Contents | 第1-10页 |
Abstract | 第10-15页 |
中文摘要 | 第15-19页 |
Chapter 1 Literature review | 第19-51页 |
·Virus and virus symptoms | 第19-20页 |
·Small parasites of plant viruses | 第20-27页 |
·Plant satRNAs | 第21-22页 |
·Plant satellite virus | 第22页 |
·DI RNAs | 第22-23页 |
·The relationship between the satRNA and the plant virus | 第23-26页 |
·The traditional explanation of satRNA-mediated symptom attenuation | 第26-27页 |
·RNA silencing | 第27-34页 |
·RNA silencing pathways in plants | 第28-32页 |
·Distinctions between miRNAs and siRNAs | 第32-33页 |
·AGOs | 第33-34页 |
·RNA silencing and plant-virus interactions | 第34-44页 |
·Viral counter defence mechanisms against RNA silencing | 第35-41页 |
·RNA silencing and viral disease development | 第41-44页 |
·Hypothesis and experimental strategies | 第44-47页 |
·Hypothesis | 第44-45页 |
·Experimental strategies | 第45-47页 |
·Experiment system | 第47-51页 |
·CMV and CMV satRNA | 第47-50页 |
·N.benthamiana and N. tabacum | 第50页 |
·The P19 and HcPrO | 第50-51页 |
Chapter 2 Introduction | 第51-53页 |
Chapter 3 Materials and methods | 第53-69页 |
·Plant materials and growth conditions | 第53页 |
·RNA extraction | 第53页 |
·DNase treatment of RNA sample | 第53-54页 |
·Semi-quantitative RT-PCR | 第54页 |
·Ball-bearing DNA extraction and PCR | 第54-55页 |
·Cloning and sequencing of PCR fragments for use as hybridization probes | 第55-58页 |
·Gel-purification | 第55页 |
·Ligation | 第55页 |
·Preparation of competent cells | 第55-56页 |
·Transformation of E. coli | 第56-57页 |
·Recombinant plasmid DNA extraction | 第57-58页 |
·Insert detection and sequencing | 第58页 |
·Plant expression vectors and Agrobacterium strains | 第58页 |
·Nicotiana transformation | 第58-60页 |
·Constructs | 第58-59页 |
·Triparental mating | 第59页 |
·Analysis of Agrobacterium transformants by diagnostic restriction enzyme digestion | 第59-60页 |
·Leaf disc transformation | 第60页 |
·Virus inoculation | 第60页 |
·Q-CMV strain | 第60-61页 |
·Q-CMV Y-Sat inoculum | 第61页 |
·Agrobacterium infiltration assay | 第61页 |
·GUS histochemical staining | 第61-62页 |
·GUS MUG assay analysis | 第62-63页 |
·Northern blot hybridization | 第63-65页 |
·RNA gel electrophoresis | 第63-64页 |
·Hybridization | 第64-65页 |
·Small RNA Northern blot hybridization | 第65-67页 |
·Small RNA Northern blot | 第65-66页 |
·Hybridization | 第66-67页 |
·RNA immunoprecipitation | 第67-68页 |
·Western blot | 第68-69页 |
Chapter 4 VSR-mediated inhibition of GUS silencing can be reversed by Y-Sat infection | 第69-87页 |
·Introduction | 第69-70页 |
·The experiment system | 第70页 |
·Results | 第70-85页 |
·P19 inhibits GUS silencing in uninfected N.benthamiana | 第70-74页 |
·Y-Sat infection reverses the P19-mediated suppression of GUS silencing | 第74-81页 |
·Y-Sat infection affects CMV 2b-mediated suppression of hpGUS-induced silencing | 第81-85页 |
·Discussion and conclusion | 第85-87页 |
·Discussion | 第85-86页 |
·Conclusion | 第86-87页 |
Chapter 5 The interference of VSR is due to sequestration of VSR protein by Y-Sat siRNAs | 第87-97页 |
·Introduction | 第87-88页 |
·Results | 第88-94页 |
·Stronger GUS silencing in the presence of Y-Sat is not due to an increase in hpGUS siRNA accumulation | 第88-91页 |
·Y-Sat-derived siRNAs bind to P19 to inhibit its function | 第91-94页 |
·Discussion and conclusion | 第94-97页 |
·Discussion | 第94-95页 |
·Conclusion | 第95-97页 |
Chapter 6 Y-Sat infection reverses the effects of helper virus VSR on miR168 expression | 第97-109页 |
·Introduction | 第97-98页 |
·Results | 第98-105页 |
·Virus infection and symptoms in N. benthamiana | 第98-99页 |
·miR68 expression in plants infected with subgroup ⅡCMV | 第99-100页 |
·RNA 4a level in Q-CMV-infected N. benthamiana plants | 第100-101页 |
·miR168 expression in N. benthamiana plants infected with subgroup I CMV | 第101-102页 |
·miR168 expression in P1/HcPro transgenic N. tabacum plants | 第102-105页 |
·Discussion and conclusion | 第105-109页 |
·Discussion | 第105-107页 |
·Conclusion | 第107-109页 |
Chapter 7 General discussion and conclusion | 第109-115页 |
·General discussion | 第109-112页 |
·satRNAs interfere with the suppressor function of VSRs on host small RNA-directed silencing | 第109-110页 |
·Y-Sat-mediated symptom attenuation is by reducing VSR caused interfering with miRNA | 第110-112页 |
·Conclusion | 第112-114页 |
·Future prospectives | 第114-115页 |
References | 第115-137页 |
Appendix 1 Sequences of probes used in Northern blot hybridization | 第137-139页 |
Appendix 2 Abbreviations of virus | 第139-141页 |
Appendix 3 Abbreviations | 第141-143页 |
Publications | 第143-145页 |
Acknowledgements | 第145-149页 |
附录Ⅰ 全文概要 | 第149-154页 |