立枯丝核菌AG-1的比较转录组和小RNA研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 第一章 综述 | 第11-22页 |
| 1 立枯丝核菌 | 第11-13页 |
| ·立枯丝核菌的病原学特征 | 第11页 |
| ·立枯丝核菌引起的危害与症状 | 第11-12页 |
| ·立枯丝核菌的侵染过程与致病因子 | 第12-13页 |
| 2 病原菌与寄主间的相互作用 | 第13-15页 |
| 3 转录组 | 第15-17页 |
| ·转录组简介 | 第15-16页 |
| ·真菌转录组研究 | 第16-17页 |
| 4 小RNA | 第17-20页 |
| ·小RNA简介 | 第17页 |
| ·小RNA的分类及特点 | 第17-19页 |
| ·小RNA的调节机制 | 第19页 |
| ·真菌小RNA研究 | 第19-20页 |
| 5 Illumina GA Ⅱ测序技术 | 第20-21页 |
| 6 本项研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 第二章 AG-1的比较转录组研究 | 第22-47页 |
| 1 材料 | 第22-24页 |
| ·供试植物材料 | 第22页 |
| ·纹枯病病原菌 | 第22页 |
| ·载体及宿主菌 | 第22页 |
| ·主要试剂 | 第22-24页 |
| ·主要仪器设备 | 第24页 |
| 2 试验方法 | 第24-32页 |
| ·材料处理 | 第24页 |
| ·致病性测定及侵染结构观察 | 第24页 |
| ·总RNA的提取 | 第24-25页 |
| ·Illumina GA Ⅱ测序 | 第25-27页 |
| ·目的基因的表达及功能验证 | 第27-32页 |
| 3 结果与讨论 | 第32-45页 |
| ·致病性测定及侵染过程和结构观察 | 第32-35页 |
| ·RNA提取电泳检测 | 第35页 |
| ·测序和序列拼接 | 第35-38页 |
| ·蛋白质编码区预测结果 | 第38-39页 |
| ·非编码RNA鉴定 | 第39-41页 |
| ·基因注释 | 第41页 |
| ·KOG分类 | 第41-42页 |
| ·与致病性相关蛋白分析 | 第42-44页 |
| ·分泌小蛋白的预测与比较 | 第44页 |
| ·目的基因的表达及功能验证 | 第44-45页 |
| 4 今后研究方向 | 第45-47页 |
| 第三章 小RNA研究 | 第47-62页 |
| 1 试验材料 | 第47页 |
| ·供试植物材料 | 第47页 |
| ·纹枯病病原菌 | 第47页 |
| ·主要试剂 | 第47页 |
| ·主要仪器设备 | 第47页 |
| 2 试验方法 | 第47-52页 |
| ·材料处理 | 第47页 |
| ·小RNA的提取 | 第47-48页 |
| ·cDNA合成 | 第48-49页 |
| ·Illumina GA Ⅱ测序 | 第49-52页 |
| 3 结果与讨论 | 第52-60页 |
| ·小分子RNA测序结果 | 第52页 |
| ·各时期小RNA特点 | 第52-54页 |
| ·各时期小RNA在基因组上的分布情况 | 第54-55页 |
| ·新miRNA的鉴定和分析 | 第55-58页 |
| ·已知miRNA分析 | 第58-60页 |
| 4 今后研究方向 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
| 附录 | 第73-88页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第88页 |
