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植物病毒卫星RNA干扰其辅助病毒致病性的分子机理

Contents第1-10页
Abstract第10-15页
中文摘要第15-19页
Chapter 1 Literature review第19-51页
   ·Virus and virus symptoms第19-20页
   ·Small parasites of plant viruses第20-27页
     ·Plant satRNAs第21-22页
     ·Plant satellite virus第22页
     ·DI RNAs第22-23页
     ·The relationship between the satRNA and the plant virus第23-26页
     ·The traditional explanation of satRNA-mediated symptom attenuation第26-27页
   ·RNA silencing第27-34页
     ·RNA silencing pathways in plants第28-32页
     ·Distinctions between miRNAs and siRNAs第32-33页
     ·AGOs第33-34页
   ·RNA silencing and plant-virus interactions第34-44页
     ·Viral counter defence mechanisms against RNA silencing第35-41页
     ·RNA silencing and viral disease development第41-44页
   ·Hypothesis and experimental strategies第44-47页
     ·Hypothesis第44-45页
     ·Experimental strategies第45-47页
   ·Experiment system第47-51页
     ·CMV and CMV satRNA第47-50页
     ·N.benthamiana and N. tabacum第50页
     ·The P19 and HcPrO第50-51页
Chapter 2 Introduction第51-53页
Chapter 3 Materials and methods第53-69页
   ·Plant materials and growth conditions第53页
   ·RNA extraction第53页
   ·DNase treatment of RNA sample第53-54页
   ·Semi-quantitative RT-PCR第54页
   ·Ball-bearing DNA extraction and PCR第54-55页
   ·Cloning and sequencing of PCR fragments for use as hybridization probes第55-58页
     ·Gel-purification第55页
     ·Ligation第55页
     ·Preparation of competent cells第55-56页
     ·Transformation of E. coli第56-57页
     ·Recombinant plasmid DNA extraction第57-58页
     ·Insert detection and sequencing第58页
   ·Plant expression vectors and Agrobacterium strains第58页
   ·Nicotiana transformation第58-60页
     ·Constructs第58-59页
     ·Triparental mating第59页
     ·Analysis of Agrobacterium transformants by diagnostic restriction enzyme digestion第59-60页
     ·Leaf disc transformation第60页
   ·Virus inoculation第60页
   ·Q-CMV strain第60-61页
   ·Q-CMV Y-Sat inoculum第61页
   ·Agrobacterium infiltration assay第61页
   ·GUS histochemical staining第61-62页
   ·GUS MUG assay analysis第62-63页
   ·Northern blot hybridization第63-65页
     ·RNA gel electrophoresis第63-64页
     ·Hybridization第64-65页
   ·Small RNA Northern blot hybridization第65-67页
     ·Small RNA Northern blot第65-66页
     ·Hybridization第66-67页
   ·RNA immunoprecipitation第67-68页
   ·Western blot第68-69页
Chapter 4 VSR-mediated inhibition of GUS silencing can be reversed by Y-Sat infection第69-87页
   ·Introduction第69-70页
   ·The experiment system第70页
   ·Results第70-85页
     ·P19 inhibits GUS silencing in uninfected N.benthamiana第70-74页
     ·Y-Sat infection reverses the P19-mediated suppression of GUS silencing第74-81页
     ·Y-Sat infection affects CMV 2b-mediated suppression of hpGUS-induced silencing第81-85页
   ·Discussion and conclusion第85-87页
     ·Discussion第85-86页
     ·Conclusion第86-87页
Chapter 5 The interference of VSR is due to sequestration of VSR protein by Y-Sat siRNAs第87-97页
   ·Introduction第87-88页
   ·Results第88-94页
     ·Stronger GUS silencing in the presence of Y-Sat is not due to an increase in hpGUS siRNA accumulation第88-91页
     ·Y-Sat-derived siRNAs bind to P19 to inhibit its function第91-94页
   ·Discussion and conclusion第94-97页
     ·Discussion第94-95页
     ·Conclusion第95-97页
Chapter 6 Y-Sat infection reverses the effects of helper virus VSR on miR168 expression第97-109页
   ·Introduction第97-98页
   ·Results第98-105页
     ·Virus infection and symptoms in N. benthamiana第98-99页
     ·miR68 expression in plants infected with subgroup ⅡCMV第99-100页
     ·RNA 4a level in Q-CMV-infected N. benthamiana plants第100-101页
     ·miR168 expression in N. benthamiana plants infected with subgroup I CMV第101-102页
     ·miR168 expression in P1/HcPro transgenic N. tabacum plants第102-105页
   ·Discussion and conclusion第105-109页
     ·Discussion第105-107页
     ·Conclusion第107-109页
Chapter 7 General discussion and conclusion第109-115页
   ·General discussion第109-112页
     ·satRNAs interfere with the suppressor function of VSRs on host small RNA-directed silencing第109-110页
     ·Y-Sat-mediated symptom attenuation is by reducing VSR caused interfering with miRNA第110-112页
   ·Conclusion第112-114页
   ·Future prospectives第114-115页
References第115-137页
Appendix 1 Sequences of probes used in Northern blot hybridization第137-139页
Appendix 2 Abbreviations of virus第139-141页
Appendix 3 Abbreviations第141-143页
Publications第143-145页
Acknowledgements第145-149页
附录Ⅰ 全文概要第149-154页

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