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猪12号染色体上PITPNA和PRPSAP1基因的分离、定位、表达谱分析以及PSME3和FDXR基因与生产性状的关联检测

中文摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
1 文献综述第11-22页
   ·猪12号染色体上基因的分离、定位现状第11-14页
   ·四个候选基因的研究现状第14-16页
     ·磷脂酰肌醇转移蛋白α基因(phosphatidylinositol transfer protein,alpha,PITPNA)第14页
     ·磷酸核糖焦磷酸合成酶连接蛋白1基因(phosphoribosylPyrophosp-hate synthetase-associated protein,PRPSAP1)第14-15页
     ·蛋白酶体激活亚单位3基因(Proteasome activator subunit,3,PSME3)第15-16页
     ·铁氧还蛋白还原酶基因(Ferredoxin reductase,FDXR)第16页
   ·杂种板技术用于猪的基因定位研究现状第16-19页
     ·体细胞杂种板(SCHP)用于染色体区域定位第17页
     ·辐射杂种板(RH)用于染色体精细定位第17-19页
   ·生物信息学在猪基因组研究中的应用第19-22页
     ·常用分子生物学数据库第19页
     ·比较基因图谱在分离新基因中的应用第19-20页
     ·表达序列标签(EST)在分离新基因中的应用第20-21页
     ·基因的电子克隆策略在猪基因组研究中的应用第21-22页
2 目的和意义第22-23页
3 材料与方法第23-33页
   ·材料第23-25页
     ·样品第23页
     ·猪群第23-24页
     ·主要仪器设备第24页
     ·主要试剂及配制第24-25页
       ·主要试剂第24页
       ·主要试剂配制第24-25页
     ·主要分子生物学软件和统计软件第25页
   ·方法第25-33页
     ·猪候选基因的分离方法第25-29页
       ·候选基因EST-重叠群的构建第25页
       ·引物设计第25-26页
       ·PCR扩增条件第26页
       ·PCR产物的纯化、克隆和测序第26-27页
       ·DNA序列同源性检索鉴定第27-29页
     ·候选基因的物理定位第29-30页
       ·引物设计第29页
       ·PCR扩增分型方法第29页
       ·数据分析方法第29-30页
     ·新分离基因组织表达谱的研究方法第30-31页
       ·总RNA的提取、检测、DNase-Ⅰ处理及纯化第30-31页
       ·RNA的反转录(Reverse transcription RT)第31页
       ·PCR反应第31页
       ·数据分析第31页
     ·候选基因多态性检测第31-33页
4 结果第33-56页
   ·猪PITPNA和PRPSAP1基因的序列分析与氨基酸预测第33-42页
     ·PITPNA基因特异引物的扩增结果第33页
     ·PITPNA基因扩增产物的序列分析结果第33-35页
     ·PRPSAP1基因扩增产物的序列分析结果第35-37页
     ·PRPSAP1和PITPNA基因CDS的电子克隆及氨基酸预测第37-42页
   ·猪PITPNA和PRPSAP1基因的染色体定位结果第42-48页
     ·染色体区域定位结果第43-46页
     ·精细定位结果第46-48页
   ·猪PITPNA和PRPSAP1基因的组织表达谱结果第48-51页
     ·总RNA的提取和检测结果第48-49页
     ·RT-PCR扩增的结果第49-51页
   ·猪PSME3和FDXR基因DNA多态性检测结果第51-56页
     ·检测片段的PCR扩增第51-52页
     ·SNP检测第52页
     ·PSME3和FDXR基因与部分生产性状的关联分析结果第52-56页
5 讨论第56-60页
   ·关于猪12号染色体上候选基因的选取第56页
   ·关于PITPNA和PRPSAP1基因的RH物理定位第56-57页
   ·关于PITPNA和PRPSAP1基因的组织表达谱第57-58页
   ·关于PSME3基因和FDXR基因的多态检测及性状的初步关联分析第58-60页
6 小结第60-61页
   ·本研究获得的结果第60页
   ·本研究的创新点第60页
   ·本研究的不足之处第60-61页
参考文献第61-67页
附录第67-68页
致谢第68页

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