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HIV-1表型耐药以及基因型耐药的检测与分析

中文摘要第1-8页
Abstract第8-11页
第一章 前言第11-33页
   ·HIV-1病原生物学简介第11-13页
   ·耐药性HIV-1的流行简介第13-14页
   ·HIV-1耐药性的研究现状第14-23页
     ·HIV-1耐药性的产生、进化第14页
     ·抗HIV-1药物的研究现状第14-17页
     ·HIV-1耐药机制及耐药性突变的研究现状第17-23页
       ·HIV-1蛋白酶及其耐药机制第17-18页
       ·HIV-1蛋白酶的耐药性突变第18-19页
       ·H1V-1逆转录酶及其耐药机制第19-21页
       ·HIV-1逆转录酶的耐药性突变第21-23页
   ·HIV-1耐药性的检测方法研究现状第23-27页
     ·基因型耐药性检测第23-24页
     ·表型耐药性检测第24-27页
   ·研究目的第27-28页
   ·实验设计第28-30页
   ·实验原理及技术流程第30-33页
第二章 实验材料和方法第33-50页
   ·实验材料第33-37页
     ·感受态菌株第33页
     ·细胞及培养基第33页
     ·用于耐药性研究的质粒第33-34页
     ·用于耐药性研究的HIV感染者血浆样本第34页
     ·用于耐药性研究的抗逆转录病毒药物第34-35页
     ·主要化学试剂及试剂盒第35页
     ·主要工具酶及DNA Marker第35页
     ·引物合成及测序第35页
     ·主要仪器第35-36页
     ·常用试剂配置第36-37页
     ·主要生物软件和分析工具第37页
   ·实验方法第37-50页
     ·HIV-1 RNA的提取第37-38页
     ·HIV-1 CDNA的合成第38页
     ·巢式PCR反应扩增目的基因片段第38-40页
     ·PCR产物的纯化第40页
     ·琼脂糖凝胶回收第40-41页
     ·大肠杆菌化学感受态细胞的制备第41页
     ·定点突变改造载体PSG3ΔENv第41-42页
     ·目的基因片段的克隆第42页
     ·质粒的小量提取第42-43页
     ·质粒的中量提取第43-44页
     ·质粒的定量第44页
     ·LIPOFECTAMINE 2000进行质粒PCDNA3.1-env与PSG3Δenv共转染形成假病毒第44-45页
     ·功能性假病毒的滴度测定第45页
     ·假病毒法表型敏感性实验第45-46页
     ·活病毒法表型耐药实验第46-48页
     ·HIV-1 P24抗原检测第48页
     ·实验数据的计算与分析第48-49页
     ·耐药性突变的分析和耐药性解释第49-50页
第三章 实验结果第50-79页
   ·假病毒法表型耐药性检测体系的构建第50-70页
     ·重组耐药性HIV-1假病毒的构建及鉴定第50-57页
       ·骨架载体质粒的改造及参考假病毒株的构建第50-51页
       ·参考假病毒株感染能力及滴度的验证第51-52页
       ·用于构建重组假病毒株的耐药性HIV-1样本目的基因片段的获得第52-53页
       ·耐药性HIV-1样本目的基因片段的克隆以及重组克隆的鉴定筛选第53-54页
       ·16株重组假病毒株基因型耐药性分析第54-56页
       ·16株重组假病毒株耐药基因的分型第56-57页
     ·假病毒法表型耐药性检测实验方法的构建以及验证第57-60页
       ·参考假病毒株对12种抗病毒药物的表型敏感性检测及验证第57-59页
       ·假病毒表型敏感性检测方法重复性的验证第59-60页
       ·假病毒表型耐药性检测方法准确性的验证第60页
     ·假病毒表型耐药性检测方法的应用以及对假病毒表型耐药性的解释和分析第60-69页
       ·假病毒株对蛋白酶抑制剂的敏感性以及与基因型耐药性的比较第60-62页
       ·假病毒株对核苷类逆转录酶抑制剂的敏感性以及与基因型耐药性的比较第62-65页
       ·假病毒株对非核苷类逆转录酶抑制剂的敏感性以及与基因型耐药性的比较第65-69页
     ·小结第69-70页
   ·我国广西壮族自治区HIV-1基因型耐药性研究第70-79页
     ·广西HIV-1样品RNA的提取及目的耐药基因片段的扩增第70页
     ·广西HIV-1样本蛋白酶及逆转录酶基因的分型及进化树第70-72页
     ·广西HIV-1样本基因型耐药性的检测结果第72-75页
     ·广西HIV-1样本蛋白酶及逆转录酶基因多态性分析第75-78页
     ·小结第78-79页
第四章 实验讨论第79-87页
   ·单轮假病毒法表型耐药性检测的讨论第79-84页
     ·应用假病毒法对16株HIV-1的表型检测以及对其耐药性的解释第79-81页
     ·本研究中假病毒表型耐药性检测方法的优势第81-82页
     ·假病毒表型耐药性检测方法的应用第82-84页
   ·我国广西壮族自治区HIV-1样品基因型耐药性研究的讨论第84-87页
参考文献第87-96页
附录 缩略语一览表第96-97页
致谢第97-98页
作者简历第98页

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