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近岸大肠杆菌多样性及其溯源研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
第1章 绪论第11-22页
   ·入海污染源第12-13页
   ·粪便污染的指示作用第13-14页
   ·粪便污染危害第14-15页
   ·粪便污染指示菌第15-16页
   ·近岸海水粪便污染的管理与问题第16-17页
   ·微生物源示踪技术第17-20页
     ·MST介绍第17-18页
     ·MST方法学的研究第18-19页
     ·MST技术的应用研究第19-20页
   ·重复性序列聚合酶链式反应(PCR OF REPETITIVE SEQUENCES,REP-PCR)第20-21页
   ·本论文的设计思想第21-22页
第2章 试验近岸海域的确定及其海水环境检测第22-30页
   ·材料和试剂第22-24页
     ·培养基第22-23页
     ·主要试剂第23页
     ·主要仪器第23-24页
   ·方法第24-25页
     ·大连近岸海域调研及试验海区的拟定第24页
     ·海水采样站位布置及样品采集第24页
     ·海水样品中粪大肠菌群的检测第24-25页
     ·海水样品中肠球菌的检测第25页
   ·结果与分析第25-28页
     ·大连近岸海域调研及试验海区的拟定第25-26页
     ·海水采样时间的确定第26-27页
     ·海水采样站位布置及样品采集第27页
     ·现场采样背景参数第27页
     ·金州湾海水样品中粪大肠菌群的检测结果与评价第27-28页
     ·金州湾海水样品中肠球菌的检测结果与评价第28页
   ·讨论第28-29页
   ·小结第29-30页
第3章 金州湾近岸海域海水中大肠杆菌多样性分析第30-37页
   ·材料和试剂第30-31页
     ·菌株第30页
     ·培养基第30页
     ·主要试剂第30-31页
     ·主要仪器第31页
   ·方法第31-33页
     ·大肠杆菌的分离培养第31-32页
     ·大肠杆菌的纯化第32页
     ·大肠杆菌的REP-PCR扩增第32页
     ·电泳第32-33页
     ·数据分析第33页
   ·结果与分析第33-35页
     ·大肠杆菌检测结果第33页
     ·大肠杆菌Rep-PCR电泳结果第33-34页
     ·数据分析第34-35页
   ·讨论第35页
   ·小结第35-37页
第4章 可疑粪便污染源大肠杆菌信息库的建立第37-50页
   ·材料和方法第37-39页
     ·菌株第37页
     ·培养基第37页
     ·主要试剂第37-38页
     ·主要仪器第38-39页
   ·可疑粪便污染源调查与粪便样品采集第39页
     ·可疑粪便污染源调查第39页
     ·采样准备第39页
     ·采样第39页
   ·样品处理第39页
   ·可疑粪便污染源大肠杆菌细菌库的建立第39-40页
     ·大肠杆菌的分离培养第39-40页
     ·大肠杆菌纯化第40页
     ·大肠杆菌的保存第40页
   ·可疑粪便污染源大肠杆菌REP-PCR指纹图谱库的建立第40-41页
     ·大肠杆菌的增菌第40页
     ·大肠杆菌总基因组DNA的提取第40页
     ·大肠杆菌总基因组DNA的质量鉴定第40-41页
     ·大肠杆菌REP-PCR扩增第41页
     ·电泳第41页
   ·可疑粪便污染源大肠杆菌数REP-PCR指纹数据据库的建立第41-42页
     ·可疑粪便污染源大肠杆菌REP-PCR指纹源数据库的建立第41-42页
     ·可疑粪便污染源大肠杆菌REP-PCR指纹数据库二元数据库的建立第42页
   ·可疑粪便污染源大肠杆菌数REP-PCR指纹数据据库的分析第42页
     ·可疑粪便污染源大肠杆菌REP-PCR指纹分布分析第42页
     ·可疑粪便污染源大肠杆菌REP-PCR指纹聚类分析第42页
   ·结果与分析第42-48页
     ·可疑粪便污染源调查与粪便样品采集第42-43页
     ·可疑粪便污染源大肠杆菌细菌库建立的结果第43-44页
     ·可疑粪便污染源大肠杆菌REP-PCR指纹图谱库第44-45页
     ·可疑粪便污染源大肠杆菌REP-PCR指纹数据库的建立第45页
     ·可疑粪便污染源大肠杆菌REP-PCR指纹数据库分析第45-48页
   ·讨论第48-49页
   ·小结第49-50页
第5章 金州湾近岸海域海水中粪便污染源示踪第50-58页
   ·实验方法第50-52页
     ·数据来源第50页
     ·应用软件第50页
     ·可疑粪便污染源大肠杆菌REP-PCR指纹数据库的判别模型建立第50-52页
     ·金州湾海水中大肠杆菌的判别第52页
   ·结果与分析第52-56页
     ·人源&非人源(鸡、猪、牛源)二元分类判别模型建立第52-54页
     ·人源&鸡源&猪源&牛源四元分类判别模型建立第54页
     ·金州湾海水中大肠杆菌的判别第54-56页
   ·讨论第56页
   ·小结第56-58页
结论第58-61页
参考文献第61-66页
附录1 海水多样性树状图第66-67页
附录2 人源大肠杆菌聚类分析第67-68页
附录3 鸡源大肠杆菌聚类分析第68-69页
附录4 猪源大肠杆菌聚类分析第69-70页
附录5 牛源大肠杆菌聚类分析第70-71页
附录6第71-73页
 附录6.1 四元分类判别组合表第71-72页
 附录6.2 四元分类判别组合表第72-73页
致谢第73页

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