| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-14页 |
| 第1章 绪论 | 第14-28页 |
| ·研究背景及意义 | 第14-17页 |
| ·研究现状及问题 | 第17-21页 |
| ·传统聚类方法及其应用 | 第17-18页 |
| ·子空间聚类方法及其应用 | 第18-20页 |
| ·双路聚类方法及其应用 | 第20-21页 |
| ·研究工作及特色 | 第21-27页 |
| ·研究问题及内容 | 第21-24页 |
| ·主要研究成果 | 第24-26页 |
| ·研究特色及创新 | 第26-27页 |
| ·论文结构 | 第27-28页 |
| 第2章 基因表达模式聚类分析方法概述 | 第28-59页 |
| ·基因表达数据获取与基因表达数据分析 | 第28-38页 |
| ·基因表达数据获取 | 第28-30页 |
| ·基因表达数据分析 | 第30-33页 |
| ·基因表达数据聚类分析 | 第33-36页 |
| ·基于基因本体的基因表达数据聚类分析 | 第36-38页 |
| ·聚类方法基础 | 第38-44页 |
| ·不同的聚类类型 | 第38-40页 |
| ·不同的簇类型 | 第40-41页 |
| ·基因表达模式相似性度量方法 | 第41-43页 |
| ·聚类有效性验证方法 | 第43-44页 |
| ·基因表达模式聚类分析方法研究进展 | 第44-56页 |
| ·聚类方法类型 | 第44-45页 |
| ·传统聚类方法 | 第45-48页 |
| ·模糊聚类方法 | 第48-50页 |
| ·子空间聚类方法 | 第50-52页 |
| ·双路聚类方法 | 第52-56页 |
| ·小结 | 第56-59页 |
| 第3章 单向叠加局部基因表达模式分析 | 第59-84页 |
| ·研究动机 | 第59-60页 |
| ·模糊硬子空间聚类方法 | 第60-67页 |
| ·硬子空间聚类算法：W-K-Means | 第60-62页 |
| ·模糊硬子空间聚类算法：模糊W-K-Means | 第62-67页 |
| ·实验结果及分析 | 第67-77页 |
| ·实验数据及实验设置 | 第68-69页 |
| ·模糊W-K-Means算法与FCM算法性能对比分析 | 第69-73页 |
| ·模糊W-K-Means算法挖掘局部叠加表达模式 | 第73-77页 |
| ·小结 | 第77-84页 |
| 第4章 双向叠加局部基因表达模式分析 | 第84-109页 |
| ·研究动机 | 第84-86页 |
| ·模糊软子空间聚类方法 | 第86-91页 |
| ·软子空间聚类算法：EWKM | 第86-88页 |
| ·模糊软子空间聚类算法：模糊EWKM | 第88-91页 |
| ·基因聚类有效性验证方法 | 第91-93页 |
| ·基于基因本体的聚类有效性验证 | 第92页 |
| ·基于基因共表达网络的聚类有效性验证 | 第92-93页 |
| ·实验结果及分析 | 第93-107页 |
| ·实验数据及实验设置 | 第93-95页 |
| ·基因聚类结果对比 | 第95-97页 |
| ·变量权重与局部表达模式分析 | 第97-101页 |
| ·共表达基因聚类关系分析 | 第101-107页 |
| ·小结 | 第107-109页 |
| 第5章 局部基因表达模式的可视分析及后处理 | 第109-127页 |
| ·研究动机 | 第109-110页 |
| ·局部基因表达模式的可视分析及后处理方法 | 第110-115页 |
| ·可变窗口方法 | 第110-112页 |
| ·后处理方法 | 第112-114页 |
| ·聚类有效性验证 | 第114-115页 |
| ·实验数据及参数设置 | 第115-117页 |
| ·实验数据及预处理 | 第115页 |
| ·实验参数设置 | 第115-116页 |
| ·噪声基因发现与清除 | 第116-117页 |
| ·可变窗口方法发现相似表达基因 | 第117-124页 |
| ·可变窗口方法确定局部表达模式边界 | 第119-122页 |
| ·可变窗口方法发现共同表达基因 | 第122-124页 |
| ·小结 | 第124-127页 |
| 结论 | 第127-129页 |
| 参考文献 | 第129-143页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文及其他成果 | 第143-147页 |
| 致谢 | 第147-149页 |
| 个人简历 | 第149页 |