| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-32页 |
| 1 动物分类学发展的新方向—DNA分类学 | 第13-15页 |
| 2 分子系统学 | 第15-20页 |
| ·分子系统学采用的分子标记 | 第15-17页 |
| ·分子进化研究采用的分子技术 | 第17-19页 |
| ·分子系统进化树的构建 | 第19-20页 |
| 3 纽形动物的分子系统学研究进展 | 第20-23页 |
| ·纽形动物门内分类及分子系统学研究进展 | 第21-22页 |
| ·纽形动物在后生动物中分类地位及分子系统发育研究进展 | 第22-23页 |
| 4 细首科纽虫的研究进展 | 第23-24页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第24-25页 |
| 参考文献 | 第25-32页 |
| 第二章 统计简约网络与细首科纽虫物种界定 | 第32-56页 |
| 引言 | 第32-33页 |
| 1 材料与方法 | 第33-43页 |
| ·样品来源 | 第33-38页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第38-39页 |
| ·PCR扩增与产物纯化 | 第39-40页 |
| ·PCR产物的分子克隆 | 第40-42页 |
| ·测序 | 第42页 |
| ·数据分析 | 第42-43页 |
| 2 结果 | 第43-46页 |
| ·COI基因序列特征 | 第43-44页 |
| ·单倍型网络(Haplotype network) | 第44-46页 |
| ·COI序列分析 | 第46页 |
| ·分子系统树 | 第46页 |
| 3 讨论 | 第46-53页 |
| 参考文献 | 第53-56页 |
| 第三章 细首科纽虫分子系统发育 | 第56-72页 |
| 引言 | 第56-57页 |
| 1 材料与方法 | 第57-63页 |
| ·实验材料 | 第57-60页 |
| ·外类群的选择 | 第60页 |
| ·PCR扩增 | 第60-61页 |
| ·PCR纯化、PCR产物分子克隆和序列测定 | 第61页 |
| ·数据分析 | 第61-63页 |
| 2 结果与讨论 | 第63-71页 |
| ·初步序列分析 | 第63-67页 |
| ·系统发育分析 | 第67-71页 |
| 参考文献 | 第71-72页 |
| 第四章 纽形动物线粒体基因组特征及其分子系统进化 | 第72-132页 |
| 引言 | 第72-74页 |
| 第一节 扁额细首纽虫的线粒体全基因组序列测定和结构分析 | 第74-89页 |
| 1 材料与方法 | 第74-77页 |
| ·基因组总DNA的提取 | 第74页 |
| ·PCR引物设计、扩增、隆和测序 | 第74-77页 |
| ·序列分析 | 第77页 |
| 2 结果与讨论 | 第77-89页 |
| ·基因组组成和结构 | 第77-80页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第80-81页 |
| ·碱基组成和密码子使用情况分析 | 第81-85页 |
| ·核糖体RNA和转运RNA | 第85-87页 |
| ·非编码区 | 第87-89页 |
| 第二节 细首纽虫未定种的线粒体基因组序列测定和结构分析 | 第89-100页 |
| 1 材料和方法 | 第89页 |
| ·基因组总DNA的提取 | 第89页 |
| ·PCR扩增、克隆和测序 | 第89页 |
| ·序列分析 | 第89页 |
| 2 结果与讨论 | 第89-100页 |
| ·基因组组成和结构 | 第89-90页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第90-94页 |
| ·碱基组成和密码子使用情况 | 第94-97页 |
| ·核糖体RNA和转运RNA | 第97页 |
| ·非编码区 | 第97-100页 |
| 第三节 奇异拟纽虫线粒体基因组序列测定和结构分析 | 第100-110页 |
| 1 材料与方法 | 第100-101页 |
| ·基因组总DNA的提取 | 第100页 |
| ·PCR引物设计、扩增、克隆和测序 | 第100页 |
| ·序列分析 | 第100-101页 |
| 2.结果与讨论 | 第101-110页 |
| ·基因组组成和结构 | 第101-102页 |
| ·碱基组成 | 第102-104页 |
| ·蛋白质编码基因和密码子使用 | 第104-106页 |
| ·核糖体RNA和转运RNA | 第106-109页 |
| ·非编码区 | 第109-110页 |
| 第四节 四种纽虫线粒体基因组比较分析 | 第110-117页 |
| 1 四种纽虫线粒体基因组碱基组成比较 | 第110-111页 |
| 2 四种纽虫线粒体基因组蛋白质编码基因比较 | 第111-112页 |
| 3 四种纽虫线粒体基因组蛋白质编码基因密码子碱基组成比较 | 第112-114页 |
| 4 四种纽虫线粒体基因组核糖体RNA序列比较 | 第114页 |
| 5 四种纽虫线粒体基因组基因顺序比较 | 第114-116页 |
| 6 讨论 | 第116-117页 |
| 第五节 纽虫在冠轮动物中系统发生关系分析 | 第117-127页 |
| 1 材料与方法 | 第117-118页 |
| ·样品来源 | 第117页 |
| ·基因排列分析 | 第117页 |
| ·基于蛋白编码基因的系统发育树构建 | 第117-118页 |
| 2 结果与讨论 | 第118-127页 |
| ·线粒体基因组基因排列 | 第118-122页 |
| ·基于蛋白质编码基因的系统发育分析 | 第122-127页 |
| 参考文献 | 第127-132页 |
| 已完成文章 | 第132-133页 |
| 致谢 | 第133-134页 |
