摘要 | 第1-8页 |
ABSTRACT | 第8-10页 |
缩略语 | 第10-11页 |
1 文献综述 | 第11-26页 |
·表观遗传学及DNA甲基化特点 | 第11-13页 |
·DNA甲基化的生物学功能 | 第13-14页 |
·研究DNA甲基化的主要方法 | 第14-21页 |
·反向液相色谱法 | 第15页 |
·Sss Ⅰ甲基转移酶法 | 第15页 |
·氯乙醛法 | 第15页 |
·免疫化学法 | 第15-16页 |
·限制性酶切反应分析偶联PCR反应或者杂交反应(methylation-sensitiverestriction endonuclease,MSRE-PCR/SOUTHERN) | 第16页 |
·亚硫酸氢盐偶联限制性酶切反应(combined bisulfite restrictionanalysis,COBRA) | 第16-17页 |
·甲基化敏感的单核苷酸引物延伸(methylation-sensitive singlenucleotide primer extension,Ms-SnuPE) | 第17-18页 |
·亚硫酸氢盐测序反应(BSP,bisulfite sodium sequecing) | 第18-20页 |
·焦磷酸测序技术(Pyrosequecing) | 第20-21页 |
·DNA序列的甲基化分析软件 | 第21-22页 |
·多梳家族基因(The Polycomb group;PcG基因)的特点与功能 | 第22-24页 |
·FIE基因的研究进展 | 第24-25页 |
·E(z)基因的研究进展 | 第25-26页 |
·课题的提出、研究的目的和意义 | 第26页 |
2 材料与方法 | 第26-35页 |
·材料与试剂 | 第26-29页 |
·材料准备 | 第26-27页 |
·主要试剂与仪器 | 第27页 |
·PCR引物 | 第27-28页 |
·文中所用分析软件 | 第28-29页 |
·实验方法 | 第29-35页 |
·CTAB大量法抽提基因组DNA | 第29-30页 |
·基因组DNA的纯化 | 第30页 |
·基因组DNA的亚硫酸盐处理 | 第30-31页 |
·亚硫酸盐处理后DNA的回收/脱磺基/中和/纯化 | 第31-32页 |
·转化效率的验证 | 第32页 |
·目标片段的扩增,转化,克隆与测序 | 第32-34页 |
·分析测序结果 | 第34-35页 |
·MSRE-PCR方法 | 第35页 |
3 结果与分析 | 第35-42页 |
·水稻中亚硫酸氢盐测序法的建立和优化 | 第35-38页 |
·纯化后的基因组DNA电泳检测 | 第35-36页 |
·FIE2A基因生物信息学分析 | 第36页 |
·扩增之前转化效率的验证 | 第36-37页 |
·巢式PCR扩增结果 | 第37页 |
·热启动PCR扩增结果 | 第37-38页 |
·不同材料,不同基因,以及不同片段的甲基化状态 | 第38-42页 |
·野生型和突变体水稻中Fie2A基因的CG岛甲基化水平 | 第38-39页 |
·野生型和突变体水稻Ez1基因的CG岛片段 | 第39-40页 |
·野生型水稻DAP5的胚乳Ez1基因的非CG岛甲基化状态分析 | 第40页 |
·水稻Ez1基因CG岛甲基化状态的分析 | 第40-41页 |
·MSRE-PCR结果 | 第41-42页 |
4 讨论 | 第42-49页 |
·亚硫酸氢盐方法的建立与优化 | 第42-44页 |
·Fie基因的甲基化状态 | 第44-47页 |
·Ez1基因的甲基化状态 | 第47-49页 |
附录:常用试剂及其配制 | 第49-50页 |
参考文献 | 第50-58页 |
附图 | 第58-60页 |
致谢 | 第60页 |