中文摘要 | 第1-11页 |
Abstract | 第11-13页 |
1 前言 | 第13-30页 |
·花生黄化病概述 | 第13-16页 |
·花生黄化病发生原因 | 第13-14页 |
·花生黄化病的防治 | 第14-15页 |
·科学施肥 | 第14页 |
·合理浇水,加强田间管理 | 第14-15页 |
·化学手段 | 第15页 |
·铁的生理机能和铁的生物有效性 | 第15-16页 |
·铁载体及铁载体产生菌研究概述 | 第16-18页 |
·铁载体的作用 | 第16-17页 |
·植物根际铁载体产生菌的研究 | 第17-18页 |
·细菌多样性概述 | 第18-19页 |
·细菌多样性分析方法 | 第19-26页 |
·环境基因组 16S rDNA 的 PCR 扩增 | 第20-22页 |
·16S rDNA 文库 | 第22-25页 |
·T-RFLP(Terminal restriction fragment length polymorphism) | 第25-26页 |
·生物群落多样性的测度 | 第26-27页 |
·物种丰富度 | 第26页 |
·物种多样性指数 | 第26-27页 |
·物种均匀度指数 | 第27页 |
·生物群落梯度分析 | 第27-29页 |
·直接梯度分析 | 第27页 |
·间接梯度分析(Indirect gradient analysis) | 第27-28页 |
·约束直接梯度分析(Constrained direct gradient analysis) | 第28-29页 |
·冗余分析 | 第28页 |
·典型对应分析 | 第28-29页 |
·本文选题依据及研究意义 | 第29-30页 |
2 材料与方法 | 第30-41页 |
·生化试剂 | 第30页 |
·仪器设备 | 第30页 |
·样品的采集 | 第30-31页 |
·主要溶液及培养基的配制 | 第31-32页 |
·LB(Luria-Bertani)培养基 | 第31页 |
·氨苄青霉素(Amp)溶液 | 第31页 |
·X-Gal 贮液 | 第31页 |
·IPTG 贮液 | 第31页 |
·铁载体检测(CAS 法)试剂 | 第31-32页 |
·样品理化指标的测定 | 第32页 |
·PCR 引物 | 第32页 |
·样品总 DNA 的提取及 16S rDNA 的 PCR 扩增 | 第32-33页 |
·样品总 DNA 的提取 | 第32-33页 |
·16S rDNA 的 PCR 扩增 | 第33页 |
·PCR 扩增的反应条件 | 第33页 |
·PCR 扩增产物的纯化 | 第33页 |
·T-RFLP 分析 | 第33-34页 |
·荧光 PCR 产物的限制性酶切 | 第33-34页 |
·酶切产物的基因扫描 | 第34页 |
·16S rDNA 文库 | 第34-36页 |
·PCR 产物的连接 | 第34页 |
·E.coli DH5 感受态细胞的制备(氯化钙法) | 第34页 |
·转化 | 第34-35页 |
·阳性克隆的筛选 | 第35页 |
·ARDRA 分型 | 第35-36页 |
·铁载体产生菌的检测及筛选 | 第36-37页 |
·筛选铁载体产生菌 | 第36页 |
·基因组 DNA 的提取 | 第36-37页 |
·ARDRA 分型 | 第37页 |
·数据分析 | 第37-40页 |
·T-RFLP 分析 | 第37-39页 |
·细菌群落多样性分析 | 第37-38页 |
·去趋势对应分析(DCA) | 第38页 |
·典型对应分析(CCA) | 第38-39页 |
·16s rDNA 克隆文库分析 | 第39-40页 |
·序列分析 | 第39页 |
·文库统计数据分析 | 第39-40页 |
·铁载体产生菌的 ARDRA 分析 | 第40页 |
·核苷酸序列登录号 | 第40-41页 |
3 结果与分析 | 第41-57页 |
·花生根际土壤环境特征 | 第41-42页 |
·T-RFLP 分析 | 第42-46页 |
·样品的 T-RFLP 图谱分析 | 第42-43页 |
·多样性指数分析 | 第43页 |
·T-RFLP 图谱中主要片段的定性分析 | 第43-44页 |
·基于 T-RFLP 的主成分分析 | 第44-45页 |
·T-RFs 分布与根际土环境因子之间的关系(CCA 分析) | 第45-46页 |
·16S rDNA 克隆文库分析 | 第46-53页 |
·文库的构建 | 第46-48页 |
·阳性克隆子的验证 | 第46-47页 |
·16S rDNA 扩增片段的 ARDRA 分型 | 第47页 |
·嵌合体检测及库容的估算 | 第47-48页 |
·基于 16S rDNA 克隆文库的细菌多样性分析 | 第48-51页 |
·花生根际土壤细菌群落结构分析 | 第48-51页 |
·基于 16S rDNA 文库的细菌多样性指数分析 | 第51页 |
·土壤细菌群落与环境因子之间的关系(RDA 分析) | 第51-53页 |
·花生根际土壤中铁载体产生菌的遗传多样性分析 | 第53-57页 |
4 讨论 | 第57-61页 |
·花生根际土壤样品的理化性质 | 第57页 |
·花生根际土细菌群落结构分析 | 第57-60页 |
·花生根际土中铁载体产生菌的分析 | 第57-58页 |
·花生根际细菌群落结构分析 | 第58-60页 |
·细菌群落结构分析方法的比较 | 第60-61页 |
5 结论 | 第61-63页 |
·花生根际铁载体产生菌多样性 | 第61页 |
·花生根际土壤中的细菌群落结构 | 第61页 |
·花生土壤细菌群落结构的影响因素 | 第61页 |
·分子生物学方法的比较 | 第61-63页 |
参考文献 | 第63-74页 |
附录 | 第74-83页 |
致谢 | 第83页 |