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基于芒草饲养牛瘤胃微生物宏基因组文库构建及多样性分析

摘要第1-6页
Abstract第6-12页
第一章 文献综述及前言第12-20页
 1 宏基因组学及其在胃肠道微生物研究中的应用现状第12-17页
   ·宏基因组概念第13页
   ·宏基因组技术路线第13-15页
   ·胃肠道微生物水解酶基因资源研究第15-16页
   ·胃肠道微生物与宿主疾病发生的相关性第16-17页
 2 微生物多态性研究方法第17-19页
   ·变性凝胶电泳(DGGE)分析第17-18页
   ·限制性片段长度多态性(RFLP)分析第18-19页
 3 本课题的研究内容及其目的意义第19-20页
第二章 牛胃微生物宏基因组文库的构建和筛选第20-33页
 1 实验材料第20-22页
   ·样品采集第20页
   ·常用仪器第20-21页
   ·常用酶和试剂第21页
   ·菌株和试剂盒第21-22页
   ·试剂和培养基配制第22页
 2 试验方法第22-27页
   ·低熔点琼脂糖包埋裂解法第22-23页
   ·脉冲场电泳第23-24页
   ·酶切条件确定第24页
   ·电洗脱获得酶切片段第24-25页
   ·载体连接第25页
   ·点透析第25页
   ·电转化第25-26页
   ·转化子检测第26页
   ·电转感受态制备第26页
   ·克隆的挑取及保存第26-27页
   ·β-葡萄糖苷酶阳性克隆子筛选第27页
   ·纤维素外切酶阳性克隆子筛选第27页
 3 结果第27-31页
   ·大片段DNA(HMDNA)的获得第27-28页
   ·酶切条件的确定第28-29页
   ·酶切后大片段回收第29页
   ·插入片段大小第29-30页
   ·产酶基因阳性克隆子的筛选第30-31页
 4 讨论第31-33页
   ·大片段宏基因组文库构建第31-32页
   ·产酶基因阳性克隆子筛选第32-33页
第三章 芒草单一喂养牛牛胃中微生物多样性调查第33-46页
 1 实验材料第33-34页
   ·样品采集第33页
   ·实验仪器第33页
   ·酶及生化试剂第33页
   ·溶液的配制第33-34页
 2 试验方法第34-38页
   ·样品中总DNA的提取及检测第34-35页
   ·样品PCR扩增第35-37页
   ·变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)第37页
   ·限制性片段长度多态性分析(RFLP)第37页
   ·银染第37-38页
   ·图谱分析第38页
 3 结果与分析第38-44页
   ·细菌16S rRNA及真菌18S rDNA片段扩增第38-39页
   ·变性梯度凝胶电泳及其聚类分析第39-41页
   ·DGGE图谱多样性分析第41-42页
   ·RFLP图谱及分析第42-44页
 4 讨论第44-46页
第四章 总结、创新点和后续工作设想第46-48页
 总结第46页
 创新点第46-47页
 后续工作展望第47-48页
参考文献第48-53页
附录第53-56页
 细菌人工染色体载体图谱第53-54页
 DNA分子量标准第54-55页
 缩略词对照表第55-56页
致谢第56-57页

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