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深海适冷菌Pseudoalteromonas sp. SM9913胞外多糖的结构、生态学功能及其生物合成基因簇的克隆与分析

目录第1-8页
CONTENTS第8-13页
符号说明及缩写词第13-15页
摘要第15-21页
ABSTRACT第21-28页
第一章 文献综述第28-54页
   ·多糖第30-35页
     ·多糖的分类第31-32页
     ·多糖的功能第32页
     ·多糖的应用第32-35页
   ·细菌的胞外多糖第35-40页
     ·细菌胞外多糖组成与结构第35-36页
     ·细菌胞外多糖的性质第36-37页
     ·胞外多糖的功能第37-38页
     ·几种重要的细菌胞外多糖第38-40页
   ·生物活性多糖的构效关系第40-45页
     ·生物活性多糖的结构层次第40-42页
     ·生物活性多糖结构与其生物活性的关系第42-45页
   ·细菌胞外多糖的生物合成及基因学研究第45-48页
     ·细菌胞外多糖的生物合成第45-47页
     ·细菌胞外多糖基因簇的研究第47-48页
   ·深海环境细菌胞外多糖的研究第48-52页
   ·本文工作开展思路及研究内容第52-54页
第二章 深海适冷菌Pseudoalteromonas sp.SM9913胞外多糖DS-EPS01的实验室规模发酵生产与分离纯化第54-69页
   ·材料和方法第55-60页
     ·实验菌株第55页
     ·主要材料、试剂与药品第55-56页
     ·主要仪器第56页
     ·培养基第56页
     ·DNS法还原糖标准曲线的制作第56-57页
     ·样品中还原糖的测定第57页
     ·苯酚-硫酸(Phenol-H_2SO_4)法总糖标准曲线的制作第57-58页
     ·样品中总糖和多糖的测定第58页
     ·培养温度和培养时间对P.sp.SM9913产EPS的影响第58页
     ·海水浓度对P.sp.SM9913产糖的影响第58页
     ·P.sp.SM9913胞外多糖的提取第58-59页
     ·P.sp.SM9913胞外多糖的分离纯化第59页
     ·胞外多糖的紫外-可见吸收光谱的测定第59页
     ·胞外多糖纯度的高效液相色谱(HPLC)分析第59页
     ·胞外多糖分子量的测定第59-60页
   ·实验结果第60-67页
     ·DNS法测定还原糖含量的标准曲线第60页
     ·Phenol-H_2SO_4法测定总糖含量的标准曲线第60-61页
     ·发酵温度和发酵时间对P.sp.SM9913产EPS的影响第61-63页
     ·海水浓度对P.sp.SM9913产EPS的影响第63页
     ·P.sp.SM9913产EPS的Sephadex G100层析分离第63-64页
     ·P.sp.SM9913产EPS的DEAE-Sepharose FastFlow层析分离第64-65页
     ·P.sp.SM9913胞外多糖DS-EPS01紫外-可见吸收光谱第65页
     ·P.sp.SM9913胞外多糖DS-EPS01纯度的HPLC分析第65-66页
     ·P.sp.SM9913胞外多糖DS-EPS01的分子量测定第66-67页
   ·讨论第67-68页
   ·本章小结第68-69页
第三章 深海适冷菌P.sp.SM9913胞外多糖DS-EPS01的结构解析第69-82页
   ·材料和方法第70-71页
     ·样品第70页
     ·试剂第70页
     ·主要仪器第70页
     ·DS-EPS01的红外光谱(IR)的测定第70页
     ·DS-EPS01的核磁共振(NMR)光谱的测定第70-71页
     ·DS-EPS01的HRMS(high resolution mass spectrometry)和甲基化分析第71页
   ·结果第71-79页
     ·胞外多糖DS-EPS01的红外光谱特征分析第71-72页
     ·胞外多糖DS-EPS01的NMR特征分析第72-76页
     ·胞外多糖DS-EPS01的HRMS特征分析第76-77页
     ·胞外多糖DS-EPS01的甲基化特征分析第77-78页
     ·胞外多糖DS-EPS01的结构总结第78-79页
   ·讨论第79-80页
   ·本章小结第80-82页
第四章 深海极端环境下P.sp.SM9913胞外多糖DS-EPS01的生态学功能第82-95页
   ·材料和方法第83-86页
     ·样品第83页
     ·试剂第83页
     ·主要仪器第83-84页
     ·蛋白酶活力测定第84页
     ·蛋白质含量测定方法第84页
     ·蛋白酶的分离纯化方法第84-85页
     ·胞外多糖DS-EPS01可显著提高适冷蛋白酶MCP-01热稳定性、有效阻止适冷蛋白酶MCP-01的自溶过程第85页
     ·胞外多糖DS-EPS01对金属离子的选择性鳌合作用第85页
     ·胞外多糖DS-EPS01对颗粒物的絮凝作用第85-86页
   ·结果第86-92页
     ·胞外多糖DS-EPS01对适冷蛋白酶MCP-01的热稳定性保护第86-87页
     ·胞外多糖DS-EPS01对适冷蛋白酶MCP-01的自溶过程的阻止第87-89页
     ·胞外多糖DS-EPS01对金属离子鳌合作用第89页
     ·胞外多糖DS-EPS01对颗粒物的絮凝作用第89-90页
     ·胞外多糖DS-EPS01生态学功能分析与深海极端环境下P.sp.SM9913生态响应机制模型第90-92页
   ·讨论第92-93页
   ·本章小结第93-95页
第五章 深海适冷菌P.sp.SM9913胞外多糖DS-EPS01生物合成基因簇的克隆与功能分析第95-114页
   ·材料第96-99页
     ·实验菌株及质粒第96页
     ·主要试剂与药品第96页
     ·培养基第96-97页
     ·试剂盒第97页
     ·工具酶第97页
     ·主要仪器设备第97页
     ·数据库及分析软件第97-98页
     ·主要溶液第98-99页
   ·主要方法第99-104页
     ·深海适冷菌P.sp.SM9913基因组DNA的提取第99页
     ·引物设计和寡核苷酸探针合成第99-100页
     ·PCR反应和琼脂糖电泳分析第100-101页
     ·DNA序列的测定第101页
     ·琼脂糖凝胶上回收目的基因DNA片段第101-102页
     ·质粒小量快速提取第102-103页
     ·E Coli感受态细胞的制备第103页
     ·化学转化第103页
     ·阳性克隆子的鉴定和保存第103页
     ·连接反应第103-104页
   ·深海适冷菌P.sp.SM9913胞外多糖DS-EPS01合成分泌相关基因簇的克隆及分析方法第104-106页
     ·胞外多糖DS-EPS01合成分泌相关基因簇的克隆方法第104-105页
     ·测序结果的比对,校正和定位分析及其装配拼接第105页
     ·胞外多糖生物合成基因簇全序列注释分析与物理图谱的绘制第105-106页
     ·胞外多糖DS-EPS01合成分泌相关基因簇的遗传分析方法第106页
   ·结果与讨论第106-112页
     ·深海适冷菌P.sp.SM9913胞外多糖生物合成基因簇的克隆第106-107页
     ·深海适冷菌P.sp.SM9913胞外多糖生物合成基因簇的功能注释与分析第107-109页
     ·深海适冷菌P.sp.SM9913胞外多糖生物合成机制分析第109-111页
     ·胞外多糖在P.sp.SM9913适应深海极端环境中的遗传机制分析第111-112页
   ·本章小结第112-114页
总结与展望.第114-117页
附录第117-135页
参考文献第135-149页
外文论文第149-181页
致谢第181-182页
攻读学位期间发表的学术论文第182-183页
学位论文评阅及答辩情况表第183页

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