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联苯降解菌Achromobacter sp. BP3的分离鉴定及降解基因的克隆

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
符号与缩略语说明第10-11页
前言第11-12页
文献综述第12-28页
 第一章 芳香烃类化合物的污染及其生物降解第12-22页
  1.芳香烃类化合物的污染第12-14页
   ·芳香烃的来源第12-13页
   ·芳香烃的危害第13-14页
  2.芳香烃生物降解第14-22页
   ·芳香烃生物降解途径第14-15页
   ·芳香烃降解中的氧化酶第15-22页
 第二章 联苯生物降解研究进展第22-28页
  1.联苯概述第22页
  2.联苯的微生物降解第22-28页
   ·降解途径第23页
   ·基因组织结构第23-26页
   ·联苯2,3-双加氧酶(羟基化双加氧酶)第26-28页
实验部分第28-82页
 第三章 一株联苯降解菌的筛选、鉴定及其降解特性研究第28-40页
  1.材料与方法第28-31页
   ·培养基与试剂第28页
   ·联苯降解菌的分离第28-29页
   ·降解菌株的培养特征及生理生化鉴定第29页
   ·降解菌株的16S rDNA序列的测定和鉴定第29-30页
   ·降解菌株系统发育地位的确定第30页
   ·联苯含量的测定第30-31页
  2.结果与分析第31-39页
   ·石油污染土壤中联苯降解菌株的分离第31-32页
   ·降解菌株BP3的形态特征、生理生化特征及其鉴定第32-34页
   ·菌株BP3对抗生素的耐受性第34-35页
   ·菌株BP3的降解特性研究第35-39页
  3.小结第39-40页
 第四章 2,3-二羟基联苯1,2-双加氧酶基因的克隆及表达第40-66页
  1.材料与方法第40-46页
   ·培养基与试剂第40页
   ·菌株与质粒第40-41页
   ·菌体基因组DNA的提取,质粒DNA的提取第41页
   ·染色体DNA的部分酶切与酶切片段的回收第41-42页
   ·酶连及酶连产物的转化第42页
   ·阳性克隆的筛选第42页
   ·核苷酸序列的测定与序列分析第42-43页
   ·2,3-DHBP双加氧酶基因的PCR扩增及及高效表达载体的构建第43-44页
   ·SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析第44-45页
   ·酶活分析第45-46页
  2.结果与分析第46-65页
   ·菌株BP3的基因组DNA的部分酶切第46页
   ·基因组文库的构建及文库质量的检验第46-47页
   ·阳性克隆的筛选第47-49页
   ·阳性克隆的功能验证第49-50页
   ·序列测定及分析第50-59页
   ·DHBPDO基因的扩增及其在E.coli BL21(DE3)中的表达第59-63页
   ·菌株BP3中DHBPDO编码基因的比较分析第63-65页
  3.小结第65-66页
 第五章 联苯降解操纵子的克隆及联苯降解途径的推测第66-82页
  1.材料与方法第66-69页
   ·培养基与试剂第66页
   ·菌株与质粒第66-67页
   ·菌体基因组DNA和质粒DNA的提取第67页
   ·PCR扩增引物第67-68页
   ·PCR产物的TA克隆第68页
   ·序列分析第68-69页
  2.结果与分析第69-79页
   ·bph及xyl基因簇序列分析第69-78页
   ·菌株BP3联苯降解途径第78-79页
  3.小结第79-82页
全文总结第82-84页
参考文献第84-94页
附录一 文中所用培养基及试剂配方第94-96页
附录二 攻读硕士学位期间发表或已录用的论文第96-98页
致谢第98页

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