| Contents | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-15页 |
| 中文摘要 | 第15-19页 |
| Chapter 1 Literature review | 第19-51页 |
| ·Virus and virus symptoms | 第19-20页 |
| ·Small parasites of plant viruses | 第20-27页 |
| ·Plant satRNAs | 第21-22页 |
| ·Plant satellite virus | 第22页 |
| ·DI RNAs | 第22-23页 |
| ·The relationship between the satRNA and the plant virus | 第23-26页 |
| ·The traditional explanation of satRNA-mediated symptom attenuation | 第26-27页 |
| ·RNA silencing | 第27-34页 |
| ·RNA silencing pathways in plants | 第28-32页 |
| ·Distinctions between miRNAs and siRNAs | 第32-33页 |
| ·AGOs | 第33-34页 |
| ·RNA silencing and plant-virus interactions | 第34-44页 |
| ·Viral counter defence mechanisms against RNA silencing | 第35-41页 |
| ·RNA silencing and viral disease development | 第41-44页 |
| ·Hypothesis and experimental strategies | 第44-47页 |
| ·Hypothesis | 第44-45页 |
| ·Experimental strategies | 第45-47页 |
| ·Experiment system | 第47-51页 |
| ·CMV and CMV satRNA | 第47-50页 |
| ·N.benthamiana and N. tabacum | 第50页 |
| ·The P19 and HcPrO | 第50-51页 |
| Chapter 2 Introduction | 第51-53页 |
| Chapter 3 Materials and methods | 第53-69页 |
| ·Plant materials and growth conditions | 第53页 |
| ·RNA extraction | 第53页 |
| ·DNase treatment of RNA sample | 第53-54页 |
| ·Semi-quantitative RT-PCR | 第54页 |
| ·Ball-bearing DNA extraction and PCR | 第54-55页 |
| ·Cloning and sequencing of PCR fragments for use as hybridization probes | 第55-58页 |
| ·Gel-purification | 第55页 |
| ·Ligation | 第55页 |
| ·Preparation of competent cells | 第55-56页 |
| ·Transformation of E. coli | 第56-57页 |
| ·Recombinant plasmid DNA extraction | 第57-58页 |
| ·Insert detection and sequencing | 第58页 |
| ·Plant expression vectors and Agrobacterium strains | 第58页 |
| ·Nicotiana transformation | 第58-60页 |
| ·Constructs | 第58-59页 |
| ·Triparental mating | 第59页 |
| ·Analysis of Agrobacterium transformants by diagnostic restriction enzyme digestion | 第59-60页 |
| ·Leaf disc transformation | 第60页 |
| ·Virus inoculation | 第60页 |
| ·Q-CMV strain | 第60-61页 |
| ·Q-CMV Y-Sat inoculum | 第61页 |
| ·Agrobacterium infiltration assay | 第61页 |
| ·GUS histochemical staining | 第61-62页 |
| ·GUS MUG assay analysis | 第62-63页 |
| ·Northern blot hybridization | 第63-65页 |
| ·RNA gel electrophoresis | 第63-64页 |
| ·Hybridization | 第64-65页 |
| ·Small RNA Northern blot hybridization | 第65-67页 |
| ·Small RNA Northern blot | 第65-66页 |
| ·Hybridization | 第66-67页 |
| ·RNA immunoprecipitation | 第67-68页 |
| ·Western blot | 第68-69页 |
| Chapter 4 VSR-mediated inhibition of GUS silencing can be reversed by Y-Sat infection | 第69-87页 |
| ·Introduction | 第69-70页 |
| ·The experiment system | 第70页 |
| ·Results | 第70-85页 |
| ·P19 inhibits GUS silencing in uninfected N.benthamiana | 第70-74页 |
| ·Y-Sat infection reverses the P19-mediated suppression of GUS silencing | 第74-81页 |
| ·Y-Sat infection affects CMV 2b-mediated suppression of hpGUS-induced silencing | 第81-85页 |
| ·Discussion and conclusion | 第85-87页 |
| ·Discussion | 第85-86页 |
| ·Conclusion | 第86-87页 |
| Chapter 5 The interference of VSR is due to sequestration of VSR protein by Y-Sat siRNAs | 第87-97页 |
| ·Introduction | 第87-88页 |
| ·Results | 第88-94页 |
| ·Stronger GUS silencing in the presence of Y-Sat is not due to an increase in hpGUS siRNA accumulation | 第88-91页 |
| ·Y-Sat-derived siRNAs bind to P19 to inhibit its function | 第91-94页 |
| ·Discussion and conclusion | 第94-97页 |
| ·Discussion | 第94-95页 |
| ·Conclusion | 第95-97页 |
| Chapter 6 Y-Sat infection reverses the effects of helper virus VSR on miR168 expression | 第97-109页 |
| ·Introduction | 第97-98页 |
| ·Results | 第98-105页 |
| ·Virus infection and symptoms in N. benthamiana | 第98-99页 |
| ·miR68 expression in plants infected with subgroup ⅡCMV | 第99-100页 |
| ·RNA 4a level in Q-CMV-infected N. benthamiana plants | 第100-101页 |
| ·miR168 expression in N. benthamiana plants infected with subgroup I CMV | 第101-102页 |
| ·miR168 expression in P1/HcPro transgenic N. tabacum plants | 第102-105页 |
| ·Discussion and conclusion | 第105-109页 |
| ·Discussion | 第105-107页 |
| ·Conclusion | 第107-109页 |
| Chapter 7 General discussion and conclusion | 第109-115页 |
| ·General discussion | 第109-112页 |
| ·satRNAs interfere with the suppressor function of VSRs on host small RNA-directed silencing | 第109-110页 |
| ·Y-Sat-mediated symptom attenuation is by reducing VSR caused interfering with miRNA | 第110-112页 |
| ·Conclusion | 第112-114页 |
| ·Future prospectives | 第114-115页 |
| References | 第115-137页 |
| Appendix 1 Sequences of probes used in Northern blot hybridization | 第137-139页 |
| Appendix 2 Abbreviations of virus | 第139-141页 |
| Appendix 3 Abbreviations | 第141-143页 |
| Publications | 第143-145页 |
| Acknowledgements | 第145-149页 |
| 附录Ⅰ 全文概要 | 第149-154页 |