| 摘要 | 第3-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-32页 |
| 1.1 肠道菌群 | 第13-22页 |
| 1.1.1 肠道菌群的组成和结构 | 第13-16页 |
| 1.1.2 肠道菌群结构的影响因素 | 第16-19页 |
| 1.1.2.1 年龄对肠道菌群结构的影响 | 第16页 |
| 1.1.2.2 宿主基因型对肠道菌群结构的影响 | 第16-17页 |
| 1.1.2.3 膳食对肠道菌群结构的影响 | 第17-18页 |
| 1.1.2.4 其他因素对肠道菌群结构的影响 | 第18-19页 |
| 1.1.3 肠道菌群的功能 | 第19-22页 |
| 1.1.3.1 营养代谢作用 | 第19-20页 |
| 1.1.3.2 抗菌保护作用 | 第20页 |
| 1.1.3.3 肠道菌群促进宿主免疫系统的发育 | 第20-21页 |
| 1.1.3.4 肠道菌群失调与疾病的关系 | 第21-22页 |
| 1.2 炎症性肠病与肠道菌群 | 第22-25页 |
| 1.2.1 炎症性肠病特征 | 第22-23页 |
| 1.2.2 炎症性肠病的影响因素 | 第23-25页 |
| 1.2.2.1 遗传因素 | 第23-24页 |
| 1.2.2.2 环境因素 | 第24页 |
| 1.2.2.3 IBD与肠道菌群 | 第24-25页 |
| 1.3 葡聚糖硫酸钠诱导的结肠炎模型 | 第25-29页 |
| 1.3.1 DSS诱导急性肠炎小鼠模型的病理特征 | 第26-27页 |
| 1.3.2 影响DSS诱导小鼠结肠炎模型的因素 | 第27-29页 |
| 1.3.2.1 造模条件对DSS诱导结肠炎模型的影响 | 第27-28页 |
| 1.3.2.2 实验动物对DSS造模的影响 | 第28-29页 |
| 1.3.3 肠道菌群与DSS诱导结肠炎的关系 | 第29页 |
| 1.4 节食与肠道菌群 | 第29-31页 |
| 1.4.1 节食 | 第29-30页 |
| 1.4.2 节食改变肠道菌群 | 第30-31页 |
| 1.5 小结 | 第31-32页 |
| 第二章 节食调节的肠道菌群对DSS诱导的小鼠肠炎模型的作用 | 第32-60页 |
| 引言 | 第33-34页 |
| 2.1 材料与方法 | 第34-43页 |
| 2.1.1 SPF 级动物实验 | 第34-36页 |
| 2.1.2 重复实验 | 第36页 |
| 2.1.3 Germ-free 动物实验 | 第36-38页 |
| 2.1.4 粪便样本中脂质运载蛋白-2 浓度测定 | 第38页 |
| 2.1.5 粪便元基因组提取 | 第38-39页 |
| 2.1.6 粪便样品16S rRNA基因V3-V4区建库及高通量测序 | 第39-41页 |
| 2.1.6.1 粪便元基因组16S rRNA基因V3-V4 区扩增 | 第39-40页 |
| 2.1.6.2 PCR产物纯化 | 第40页 |
| 2.1.6.3 16S rRNA gene V3-V4区Index PCR | 第40-41页 |
| 2.1.6.4 基于Illumina高通量测序平台测序 | 第41页 |
| 2.1.7 统计分析 | 第41-43页 |
| 2.1.7.1 生理指标的统计分析 | 第41页 |
| 2.1.7.2 生物信息学及统计检验 | 第41-43页 |
| 2.2 结果 | 第43-57页 |
| 2.2.1 节食减轻DSS诱导的肠道炎症 | 第43-45页 |
| 2.2.2 节食及DSS处理对肠道菌群的影响 | 第45-55页 |
| 2.2.2.1 节食显著改变小鼠肠道菌群结构 | 第46-50页 |
| 2.2.2.2 DSS诱导肠炎对小鼠肠道菌群的影响 | 第50-55页 |
| 2.2.3 无菌小鼠实验结果 | 第55-56页 |
| 2.2.4 节食改变菌群影响DSS诱导炎症的重复验证 | 第56-57页 |
| 2.3 讨论 | 第57-59页 |
| 2.4 本章小结 | 第59-60页 |
| 第三章 初始肠道菌群对DSS诱导小鼠急性肠炎模型的影响 | 第60-77页 |
| 引言 | 第61-62页 |
| 3.1 材料与方法 | 第62-65页 |
| 3.1.1 样本来源 | 第62页 |
| 3.1.2 粪便样本中生化指标分析 | 第62页 |
| 3.1.3 末端结肠上皮细胞形态分析 | 第62页 |
| 3.1.4 小鼠粪便元基因组提取 | 第62-63页 |
| 3.1.5 粪便元基因组16S rRNA gene V3-V4区建库和高通量测序 | 第63页 |
| 3.1.6 统计分析 | 第63-65页 |
| 3.1.6.1 生理数据统计分析 | 第63页 |
| 3.1.6.2 生物信息学分析及统计检验 | 第63-65页 |
| 3.2 实验结果 | 第65-74页 |
| 3.2.1 DSS处理后三个批次小鼠实验生理及死亡率差异 | 第65-66页 |
| 3.2.2 初始肠道菌群高通量测序数据分析 | 第66-74页 |
| 3.2.2.1 三个批次实验小鼠肠道菌群结构及组成有显著差异 | 第67-71页 |
| 3.2.2.2 对初始肠道菌群差异有贡献的关键细菌对DSS的响应不同.. | 第71-74页 |
| 3.3 讨论 | 第74-75页 |
| 3.4 本章小结 | 第75-77页 |
| 引用文献 | 第77-97页 |
| 论文创新点 | 第97-98页 |
| 附录1.缩写与全称 | 第98-99页 |
| 附录2.仪器设备及产地 | 第99-100页 |
| 硕士期间已(待)发表的学术文章 | 第100-101页 |
| 致谢 | 第101-104页 |
