| 中文摘要 | 第1-10页 |
| 英文摘要 | 第10-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-29页 |
| 1. 鲍遗传育种研究进展 | 第14-16页 |
| ·选择育种 | 第14页 |
| ·杂交育种 | 第14-15页 |
| ·多倍体育种 | 第15页 |
| ·雌核发育 | 第15-16页 |
| ·基因工程 | 第16页 |
| 2. 鲍分子遗传标记研究进展 | 第16-23页 |
| ·线粒体 DNA 研究 | 第17-18页 |
| ·限制性片段长度多态性 | 第18-19页 |
| ·可变数目串联重复序列 | 第19-20页 |
| ·随机扩增多态性 DNA | 第20页 |
| ·扩增片段长度多态性 | 第20-21页 |
| ·简单序列重复标记 | 第21-22页 |
| ·表达序列标签研究 | 第22-23页 |
| 3. 海洋贝类微卫星标记的开发与应用 | 第23-29页 |
| ·微卫星标记的起源和分类 | 第23页 |
| ·微卫星标记的突变机制 | 第23-24页 |
| ·海洋贝类微卫星标记的分离 | 第24页 |
| ·微卫星分析存在的问题 | 第24-26页 |
| ·海洋贝类微卫星在遗传育种中的应用 | 第26-29页 |
| ·种群遗传多样性分析 | 第26页 |
| ·养殖种群的遗传多样性监测 | 第26-27页 |
| ·微卫星 DNA 在亲缘关系鉴定中的应用 | 第27-28页 |
| ·遗传图谱构建 | 第28-29页 |
| 第二章 皱纹盘鲍微卫星DNA 标记的分离 | 第29-38页 |
| 引言 | 第29-30页 |
| 1. 材料与方法 | 第30-34页 |
| ·皱纹盘鲍 ESTs 中微卫星序列的筛选 | 第30页 |
| ·微卫星引物设计 | 第30页 |
| 1. 3 实验材料及模板 DNA 的提取 | 第30-32页 |
| ·DNA 提取所用试剂 | 第30页 |
| ·DNA 提取流程 | 第30-32页 |
| ·DNA 模板浓度与纯度检测 | 第32页 |
| ·PCR 扩增与电泳检测和筛选 | 第32-33页 |
| ·PCR 扩增反应体系与条件 | 第32页 |
| ·PCR 产物电泳检测和条带判读 | 第32-33页 |
| ·胶的制备和电泳 | 第32-33页 |
| ·银染 | 第33页 |
| ·数据分析与位点评价 | 第33-34页 |
| ·微卫星位点统计参数计算公式 | 第33-34页 |
| ·统计分析软件 | 第34页 |
| 2. 结果 | 第34-37页 |
| ·从 ESTs 数据库中筛选微卫星序列与引物设计 | 第34页 |
| ·EST-SSRs 遗传特性分析 | 第34-37页 |
| 3. 讨论 | 第37-38页 |
| 第三章 皱纹盘鲍线粒体的遗传模式研究 | 第38-44页 |
| 引言 | 第38页 |
| 1. 材料与方法 | 第38-41页 |
| ·单对交配皱纹盘鲍家系获得 | 第38-39页 |
| ·DNA 模板提取 | 第39-40页 |
| ·PCR 扩增 | 第40页 |
| ·PCR 扩增所用引物 | 第40页 |
| ·PCR 反应体系与条件 | 第40页 |
| ·DGGE 电泳分析 | 第40-41页 |
| 2. 结果与讨论 | 第41-44页 |
| ·变性梯度凝胶电泳原理与应用 | 第41页 |
| ·线粒体 COI 基因扩增 | 第41-43页 |
| ·皱纹盘鲍线粒体遗传模式判定 | 第43-44页 |
| 第四章 皱纹盘鲍野生群体的遗传多样性与遗传结构 | 第44-68页 |
| 引言 | 第44-45页 |
| 第一节 皱纹盘鲍野生群体的微卫星分析 | 第45-58页 |
| 1. 材料与方法 | 第45-48页 |
| ·试验材料 | 第45页 |
| ·DNA 提取与 SSR 扩增 | 第45-46页 |
| ·DNA 提取 | 第45-46页 |
| ·PCR 反应条件 | 第46页 |
| ·数据分析 | 第46-48页 |
| ·微卫星位点统计参数计算公式 | 第46-47页 |
| ·统计分析软件 | 第47-48页 |
| 2. 结果 | 第48-55页 |
| ·7 个位点在 5 个皱纹盘鲍野生群体中多态性 | 第48页 |
| ·群体遗传多样性分析 | 第48-49页 |
| ·哈迪·温博格平衡检验 | 第49页 |
| ·群体遗传分化 | 第49-55页 |
| ·群体间基因频率异质性 | 第49-52页 |
| ·群体遗传结构 | 第52页 |
| ·遗传距离与邻接对位树的构建 | 第52-54页 |
| ·个体在群体间分配检测 | 第54-55页 |
| ·地理隔绝模式检测 | 第55页 |
| 3. 讨论 | 第55-58页 |
| ·微卫星标记在遗传多样性检测的评价 | 第55页 |
| ·5 个皱纹盘鲍野生群体遗传多样性与分化 | 第55-56页 |
| ·哈迪·温博格平衡 | 第56-58页 |
| 第二节 皱纹盘鲍野生群体的线粒体 DNA 分析 | 第58-68页 |
| 1. 材料与方法 | 第58-59页 |
| ·试验材料 | 第58页 |
| ·DNA 模板提取、PCR 扩增与产物回收 | 第58页 |
| ·数据分析 | 第58-59页 |
| ·线粒体 DNA 统计参数计算公式 | 第58-59页 |
| ·统计分析所有软件 | 第59页 |
| 2. 结果 | 第59-67页 |
| ·PCR 扩增，产物纯化和测序 | 第59页 |
| ·COI 序列长度和变异 | 第59-63页 |
| ·COI 序列碱基分析 | 第59-60页 |
| ·变异位点与单倍型分析 | 第60-63页 |
| ·群体遗传多样性与遗传分化分析 | 第63-64页 |
| ·群体遗传多样性 | 第63页 |
| ·群体遗传分化 | 第63-64页 |
| ·聚类分析 | 第64-67页 |
| 3. 讨论 | 第67-68页 |
| 第五章 皱纹盘鲍养殖群体的遗传学研究 | 第68-101页 |
| 引言 | 第68-69页 |
| 第一节 皱纹盘鲍养殖群体的遗传多样性与分化 | 第69-78页 |
| 1. 材料与方法 | 第69-71页 |
| ·供试样品 | 第69-70页 |
| ·DNA 模板提取和 PCR 扩增 | 第70页 |
| ·数据分析 | 第70-71页 |
| 2. 结果 | 第71-76页 |
| ·遗传多样性 | 第71-74页 |
| ·群体遗传分化 | 第74-76页 |
| 3. 讨论 | 第76-78页 |
| 第二节 皱纹盘鲍养殖群体的有效亲本数量研究 | 第78-94页 |
| 1. 材料与方法 | 第78-80页 |
| ·家系的建立 | 第78-79页 |
| ·亲鲍和子代 DNA 提取 | 第79页 |
| ·微卫星扩增 | 第79页 |
| ·统计分析 | 第79-80页 |
| 2. 结果 | 第80-90页 |
| ·亲本与子代基因型分析 | 第80页 |
| ·7 个位点在4 个家系中遗传多样性以及个体识别能力 | 第80-88页 |
| ·遗传多样性 | 第81-85页 |
| ·7 个位点个体识别能力 | 第85-88页 |
| ·有效亲本分析 | 第88-90页 |
| 3. 讨论 | 第90-94页 |
| 第三节 苗种培育过程中皱纹盘鲍养殖群体的遗传学变化 | 第94-101页 |
| 1. 材料与方法 | 第94-95页 |
| ·家系的建立 | 第94页 |
| ·DNA 提取和微卫星扩增 | 第94页 |
| ·统计分析 | 第94-95页 |
| 2 结果 | 第95-99页 |
| ·遗传多样性分析 | 第95页 |
| ·不同发育时期基因型变化与等位基因频率分布 | 第95-96页 |
| ·瓶颈效应分析 | 第96-99页 |
| ·皱纹盘鲍养殖家系在不同发育时期遗传分化 | 第99页 |
| 3. 讨论 | 第99-101页 |
| 参考文献 | 第101-117页 |
| 就读期间发表与已整理论文 | 第117-118页 |
| 致谢 | 第118页 |