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大麦黄矮病毒三种株系的特异性检测及PAV株系的群体遗传变异

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第一章 前言第11-24页
   ·大麦黄矮病毒的生物学特性第11-14页
   ·大麦黄矮病毒的分子生物学特性第14-16页
   ·植物病毒的检测方法第16-17页
   ·植物病毒的分子群体遗传学第17-20页
   ·植物病毒分子群体遗传学的研究方法第20-22页
   ·本研究的目的和意义第22-23页
   ·本研究的技术路线第23-24页
第二章 地高辛标记的cDNA探针检测大麦黄矮病毒三种株系及流行规律分析第24-36页
   ·材料与方法第24-31页
     ·田间样品的采集第24页
     ·试剂和酶类第24页
     ·病毒RNA的提取第24-25页
     ·提取的RNA含量测定第25页
     ·引物的设计与合成第25页
     ·RT-PCR扩增第25-26页
     ·DNA片段的回收纯化第26-27页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第27页
     ·目的片段与克隆载体连接第27页
     ·连接产物转化感受态细胞第27-28页
     ·重组克隆的菌落PCR鉴定第28页
     ·重组克隆的酶切鉴定第28-29页
     ·地高辛标记的探针制备第29页
     ·点杂交第29-31页
   ·结果与分析第31-35页
     ·RT-PCR扩增结果第31页
     ·地高辛探针的获得第31-32页
     ·地高辛探针的特异性与灵敏性第32-33页
     ·点杂交检测田间小麦样品第33-34页
     ·BYDV株系的分布与流行第34-35页
   ·讨论第35-36页
第三章 大麦黄矮病毒GAV株系、PAV株系CP基因的序列分析第36-44页
   ·材料与方法第36-37页
     ·田间样品的采集第36页
     ·试剂和酶类第36页
     ·载体与菌株第36页
     ·引物设计第36页
     ·生物学验证与蚜传分离第36-37页
     ·RT-PCR及其产物的克隆和鉴定第37页
     ·DNA序列测定及分析第37页
   ·结果与分析第37-43页
     ·蚜传生物学测定结果第37-38页
     ·RT-PCR结果第38-39页
     ·BYDV-GAV CP基因序列测定及比较分析第39-41页
     ·BYDV-PAV CP基因序列测定及比较分析第41-43页
   ·讨论第43-44页
第四章 大麦黄矮病毒PAV株系的群体遗传变异第44-54页
   ·材料与方法第44-46页
     ·酶与试剂第44页
     ·田间样品的采集与来源第44页
     ·生物学验证与蚜传分离第44页
     ·基因组克隆与序列测定第44-45页
     ·群体遗传变异与选择压力分析第45页
     ·系统进化分析与传播途径推测第45-46页
   ·结果与分析第46-51页
     ·生物学验证与蚜传分离结果第46-47页
     ·RT-PCR检测与鉴定第47页
     ·基因组克隆与序列分析第47-48页
     ·病毒群体在选择压力下的进化模式分析第48-49页
     ·群体遗传变异与系统进化分析第49-51页
     ·群体遗传多样性分析第51页
     ·BYDV-PAV在我国的起源与传播扩散路径推测第51页
   ·讨论第51-54页
     ·我国BYDV-PAV群体符合准种遗传结构特征第51-52页
     ·病毒遗传多样性和基因功能间的关系第52页
     ·我国BYDV-PAV群体具有复杂的遗传结构第52-53页
     ·病毒遗传进化分析中揭示的分子流行病学规律第53-54页
参考文献第54-59页
附录1 本研究使用的试剂和溶液的配制第59-60页
附录2 本研究使用的实验仪器第60-61页
附录3 BYDV-GAV株系的CP基因序列比对结果第61-65页
附录4 BYDV-PAV株系的CP基因序列比对结果第65-69页
附录5 本研究在Genbank中的登录的BYDV-PAV序列第69-70页
附录6 本研究引用的用于序列比对与聚类分析的相关序列第70-71页
缩略词表第71-72页
致谢第72-73页
作者简历第73页

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