| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 1 引言 | 第11-22页 |
| ·稻瘟病和稻瘟病菌 | 第11页 |
| ·Rab 蛋白家族 | 第11-15页 |
| ·蛋白质间相互作用研究方法 | 第15-21页 |
| ·基于“干”实验方法的预测 | 第15-18页 |
| ·同源映射分析法 | 第16页 |
| ·蛋白质亚细胞共定位预测 | 第16页 |
| ·结构域互作分析法 | 第16-17页 |
| ·基因注释分析法 | 第17页 |
| ·基因共表达 | 第17-18页 |
| ·基于“湿”实验的高通量蛋白互作对的验证 | 第18-21页 |
| ·酵母双杂系统 | 第18-20页 |
| ·免疫共沉淀技术 | 第20页 |
| ·GST 沉淀实验 | 第20-21页 |
| ·本课题的研究意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-31页 |
| ·生物信息学预测 | 第22-25页 |
| ·蛋白互作数据库 | 第22-23页 |
| ·MPID | 第22页 |
| ·SGD | 第22页 |
| ·BioGRID | 第22-23页 |
| ·IMEx | 第23页 |
| ·生物信息学分析软件 | 第23页 |
| ·方法 | 第23-25页 |
| ·MoYpt5 和 MoYpt7 进化分析 | 第23-24页 |
| ·MoYpt5 和 MoYpt7 蛋白互作对搜索 | 第24页 |
| ·数据库搜索和文献收集 | 第24页 |
| ·同源映射 | 第24页 |
| ·建立 MoYpt5 和 MoYpt7 蛋白质互作网络 | 第24-25页 |
| ·Cytoscape 制图软件的使用 | 第24页 |
| ·蛋白质互作网络模块分析 | 第24-25页 |
| ·蛋白质互作网络拓扑结构分析 | 第25页 |
| ·亚细胞内定为分析和结构域验证 | 第25页 |
| ·互作蛋白的亚细胞内定位分析 | 第25页 |
| ·结构域搜索和互作验证 | 第25页 |
| ·分子生物学实验验证 | 第25-31页 |
| ·主要试剂和实验材料 | 第25-27页 |
| ·供试菌株和质粒 | 第26页 |
| ·各种酶和试剂盒 | 第26页 |
| ·培养基 | 第26-27页 |
| ·实验方法 | 第27-31页 |
| ·PCR 和 PCR 产物回收 | 第27-28页 |
| ·质粒酶切和连接 | 第28-30页 |
| ·E.coli DH5α感受态细胞的制备和转化 | 第30页 |
| ·酵母感受态细胞制备及转化 | 第30-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-49页 |
| ·MoYpt5 和 MoYpt7 的生物信息学分析 | 第31-47页 |
| ·MoYpt5 和 MoYpt7 进化分析 | 第31-35页 |
| ·MoYpt5 和 MoYpt7 的假定互作蛋白 | 第35-36页 |
| ·MoYpt5 和 MoYpt7 的蛋白互作网络和亚细胞内定位 | 第36-38页 |
| ·MoYpt5 和 MoYpt7 的蛋白互作网络的模块聚类分析 | 第38-42页 |
| ·MoYpt5 和 MoYpt7 的蛋白互作网络的拓扑结构分析 | 第42-46页 |
| ·结构域搜索和互作验证 | 第46-47页 |
| ·假定互作蛋白的生物学验证 | 第47-49页 |
| ·AD 载体的构建 | 第47-48页 |
| ·酵母双杂验证 | 第48-49页 |
| 4 小结与讨论 | 第49-51页 |
| ·稻瘟病菌(M.oryzae) Rab 家族基因系统进化关系 | 第49-50页 |
| ·MoYpt5 和 MoYpt7 蛋白互作网络特性分析 | 第50页 |
| ·MoYpt5 和 MoYpt7 蛋白互作网络的验证 | 第50页 |
| ·MGG_07137 和 MGG_04143 与目标蛋白的互作关系 | 第50-51页 |
| 附录 | 第51-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
