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HLA区间11个遗传标记多态性与鼻咽癌的相关性研究

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-18页
第一章 MICA-STR多态性和湖南汉族人群鼻咽癌的关联研究第18-29页
   ·前言第18-19页
   ·材料与方法第19-20页
     ·研究对象第19页
     ·外周血基因组DNA抽提第19页
     ·MICA-STR的PCR扩增/Size-sequencing分型第19页
     ·MICA基因缺失(MICA*Del)检测第19-20页
     ·统计学分析第20页
   ·结果第20-25页
     ·MICA-STR基因型的判定第20页
     ·正常对照人群MICA-STR基因型的Hardy-Weinberg平衡检验第20页
     ·MICA-STR在NPC患者组、正常对照组的总体分布第20-22页
     ·男性NPC患者组、男性对照组间MICA-STR频率比较第22-23页
     ·女性NPC患者组、女性对照组间MICA-STR频率比较第23-24页
     ·MICA*A5.1、MICA*A9与NPC的关联同性别的交互作用第24-25页
     ·男性组MICA*A5.1、MICA*A9各种基因型OR值的异质性第25页
   ·讨论第25-29页
     ·MICA*A9与NPC相关HLA-B基因的已知连锁格局第25-26页
     ·HLA-B近着丝粒端基因分布第26页
     ·MICA-STR(GCT)n变异与疾病的关联第26-27页
     ·MICA-STR与湖南地区NPC相关存在性别差异的潜在机制第27页
     ·本研究结果的可重复性(Reproducibility)第27-28页
     ·结论第28-29页
第二章 湖南汉族人群MICA-STR、HLA-B单倍型多样性和连锁不平衡分析第29-38页
   ·前言第29-30页
   ·材料与方法第30-31页
     ·研究对象第30页
     ·外周血基因组DNA抽提第30页
     ·MICA-STR的PCR扩增/Size-sequencing分型第30页
     ·MICA基因缺失(MICA*Del)检测第30页
     ·HLA-B generic分型第30页
     ·HLA-B高分辨分型第30-31页
     ·统计学分析第31页
   ·结果第31-35页
     ·HLA-B、MICA-STR位点等位基因(组)频率分布第31-32页
     ·HLA-B、MICA-STR位点Hardy-Weinberg平衡第32页
     ·HLA-B-MICA-STR单倍型多样性第32-33页
     ·HLA-B、MICA-STR之间的连锁不平衡第33-34页
     ·湖南汉族人群中新发现的HLA-B-MICA-STR单倍型的HLA-B高分辨分型第34-35页
   ·讨论第35-38页
     ·湖南汉族人群与MICA*A5.1、MICA*A9连锁的HLA-B基因谱(Spectrum)第35-36页
     ·部分HLA-B-MICA-STR单倍型在不同种族的分布第36-37页
     ·湖南汉族人群HLA-B-MICA-STR单倍型的多样性及数据库的意义第37页
     ·结论第37-38页
第三章 HLA-A、B、DRB1 DNA多态性与湖南汉族人群鼻咽癌的关联研究第38-54页
   ·前言第38-39页
   ·材料与方法第39-40页
     ·研究对象第39页
     ·HLA-B generic分型第39页
     ·HLA-A、DRB1 generic分型第39页
     ·MICA-STR、MICA基因缺失(MICA*Del)数据第39页
     ·统计学分析第39-40页
   ·结果第40-46页
     ·正常对照人群HLA-A、B、MICA-STR、DRB1位点基因型分布与Hardy-Weinberg平衡的吻合度第40页
     ·正常对照人群HLA基因频率的性别差异第40页
     ·HLA-A位点与NPC的关联第40-42页
     ·HLA-B位点与NPC的关联第42页
     ·MICA-STR与NPC的关联第42页
     ·HLA-DRB1基因(组)与NPC的关联第42-45页
     ·HLA-B*35、B*38、B*58与MICA*A9的唯一性(Exclusive)连锁第45页
     ·2-位点间连锁不平衡(LD)分析第45-46页
     ·湖南汉族人群男性NPC易感HLA核心单倍型第46页
   ·讨论第46-54页
     ·MICA*A9、HLA-B基因在鼻咽癌遗传易感性中的等级(Hierarchy)关系第46-48页
     ·MICA*A5.1、HLA-B基因在鼻咽癌抵抗性作用中的等级(Hierarchy)关系第48-49页
     ·男性NPC易感HLA单倍型及关键区间第49-52页
     ·性激素通路基因遗传多态性与肿瘤易感性第52页
     ·HLA-B*58-MICA*A9-DR17(DRB1*03)区间的两个关键候选基因第52-53页
     ·结论第53-54页
第四章 HLA-I类区远着丝粒端7个多态性标记与湖南汉族人群鼻咽癌关联研究第54-71页
   ·前言第54-55页
   ·材料与方法第55-57页
     ·研究对象第55页
     ·STS(Sequence-Tagged Site)位置图第55页
     ·微卫星DNA分型第55-56页
     ·AluyHF、G、J分型第56-57页
     ·统计学分析第57页
   ·结果第57-69页
     ·正常对照人群7个STS位点基因型分布与Hardy-Weinberg平衡的吻合度第57-60页
     ·D6S1624微卫星标记在NPC患者、正常对照组间的频率分布第60-61页
     ·D6S258微卫星标记在NPC患者、正常对照组间的频率分布第61页
     ·M6S211微卫星标记在NPC患者、正常对照组间的频率分布第61-64页
     ·D6S510微卫星标记在NPC患者、正常对照组间的频率分布第64-65页
     ·AluyHF、G、J标记在NPC患者、正常对照组间的频率分布第65-69页
   ·讨论第69-71页
     ·7个STS标记分型数据与HLA-A位点数据的一致性(Consistency)第69页
     ·湖南汉族人群M6S211-*291、AluyHJ-*499与HLA-A基因的连锁格局第69-70页
     ·HLA-I类区远端DNA遗传多态性与NPC关联的4种可能性第70页
     ·结论第70-71页
总结论第71-72页
参考文献第72-85页
附录第85-86页
致谢第86-87页
攻读学位期间主要的研究成果目录第87页

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