| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 计算机辅助药物分子设计与HIV-1及戈谢病抑制剂背景介绍 | 第7-28页 |
| ·计算机辅助药物分子设计简介 | 第7-8页 |
| ·分子对接 | 第8-12页 |
| ·分子对接方法 | 第8-9页 |
| ·AutoDock使用步骤 | 第9-10页 |
| ·分子对接算法 | 第10-12页 |
| ·定量构效关系(Quantitative Structure Activity Relationship,QSAR) | 第12-15页 |
| ·2D-QSAR | 第12页 |
| ·3D-QSAR | 第12-13页 |
| ·Sybyl使用步骤 | 第13页 |
| ·定量构效关系的线性模型化方法 | 第13-14页 |
| ·定量构效关系模型稳定性和可靠性评估 | 第14-15页 |
| ·分子动力学 | 第15-21页 |
| ·Gromacs使用步骤 | 第17-18页 |
| ·分子动力学中的数理参数 | 第18-20页 |
| ·相关积分法 | 第20-21页 |
| ·HIV-1及抑制剂 | 第21-22页 |
| ·戈谢病抑制剂 | 第22-23页 |
| 参考文献 | 第23-28页 |
| 第二章 HIV-1 NNRTIs的3D-QSAR和分子对接研究 | 第28-46页 |
| ·研究背景 | 第28-29页 |
| ·方法 | 第29-34页 |
| ·数据 | 第29-32页 |
| ·分子构象和叠合 | 第32-33页 |
| ·3D-QSAR模型 | 第33-34页 |
| ·分子对接 | 第34页 |
| ·结果与讨论 | 第34-39页 |
| ·CoMFA和CoMSIA模型解释 | 第34-35页 |
| ·3D-QSAR模型的可靠性 | 第35-36页 |
| ·CoMFA等势图分析 | 第36-37页 |
| ·CoMSIA等势图分析 | 第37-39页 |
| ·对接分析 | 第39-40页 |
| ·设计新药物 | 第40-42页 |
| ·结论 | 第42页 |
| 参考文献 | 第42-46页 |
| 第三章 HIV-1蛋白酶抑制剂3D-QSAR,分子对接及分子动力学研究 | 第46-62页 |
| ·研究背景 | 第46-47页 |
| ·方法 | 第47-52页 |
| ·数据集 | 第47-50页 |
| ·分子构象及叠合 | 第50-51页 |
| ·3D-QSAR模型建立 | 第51页 |
| ·分子对接及分子动力学 | 第51-52页 |
| ·结果与讨论 | 第52-59页 |
| ·3D-QSAR结果 | 第52-55页 |
| ·对接结果 | 第55-56页 |
| ·动力学分析 | 第56-59页 |
| ·总结 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-62页 |
| 第四章 戈谢病抑制剂的2D/3D-QSAR和分子对接研究 | 第62-81页 |
| ·研究背景 | 第62-63页 |
| ·方法 | 第63-68页 |
| ·数据集 | 第63-66页 |
| ·分子对接 | 第66页 |
| ·能量最小化 | 第66页 |
| ·2D-QSAR模型建立 | 第66-67页 |
| ·3D-QSAR模型建立 | 第67-68页 |
| ·结果讨论 | 第68-77页 |
| ·对接结果 | 第68-69页 |
| ·2D-QSAR结果 | 第69-70页 |
| ·3D-QSAR结果 | 第70-74页 |
| ·2D-QSAR结果讨论 | 第74-75页 |
| ·3D-QSAR结果讨论 | 第75-77页 |
| ·总结 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-81页 |
| 在读期间发表论文情况 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
