| 缩写词(Abbreviation) | 第1-10页 |
| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 前言 | 第14-16页 |
| 第一部分 应用微卫星标记对金华猪群体遗传结构的研究 | 第16-68页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-32页 |
| 第一节 分子标记的种类及其研究进展 | 第16-21页 |
| 1.RFLP标记 | 第16-17页 |
| 2.RAPD标记 | 第17-18页 |
| 3.SSR标记 | 第18页 |
| 4.AFLP标记 | 第18页 |
| 5.mtDNA标记 | 第18-19页 |
| 6.SNP标记 | 第19-21页 |
| 第二节 微卫星的研究进展 | 第21-27页 |
| 1.微卫星的结构 | 第21-22页 |
| 2.微卫星的遗传特性 | 第22页 |
| 3.微卫星的多态性及定位 | 第22-23页 |
| 4.微卫星的进化机制 | 第23-24页 |
| 5.微卫星标记在遗传育种研究中的应用 | 第24-27页 |
| 第三节.基因组扫描的基本原理和方法 | 第27-32页 |
| 1.基因组扫描的基本原理 | 第27-28页 |
| 2.数据的收集与分析 | 第28-32页 |
| 第二章 材料与方法 | 第32-46页 |
| 第一节 实验材料 | 第32-37页 |
| 1.实验动物 | 第32页 |
| 2.实验试剂 | 第32页 |
| 3.主要仪器 | 第32-33页 |
| 4.主要试剂配制 | 第33-34页 |
| 5.微卫星引物 | 第34-37页 |
| 第二节 实验方法 | 第37-46页 |
| 1.哺乳动物血样基因组DNA的提取 | 第37页 |
| 2.PCR反应体系和条件 | 第37页 |
| 3.利用ABI377测序仪进行微卫星PCR扩增产物的检测分析 | 第37-38页 |
| 4.统计方法 | 第38-44页 |
| 5.基于与微卫星连锁程度精细定位猪肉肉质候选基因SIM1 | 第44-46页 |
| 第三章 实验结果与讨论 | 第46-68页 |
| 第一节 结果与分析 | 第46-61页 |
| 1.基因组DNA的提取 | 第46页 |
| 2.微卫星DNA的PCR扩增 | 第46-47页 |
| 3.微卫星DNA的分型 | 第47-48页 |
| 4.微卫星等位基因大小、频率及分布 | 第48-50页 |
| 5.微卫星座位的遗传多样性 | 第50-54页 |
| 6.金华猪亚群体间及其与国内其它猪种间遗传分化 | 第54页 |
| 7.金华猪亚群体间遗传距离计算及聚类分析 | 第54-55页 |
| 8.金华猪与国外猪种间遗传距离计算、聚类分析及分化时间的推算 | 第55-57页 |
| 9.微卫星位点IGF1与生长发育性状的关系 | 第57-59页 |
| 10.微卫星与候选基因SIM1精细定位 | 第59-61页 |
| 第二节 讨论与结论 | 第61-68页 |
| 1.微卫星标记 | 第61页 |
| 2.样本大小和实验结果的可靠性 | 第61页 |
| 3.群体内及群体间遗传变异 | 第61-63页 |
| 4.群体间遗传关系及分化时间 | 第63-64页 |
| 5.利用微卫星进行标记辅助选择 | 第64页 |
| 6.利用微卫星精细定位候选基因SIM1 | 第64-66页 |
| 7.结论 | 第66-68页 |
| 第二部分 利用线粒体DNA研究中国猪种母系起源与驯化及金华猪所处的进化位置 | 第68-108页 |
| 第一章 研究背景 | 第68-82页 |
| 第一节 中国猪种及金华猪的起源与驯化研究进展 | 第68-72页 |
| 第二节 利用线粒体DNA分子标记进行进化分析的研究进展 | 第72-82页 |
| 1.线粒体DNA的研究进展 | 第72-75页 |
| 2.利用mtDNA的多态结构研究群体间进化关系 | 第75-78页 |
| 3.进化树的构建方法 | 第78-82页 |
| 第二章 材料与方法 | 第82-92页 |
| 第一节 实验材料 | 第82-88页 |
| 1.实验样品 | 第82页 |
| 2.主要药品 | 第82-87页 |
| 3.主要仪器 | 第87页 |
| 4.主要试剂配制 | 第87-88页 |
| 第二节 实验方法 | 第88-92页 |
| 1.猪线粒体DNA的提取 | 第88页 |
| 2.线粒体D-loop区扩增和测序 | 第88-89页 |
| 3.数据分析 | 第89-92页 |
| 第三章 实验结果 | 第92-108页 |
| 第一节 结果与分析 | 第92-101页 |
| 1.线粒体DNA D-loop区的扩增结果 | 第92页 |
| 2.线粒体D-loop区序列分析 | 第92-95页 |
| 3.线粒体D-loop区序列单倍型分析 | 第95页 |
| 4.构建系统发生树 | 第95-98页 |
| 5.构建单倍型网络关系图 | 第98-99页 |
| 6.中国猪种主要单倍型的地理分布 | 第99-101页 |
| 第二节 讨论与结论 | 第101-108页 |
| 1.利用线粒体DNA的D-loop区序列构建系统进化树 | 第101页 |
| 2.-中国猪种线粒体D-loop区序列 | 第101-103页 |
| 3.中国猪种母系起源与驯化及金华猪所处的进化位置 | 第103-106页 |
| 4.结论 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 在校期间发表论文: | 第117页 |
