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花生根际土壤细菌群落结构分析

中文摘要第1-11页
Abstract第11-13页
1 前言第13-30页
   ·花生黄化病概述第13-16页
     ·花生黄化病发生原因第13-14页
     ·花生黄化病的防治第14-15页
       ·科学施肥第14页
       ·合理浇水,加强田间管理第14-15页
       ·化学手段第15页
     ·铁的生理机能和铁的生物有效性第15-16页
   ·铁载体及铁载体产生菌研究概述第16-18页
     ·铁载体的作用第16-17页
     ·植物根际铁载体产生菌的研究第17-18页
   ·细菌多样性概述第18-19页
   ·细菌多样性分析方法第19-26页
     ·环境基因组 16S rDNA 的 PCR 扩增第20-22页
     ·16S rDNA 文库第22-25页
     ·T-RFLP(Terminal restriction fragment length polymorphism)第25-26页
   ·生物群落多样性的测度第26-27页
     ·物种丰富度第26页
     ·物种多样性指数第26-27页
     ·物种均匀度指数第27页
   ·生物群落梯度分析第27-29页
     ·直接梯度分析第27页
     ·间接梯度分析(Indirect gradient analysis)第27-28页
     ·约束直接梯度分析(Constrained direct gradient analysis)第28-29页
       ·冗余分析第28页
       ·典型对应分析第28-29页
   ·本文选题依据及研究意义第29-30页
2 材料与方法第30-41页
   ·生化试剂第30页
   ·仪器设备第30页
   ·样品的采集第30-31页
   ·主要溶液及培养基的配制第31-32页
     ·LB(Luria-Bertani)培养基第31页
     ·氨苄青霉素(Amp)溶液第31页
     ·X-Gal 贮液第31页
     ·IPTG 贮液第31页
     ·铁载体检测(CAS 法)试剂第31-32页
   ·样品理化指标的测定第32页
   ·PCR 引物第32页
   ·样品总 DNA 的提取及 16S rDNA 的 PCR 扩增第32-33页
     ·样品总 DNA 的提取第32-33页
     ·16S rDNA 的 PCR 扩增第33页
     ·PCR 扩增的反应条件第33页
     ·PCR 扩增产物的纯化第33页
   ·T-RFLP 分析第33-34页
     ·荧光 PCR 产物的限制性酶切第33-34页
     ·酶切产物的基因扫描第34页
   ·16S rDNA 文库第34-36页
     ·PCR 产物的连接第34页
     ·E.coli DH5 感受态细胞的制备(氯化钙法)第34页
     ·转化第34-35页
     ·阳性克隆的筛选第35页
     ·ARDRA 分型第35-36页
   ·铁载体产生菌的检测及筛选第36-37页
     ·筛选铁载体产生菌第36页
     ·基因组 DNA 的提取第36-37页
     ·ARDRA 分型第37页
   ·数据分析第37-40页
     ·T-RFLP 分析第37-39页
       ·细菌群落多样性分析第37-38页
       ·去趋势对应分析(DCA)第38页
       ·典型对应分析(CCA)第38-39页
     ·16s rDNA 克隆文库分析第39-40页
       ·序列分析第39页
       ·文库统计数据分析第39-40页
   ·铁载体产生菌的 ARDRA 分析第40页
   ·核苷酸序列登录号第40-41页
3 结果与分析第41-57页
   ·花生根际土壤环境特征第41-42页
   ·T-RFLP 分析第42-46页
     ·样品的 T-RFLP 图谱分析第42-43页
     ·多样性指数分析第43页
     ·T-RFLP 图谱中主要片段的定性分析第43-44页
     ·基于 T-RFLP 的主成分分析第44-45页
     ·T-RFs 分布与根际土环境因子之间的关系(CCA 分析)第45-46页
   ·16S rDNA 克隆文库分析第46-53页
     ·文库的构建第46-48页
       ·阳性克隆子的验证第46-47页
       ·16S rDNA 扩增片段的 ARDRA 分型第47页
       ·嵌合体检测及库容的估算第47-48页
     ·基于 16S rDNA 克隆文库的细菌多样性分析第48-51页
       ·花生根际土壤细菌群落结构分析第48-51页
       ·基于 16S rDNA 文库的细菌多样性指数分析第51页
     ·土壤细菌群落与环境因子之间的关系(RDA 分析)第51-53页
   ·花生根际土壤中铁载体产生菌的遗传多样性分析第53-57页
4 讨论第57-61页
   ·花生根际土壤样品的理化性质第57页
   ·花生根际土细菌群落结构分析第57-60页
     ·花生根际土中铁载体产生菌的分析第57-58页
     ·花生根际细菌群落结构分析第58-60页
   ·细菌群落结构分析方法的比较第60-61页
5 结论第61-63页
   ·花生根际铁载体产生菌多样性第61页
   ·花生根际土壤中的细菌群落结构第61页
   ·花生土壤细菌群落结构的影响因素第61页
   ·分子生物学方法的比较第61-63页
参考文献第63-74页
附录第74-83页
致谢第83页

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