| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-12页 |
| 目录 | 第12-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-31页 |
| 1 生境片段化对动物种群影响的研究现状 | 第15-17页 |
| ·对动物种群大小和灭绝速率的影响 | 第15-16页 |
| ·对动物种群的扩散和迁入的影响 | 第16页 |
| ·对动物种群遗传和变异的影响 | 第16-17页 |
| 2 微卫星标记相关综述 | 第17-31页 |
| ·微卫星标记简介 | 第17-20页 |
| ·微卫星的概念 | 第17-18页 |
| ·微卫星的特点 | 第18-20页 |
| ·数量丰富,覆盖整个基因组 | 第18页 |
| ·高多态性、等位基因多、信息量高 | 第18页 |
| ·以孟德尔方式遗传,呈共显性 | 第18页 |
| ·微卫星标记的保守性 | 第18页 |
| ·容易检测、重复性好、适于自动化分析 | 第18-20页 |
| ·微卫星标记的应用 | 第20-24页 |
| ·微卫星在群体遗传学与保护遗传学中的应用 | 第20-21页 |
| ·微卫星在动物分子育种中的应用 | 第21-22页 |
| ·微卫星在亲权鉴定与品系鉴定中的应用 | 第22-23页 |
| ·微卫星在遗传作图及目标基因QTL定位方面中的应用 | 第23页 |
| ·微卫星在遗传病的预测及诊断中的应用 | 第23-24页 |
| ·微卫星位点的获得 | 第24-30页 |
| ·从公共数据库中查找微卫星位点 | 第24-25页 |
| ·从近缘物种获得微卫星引物 | 第25-26页 |
| ·从基因组DNA中筛选微卫星位点 | 第26-30页 |
| ·传统分离策略 | 第26-27页 |
| ·富集法分离策略 | 第27-30页 |
| ·微卫星标记的不足之处及发展前景 | 第30-31页 |
| 第二章 社鼠多态性微卫星位点的筛选及SSR反应条件优化 | 第31-49页 |
| 1 材料与方法 | 第31-39页 |
| ·材料 | 第31-33页 |
| ·动物材料 | 第31页 |
| ·SSR反应体系优化及基因组DNA提取所用材料 | 第31页 |
| ·试剂配制 | 第31-32页 |
| ·主要仪器 | 第32-33页 |
| ·方法 | 第33-39页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第33-34页 |
| ·基因组DNA质量观察 | 第34页 |
| ·紫外分光光度计分析 | 第34页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳分析 | 第34页 |
| ·微卫星引物的筛选 | 第34-37页 |
| ·待筛选大、小鼠微卫星引物序列 | 第34-36页 |
| ·SSR反应体系的建立与优化 | 第36-37页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 | 第37-39页 |
| ·制胶 | 第37页 |
| ·电泳 | 第37-38页 |
| ·银染检测 | 第38页 |
| ·保存图象 | 第38-39页 |
| 2 结果与分析 | 第39-45页 |
| ·基因组DNA提取 | 第39-40页 |
| ·SSR反应体系的优化 | 第40-41页 |
| ·不同DNA模板浓度对PCR结果的影响 | 第40页 |
| ·不同dNTP浓度对PCR结果的影响 | 第40页 |
| ·不同引物浓度对PCR结果的影响 | 第40-41页 |
| ·利用优化的反应体系进行扩增反应 | 第41页 |
| ·微卫星引物的筛选 | 第41-45页 |
| ·可初步进行跨种扩增的微卫星引物 | 第41-43页 |
| ·多态性微卫星引物 | 第43-45页 |
| 3 讨论 | 第45-49页 |
| ·DNA提取改进及95%乙醇保存可行性 | 第45-46页 |
| ·PCR反应体系的优化 | 第46-47页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染 | 第47-48页 |
| ·引物跨种扩增 | 第48-49页 |
| 第三章 不同岛屿间社鼠遗传多样性 | 第49-89页 |
| 1 材料和方法 | 第50-53页 |
| ·群体材料 | 第50页 |
| ·研究方法 | 第50-51页 |
| ·基因组DNA提取与PCR反应 | 第51-52页 |
| ·数据分析 | 第52-53页 |
| 2 结果 | 第53-80页 |
| ·岛屿中社鼠种群DNA扩增结果 | 第53-55页 |
| ·千岛湖地区社鼠物种水平遗传多样性情况 | 第55-66页 |
| ·Hady-Weinberg平衡 | 第55页 |
| ·社鼠物种遗传多样性 | 第55-65页 |
| ·种群的遗传变异 | 第65-66页 |
| ·种群的固定系数(F_(IS)) | 第65页 |
| ·种群遗传分化 | 第65-66页 |
| ·社鼠不同种群间遗传变异的关系 | 第66-80页 |
| ·不同种群社鼠遗传多样性比较 | 第66-67页 |
| ·岛屿面积大小和种群遗传多样性的相关性分析 | 第67-68页 |
| ·种群间遗传分化 | 第68-77页 |
| ·不同种群间基因流及分化系数 | 第68-69页 |
| ·种群间的遗传距离和遗传相似度(GI) | 第69-73页 |
| ·聚类分析 | 第73-75页 |
| ·主坐标分析 | 第75-77页 |
| ·地理距离与遗传分化、遗传距离的相关性分析 | 第77-79页 |
| ·种群瓶颈效应分析 | 第79-80页 |
| 3 讨论 | 第80-89页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡 | 第80-81页 |
| ·千岛湖地区社鼠遗传多样性 | 第81-82页 |
| ·社鼠不同种群间遗传变异的关系 | 第82-88页 |
| ·社鼠不同种群遗传多样性 | 第82-83页 |
| ·种群间的遗传分化 | 第83-84页 |
| ·聚类分析 | 第84-86页 |
| ·地理距离和种群遗传分化 | 第86-87页 |
| ·种群瓶颈 | 第87-88页 |
| ·由片段化看物种的保护 | 第88-89页 |
| 第四章 结论 | 第89-91页 |
| 参考文献 | 第91-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 硕士在读期间发表的论文 | 第106-107页 |
| 硕士在读期间参加的主要科研项目和学术活动 | 第107-108页 |