| 中文摘要 | 第1-7页 |
| 英文摘要 | 第7-11页 |
| 缩略语表 | 第11-12页 |
| 前言 | 第12-18页 |
| 1 鼠疫耶尔森氏菌是烈性传染病——鼠疫的病原体 | 第12-13页 |
| 2 鼠疫菌的基因组多态性与分型 | 第13-14页 |
| 3 基因组多态性数据库及微生物法医学溯源 | 第14-17页 |
| 4 本研究的意义 | 第17-18页 |
| 第一部分 鼠疫菌基因组多态性实验 | 第18-89页 |
| 1 鼠疫菌基因组多态性靶标的选择 | 第18-32页 |
| 2 材料、试剂与主要仪器设备 | 第32-34页 |
| 3 实验操作步骤与结果处理 | 第34-69页 |
| 4 各类基因组多态性分析方法快速鉴定溯源能力的比较 | 第69-74页 |
| 5 基于 CRISPR 多态性的鼠疫菌微进化研究 | 第74-89页 |
| 第二部分 鼠疫菌基因组多态性数据库及相关软件的设计与构建 | 第89-139页 |
| 1 用户定位与需求分析 | 第89-93页 |
| 2 各模块的设计与实现 | 第93-120页 |
| 3 系统构成与运行流程 | 第120-134页 |
| 4 与其他软件溯源结果的比较 | 第134-139页 |
| 综述 CRISPRs：结构，功能与应用 | 第139-151页 |
| 参考文献 | 第151-159页 |
| 附录一 本研究所用菌株背景资料 | 第159-182页 |
| 附录二 MLVA 实验结果聚类图 | 第182页 |
| 附录三 程序代码与控件属性设置 | 第182-183页 |
| 个人简历 | 第183-184页 |
| 致谢 | 第184-185页 |