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条锈菌诱导的小麦叶片SSH文库构建及其ESTs分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
第一部分 文献综述第11-37页
 一 小麦条锈病危害及抗条锈病基因遗传研究第11-14页
  1 小麦条锈病危害第11页
  2 小麦抗条锈病基因遗传研究第11-14页
   ·小麦抗条锈病基因的遗传研究方法第12-14页
     ·常规杂交法第12-13页
     ·基因推导法第13-14页
     ·非整倍体法第14页
 二 小麦抗条锈病基因克隆研究进展第14-18页
  1 禾谷类作物抗病基因克隆现状第15-16页
  2 小麦抗条锈病基因克隆研究进展第16-18页
 三 抑制性消减杂交技术及ESTs分析第18-28页
  1 抑制性消减杂交技术原理及应用第18-23页
   ·抑制性消减杂交技术原理第18-19页
   ·抑制消减杂交技术操作步骤第19-21页
   ·SSH技术的应用第21-23页
  2 ESTs分析第23-28页
   ·cDNA文库构建第24-25页
   ·ESTs随机测序第25页
   ·序列前处理第25页
   ·聚类和拼接第25-26页
   ·基因注释及功能分类第26-27页
   ·ESTs代谢途径及对应基因产物的系统分析第27-28页
   ·ESTs数据的后续分析第28页
     ·基因核苷酸序列分析第28页
     ·蛋白质序列分析第28页
 四 比较基因组学与小麦抗条锈病基因分子标记第28-37页
  1 植物比较基因组学研究策略与进展第28-32页
   ·比较基因组学的兴起第28-29页
   ·比较基因组学在植物中的应用第29-32页
     ·比较遗传作图第29-30页
     ·基因结构区域的微共线性研究第30-31页
     ·基于比较基因组学的QTL比较与基因克隆第31-32页
  2 小麦抗条锈病基因分子标记研究进展第32-37页
第二部分 研究报告第37-77页
 引言第37-38页
 一 材料与方法第38-49页
  1 材料第38页
  2 方法第38-49页
   ·培养和接种第38-39页
   ·取样第39页
   ·总RNA提取第39页
   ·总RNA中基因组DNA的去除第39-40页
   ·抑制消减杂交(SSH)文库构建第40-46页
     ·cDNA第一链合成第40-41页
     ·cDNA第二链合成第41页
     ·Rsa Ⅰ酶切及接头连接第41-42页
     ·两次消减杂交第42-43页
     ·两次PCR扩增第43-44页
     ·感受态细胞的制备及SSH-PCR产物的连接转化第44页
     ·菌液PCR及文库片段大小检测第44-45页
     ·地高辛差式筛选第45-46页
     ·阳性克隆的测序第46页
     ·序列分析第46页
   ·半定量PCR第46-47页
     ·第一链cDNA合成第46-47页
     ·第一链cDNA浓度定量第47页
   ·比较基因组学开发Yr26分子标记第47-49页
   ·分子标记的遗传作图第49页
 二 结果与分析第49-73页
  1 SSH文库构建及ESTs功能分析第49-68页
   ·总RNA的提取第49页
   ·SSH文库的构建第49-53页
     ·双链cDNA的合成第50页
     ·RsaⅠ酶切第50-51页
     ·两次PCR扩增第51页
     ·SSH-PCR产物的连接转化及文库片段大小检测第51-53页
     ·地高辛标记探针的SSH文库差式筛选第53页
   ·测序及ESTs生物信息学分析第53-57页
   ·ESTs表达分析及物理定位第57-68页
     ·条锈菌诱导ESTs表达分析第57-62页
     ·条锈菌诱导表达ESTs的物理定位第62-68页
  2 利用比较基因组学开发Yr26分子标记第68-72页
   ·与小麦染色体1BL-6区段共线性短柄草序列寻找第68-72页
  3 引物HJ-9的扩增及遗传图谱构建第72-73页
 三 讨论第73-77页
  1 SSH文库的构建与ESTs分析第73-75页
   ·SSH文库的构建第73-74页
   ·ESTs分析第74-75页
     ·定位于第一群ESTs的分析第74-75页
     ·在92R137与扬麦5号中差异表达ESTs的分析第75页
   ·SSH文库的缺点第75页
  2 利用比较基因组开发Yr26分子标记第75-77页
全文结论第77-79页
参考文献第79-91页
致谢第91页

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