物信息学分析 | 第27-38页 |
| 3.3.1 测序结果概述 | 第27页 |
| 3.3.2 测序数据及其质量控制 | 第27页 |
| 3.3.3 转录组测序数据组装及评估 | 第27-30页 |
| 3.3.4 Unigene功能注释 | 第30页 |
| 3.3.5 基因表达量分析 | 第30-31页 |
| 3.3.6 差异表达分析 | 第31-34页 |
| 3.3.7 差异表达基因GO功能富集 | 第34-35页 |
| 3.3.8 差异表达基因COG分类 | 第35-36页 |
| 3.3.9 差异表达基因KEGG注释 | 第36-37页 |
| 3.3.10 差异表达基因KEGG通路富集分析 | 第37-38页 |
| 3.4 讨论 | 第38-42页 |
| 第四章 用实时荧光定量PCR对测序结果进行鉴定 | 第42-49页 |
| 4.1 前言 | 第42页 |
| 4.2 实验材料与方法 | 第42-45页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第42页 |
| 4.2.2 实验方法 | 第42-45页 |
| 4.3 结果及分析 | 第45-47页 |
| 4.3.1 提取的RNA样品 | 第45页 |
| 4.3.2 反转录结果检测 | 第45-46页 |
| 4.3.3 实时荧光定量PCR结果 | 第46-47页 |
| 4.4 讨论 | 第47-49页 |
| 第五章 结论与展望 | 第49-53页 |
| 5.1 结论 | 第49-50页 |
| 5.2 展望 | 第50-53页 |
| 参考文献 | 第53-61页 |
| 致谢 | 第61-63页 |
| 附录 | 第63页 |