| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| 1.1 研究的背景及意义 | 第7-9页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第9-11页 |
| 1.2.1 研究现状 | 第9页 |
| 1.2.2 存在的问题 | 第9-10页 |
| 1.2.3 本研究的提出 | 第10-11页 |
| 1.3 论文的研究内容和主要工作 | 第11页 |
| 1.4 论文的结构安排 | 第11-13页 |
| 第二章 数据集和评估标准 | 第13-20页 |
| 2.1 蛋白质相互作用数据 | 第13-16页 |
| 2.1.1 蛋白质相互作用数据及公共数据库 | 第13-14页 |
| 2.1.2 DIP数据库(DatabaseofInteractingProteins) | 第14-15页 |
| 2.1.3 MIPS数据库(MunichInformationCenterforProteinSequences) | 第15页 |
| 2.1.4 本文使用的蛋白质相互作用数据 | 第15-16页 |
| 2.2 蛋白质功能模块数据集 | 第16页 |
| 2.3 基因表达数据 | 第16-17页 |
| 2.4 评估标准 | 第17-20页 |
| 2.4.1 准确度和召回率 | 第17-18页 |
| 2.4.2 敏感度和正预测值 | 第18-20页 |
| 第三章 构建蛋白质相互作用网络 | 第20-25页 |
| 3.1 蛋白质相互作用 | 第20-23页 |
| 3.2 蛋白质相互作用网络及建模 | 第23-25页 |
| 第四章 马尔科夫聚类算法及初次聚类 | 第25-29页 |
| 4.1 马尔科夫聚类算法 | 第26-28页 |
| 4.1.1 扩展(Expand)和膨胀(Inflate) | 第26-27页 |
| 4.1.2 修剪(Prune) | 第27-28页 |
| 4.2 使用马尔科夫聚类算法进行初次聚类 | 第28-29页 |
| 第五章 特征信息分析及探测结果评估 | 第29-36页 |
| 5.1 基因表达数据 | 第29-31页 |
| 5.2 图论信息 | 第31-34页 |
| 5.3 评估及后处理 | 第34-36页 |
| 第六章 聚类结果修正 | 第36-39页 |
| 6.1 逻辑回归模型简介 | 第36-37页 |
| 6.2 复合物增删点修正 | 第37-39页 |
| 第七章 实验结果讨论和未来展望 | 第39-49页 |
| 7.1 预测结果修正方法的验证 | 第39-41页 |
| 7.1.1 节点删除 | 第39-40页 |
| 7.1.2 节点扩充 | 第40-41页 |
| 7.2 预测结果过滤和参数分析 | 第41-44页 |
| 7.3 探测蛋白质功能模块或复合基团的实验结果 | 第44-46页 |
| 7.4 实验结果分析 | 第46页 |
| 7.5 总结和展望 | 第46-49页 |
| 7.5.1 现有工作总结 | 第46-47页 |
| 7.5.2 今后工作展望 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-55页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56页 |
