云斑车蝗线粒体基因组序列测定与分析
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一部分 前言 | 第10-22页 |
| 1 线粒体基因组学研究概况 | 第10-14页 |
| ·动物线粒体基因组结构特征 | 第10-11页 |
| ·动物线粒体基因组的遗传特征 | 第11-13页 |
| ·动物线粒体基因组的进化 | 第13-14页 |
| 2 线粒体基因组研究方法 | 第14-15页 |
| ·线粒体基因组的分离纯化 | 第14页 |
| ·线粒体基因组测序策略 | 第14-15页 |
| 3 昆虫纲全线粒体基因组测序现状 | 第15-17页 |
| 4 直翅目分类简介 | 第17-21页 |
| ·直翅目简介 | 第17-19页 |
| ·蝗总科简介 | 第19页 |
| ·斑翅蝗科简介 | 第19-20页 |
| ·云斑车蝗形态特征 | 第20-21页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 第二部分 材料与方法 | 第22-38页 |
| 1 实验材料 | 第22-25页 |
| ·标本的采集、保存与鉴定 | 第22页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第22-25页 |
| 2 实验方法 | 第25-32页 |
| ·总DNA提取 | 第25-26页 |
| ·总DNA检测 | 第26页 |
| ·PCR引物设计及PCR扩增 | 第26-31页 |
| ·Sub—PCR扩增产物测序 | 第31-32页 |
| 3 数据处理和分析 | 第32-33页 |
| ·测序结果的片段拼接 | 第33页 |
| ·线粒体基因组序列的注释 | 第33页 |
| ·线粒体基因组基因组成情况的分析 | 第33页 |
| ·RNA的二级结构的预测 | 第33页 |
| 4 直翅目昆虫线粒体rRNA分子系统发育分析 | 第33-38页 |
| ·序列数据来源 | 第33-36页 |
| ·序列比对 | 第36页 |
| ·序列组成分析 | 第36页 |
| ·系统发育信号检验 | 第36-37页 |
| ·建树 | 第37-38页 |
| 第三部分 实验结果与分析 | 第38-70页 |
| 1 实验结果 | 第38-40页 |
| ·基因组总DNA提纯 | 第38页 |
| ·长PCR扩增和纯化 | 第38-39页 |
| ·Sub—PCR扩增和纯化 | 第39-40页 |
| ·Sub—PCR产物直接测序或克隆测序 | 第40页 |
| 2 序列拼接 | 第40-41页 |
| 3 线粒体基因组的注释结果 | 第41-53页 |
| ·基因组结构 | 第41-46页 |
| ·蛋白质基因 | 第46-48页 |
| ·tRNA基因 | 第48-51页 |
| ·rRNA基因注释及分析 | 第51-53页 |
| 4 直翅目昆虫系统发育分析 | 第53-70页 |
| ·序列比对 | 第53页 |
| ·数据集系统发育信号检验 | 第53-57页 |
| ·构建系统发育树 | 第57-70页 |
| 第四部分 讨论 | 第70-77页 |
| 1 线粒体蛋白质基因的起始和终止 | 第70页 |
| 2 密码子使用偏向性 | 第70-71页 |
| 3 tRNA二级结构 | 第71页 |
| 4 A+T富集区 | 第71-72页 |
| 5 rRNA二级结构 | 第72-75页 |
| 6 直翅目昆虫的系统发育关系 | 第75-77页 |
| 第五部分 总结 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-88页 |
| 致谢 | 第88-89页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第89页 |
