| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 引言 | 第12-25页 |
| 1.1 蝙蝠回声定位概述 | 第12-17页 |
| 1.1.1 蝙蝠系统发育与分类 | 第12-14页 |
| 1.1.2 蝙蝠回声定位的定义与起源 | 第14-15页 |
| 1.1.3 蝙蝠回声定位的类型 | 第15-17页 |
| 1.2 蝙蝠听觉系统结构基础 | 第17-21页 |
| 1.2.1 回声定位声波的发出和接收器官 | 第17-18页 |
| 1.2.2 蝙蝠的听觉感知过程 | 第18-19页 |
| 1.2.3 蝙蝠听觉系统对高频声信号的适应 | 第19-21页 |
| 1.3 回声定位蝙蝠听觉系统分子进化机制研究现状 | 第21-23页 |
| 1.3.1 分子进化相关理论 | 第21-22页 |
| 1.3.2 回声定位蝙蝠听觉相关基因的适应性进化研究 | 第22页 |
| 1.3.3 回声定位蝙蝠听觉相关基因差异表达研究 | 第22-23页 |
| 1.4 论文研究目的及意义 | 第23-25页 |
| 第二章 三种类型回声定位蝙蝠耳蜗差异表达基因研究 | 第25-57页 |
| 2.1 研究背景 | 第25-26页 |
| 2.2 材料与方法 | 第26-34页 |
| 2.2.1 样本采集 | 第26-27页 |
| 2.2.1.1 回声定位声波主频录制 | 第26-27页 |
| 2.2.1.2 耳蜗样本采集 | 第27页 |
| 2.2.2 总RNA提取及质量检测 | 第27页 |
| 2.2.3 cDNA文库构建及耳蜗转录组测序 | 第27页 |
| 2.2.4 转录组数据拼接、质量评估及功能注释 | 第27-30页 |
| 2.2.5 各蝙蝠物种间差异表达基因分析 | 第30-32页 |
| 2.2.6 差异表达基因功能富集分析 | 第32页 |
| 2.2.7 差异表达基因聚类分析 | 第32-33页 |
| 2.2.8 对CF蝙蝠重要的耳蜗表达基因分析 | 第33页 |
| 2.2.9 实时荧光定量PCR验证 | 第33-34页 |
| 2.3 结果 | 第34-53页 |
| 2.3.1 四种蝙蝠耳蜗转录组数据拼接组装及功能注释结果 | 第34-37页 |
| 2.3.2 样本间关系分析结果 | 第37-39页 |
| 2.3.3 四个蝙蝠物种间差异表达基因分析结果 | 第39-43页 |
| 2.3.4 差异表达基因功能富集分析结果 | 第43-48页 |
| 2.3.5 基于回声定位声波主频的基因聚类分析结果 | 第48-51页 |
| 2.3.6 对CF蝙蝠重要的基因集鉴定及富集分析结果 | 第51-52页 |
| 2.3.7 荧光定量PCR验证结果 | 第52-53页 |
| 2.4 讨论 | 第53-57页 |
| 2.4.1 CF蝙蝠耳蜗中独特的神经系统活动 | 第53-54页 |
| 2.4.2 喉部回声定位蝙蝠重要的听觉分子基础 | 第54-55页 |
| 2.4.3 物种间的基因差异表达分析 | 第55-57页 |
| 第三章 耳蜗中重要听觉基因的适应性进化研究 | 第57-94页 |
| 3.1 研究背景 | 第57-58页 |
| 3.2 材料与方法 | 第58-63页 |
| 3.2.1 研究对象与数据收集 | 第58-59页 |
| 3.2.2 转录组数据拼接、注释及基因编码蛋白框(CDS)预测 | 第59-60页 |
| 3.2.3 单拷贝同源基因筛选与系统发生树构建 | 第60页 |
| 3.2.4 选择压力分析及受正选择听觉基因筛选 | 第60-61页 |
| 3.2.5 平行/趋同进化位点分析 | 第61-62页 |
| 3.2.6 重要氨基酸位点与蛋白结构分析 | 第62-63页 |
| 3.2.7 蛋白互作网络分析 | 第63页 |
| 3.3 研究结果 | 第63-89页 |
| 3.3.1 转录组数据拼接及注释结果 | 第63-65页 |
| 3.3.2 氨基酸序列文库构建、单拷贝同源基因筛选与系统发生树构建结果 | 第65-67页 |
| 3.3.3 重要听觉相关正选择基因 | 第67-70页 |
| 3.3.4 基因平行/趋同进化分析结果 | 第70-74页 |
| 3.3.5 重要听觉基因位点的蛋白质结构定位 | 第74-79页 |
| 3.3.6 功能富集分析结果 | 第79-89页 |
| 3.4 讨论 | 第89-94页 |
| 3.4.1 耳蜗内骨发育相关基因的适应性进化 | 第89-90页 |
| 3.4.2 抗氧化与听觉保护 | 第90-91页 |
| 3.4.3 离子转运和耳蜗稳态 | 第91页 |
| 3.4.4 信号转导过程的适应性进化 | 第91-92页 |
| 3.4.5 回声定位物种间平行/趋同进化位点探讨 | 第92-93页 |
| 3.4.6 在喉部回声定位蝙蝠中发生重要适应性进化的基因 | 第93-94页 |
| 第四章 听觉基因Shh和 SK2 在回声定位蝙蝠中的分子进化研究 | 第94-121页 |
| 4.1 研究背景 | 第94-95页 |
| 4.2 材料与方法 | 第95-101页 |
| 4.2.1 研究的物种范围、分子克隆及测序 | 第95-98页 |
| 4.2.2 样本采集、基因组DNA提取及电泳检测 | 第98页 |
| 4.2.3 引物设计、分子克隆及测序 | 第98-99页 |
| 4.2.4 序列处理和比对 | 第99页 |
| 4.2.5 基因树重建 | 第99-100页 |
| 4.2.6 分子进化分析 | 第100-101页 |
| 4.2.7 正选择位点定位到蛋白质结构 | 第101页 |
| 4.3 结果 | 第101-118页 |
| 4.3.1 基于Shh基因序列构建的系统发育树 | 第101-102页 |
| 4.3.2 Shh基因的分子进化分析结果 | 第102-108页 |
| 4.3.3 基于SK2 基因序列构建的系统发育树 | 第108-109页 |
| 4.3.4 SK2 基因的分子进化分析结果 | 第109-118页 |
| 4.3.4.1 SK2 基因的正选择分析结果 | 第109-116页 |
| 4.3.4.2 SK2 蛋白结构及正选择位点定位 | 第116-117页 |
| 4.3.4.3 SK2 基因滑窗分析结果 | 第117-118页 |
| 4.4 讨论 | 第118-121页 |
| 第五章 结论与展望 | 第121-123页 |
| 5.1 结论 | 第121-122页 |
| 5.2 展望 | 第122-123页 |
| 参考文献 | 第123-137页 |
| 附录 | 第137-152页 |
| 后记 | 第152-154页 |
| 在学期间发表论文 | 第154页 |
