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水稻polycomb基因家族甲基化状态初步检测

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
缩略语第10-11页
1 文献综述第11-26页
   ·表观遗传学及DNA甲基化特点第11-13页
   ·DNA甲基化的生物学功能第13-14页
   ·研究DNA甲基化的主要方法第14-21页
     ·反向液相色谱法第15页
     ·Sss Ⅰ甲基转移酶法第15页
     ·氯乙醛法第15页
     ·免疫化学法第15-16页
     ·限制性酶切反应分析偶联PCR反应或者杂交反应(methylation-sensitiverestriction endonuclease,MSRE-PCR/SOUTHERN)第16页
     ·亚硫酸氢盐偶联限制性酶切反应(combined bisulfite restrictionanalysis,COBRA)第16-17页
     ·甲基化敏感的单核苷酸引物延伸(methylation-sensitive singlenucleotide primer extension,Ms-SnuPE)第17-18页
     ·亚硫酸氢盐测序反应(BSP,bisulfite sodium sequecing)第18-20页
     ·焦磷酸测序技术(Pyrosequecing)第20-21页
   ·DNA序列的甲基化分析软件第21-22页
   ·多梳家族基因(The Polycomb group;PcG基因)的特点与功能第22-24页
   ·FIE基因的研究进展第24-25页
   ·E(z)基因的研究进展第25-26页
   ·课题的提出、研究的目的和意义第26页
2 材料与方法第26-35页
   ·材料与试剂第26-29页
     ·材料准备第26-27页
     ·主要试剂与仪器第27页
     ·PCR引物第27-28页
     ·文中所用分析软件第28-29页
   ·实验方法第29-35页
     ·CTAB大量法抽提基因组DNA第29-30页
     ·基因组DNA的纯化第30页
     ·基因组DNA的亚硫酸盐处理第30-31页
     ·亚硫酸盐处理后DNA的回收/脱磺基/中和/纯化第31-32页
     ·转化效率的验证第32页
     ·目标片段的扩增,转化,克隆与测序第32-34页
     ·分析测序结果第34-35页
     ·MSRE-PCR方法第35页
3 结果与分析第35-42页
   ·水稻中亚硫酸氢盐测序法的建立和优化第35-38页
     ·纯化后的基因组DNA电泳检测第35-36页
     ·FIE2A基因生物信息学分析第36页
     ·扩增之前转化效率的验证第36-37页
     ·巢式PCR扩增结果第37页
     ·热启动PCR扩增结果第37-38页
   ·不同材料,不同基因,以及不同片段的甲基化状态第38-42页
     ·野生型和突变体水稻中Fie2A基因的CG岛甲基化水平第38-39页
     ·野生型和突变体水稻Ez1基因的CG岛片段第39-40页
     ·野生型水稻DAP5的胚乳Ez1基因的非CG岛甲基化状态分析第40页
     ·水稻Ez1基因CG岛甲基化状态的分析第40-41页
     ·MSRE-PCR结果第41-42页
4 讨论第42-49页
   ·亚硫酸氢盐方法的建立与优化第42-44页
   ·Fie基因的甲基化状态第44-47页
   ·Ez1基因的甲基化状态第47-49页
附录:常用试剂及其配制第49-50页
参考文献第50-58页
附图第58-60页
致谢第60页

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