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核仁素在兔出血症病毒感染与复制中的作用

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
英文缩略表第16-21页
第一章 引言第21-37页
    1.1 兔出血症病毒第21-30页
        1.1.1 RHDV的分类地位第21-22页
        1.1.2 RHDV的形态结构与理化特性第22-23页
        1.1.3 RHDV的基因组结构及蛋白组成第23-28页
        1.1.4 RHDV的复制周期第28-30页
    1.2 核仁素第30-36页
        1.2.1 核仁素的结构第30-32页
        1.2.2 核仁素的生物学功能第32-35页
        1.2.3 核仁素在病毒感染中的作用第35-36页
    1.3 本研究的目的及意义第36-37页
第二章 核仁素在兔出血症病毒感染中的作用及其机制研究第37-70页
    2.1 材料第38-40页
        2.1.1 细胞、病毒、菌种和载体第38页
        2.1.2 实验动物第38页
        2.1.3 主要仪器设备第38页
        2.1.4 主要试剂及抗体第38-39页
        2.1.5 主要缓冲液及试剂的配制第39-40页
    2.2 研究方法第40-49页
        2.2.1 细胞总RNA提取及c DNA合成第40-41页
        2.2.2 质粒构建第41-43页
        2.2.3 质粒和si RNA细胞转染第43页
        2.2.4 Western blot检测(WB)第43-44页
        2.2.5 免疫共沉淀(Co-IP)第44页
        2.2.6 银染与质谱分析第44-45页
        2.2.7 GST融合蛋白的原核表达第45页
        2.2.8 GST-pulldown第45页
        2.2.9 RHDV颗粒纯化与FITC标记第45-46页
        2.2.10 RHDV吸附与内化实验第46页
        2.2.11 激光共聚焦第46-47页
        2.2.12 荧光配体摄取与测定第47页
        2.2.13 抑制剂对RHDV内化的影响第47页
        2.2.14 定量RT-PCR第47-48页
        2.2.15 动物免疫保护实验第48-49页
        2.2.16 数据分析第49页
    2.3 研究结果第49-67页
        2.3.1 鉴定与VP60结合的宿主蛋白第49页
        2.3.2 NCL参与RHDV的内化过程第49-53页
        2.3.3 VP60与NCL的N末端区域相互作用第53-55页
        2.3.4 NCL与VP60的保守氨基酸序列相互作用第55-58页
        2.3.5 NCL与VP60的相互作用在RHDV内化中发挥关键作用第58-60页
        2.3.6 网格蛋白依赖的内吞作用参与RHDV的内化过程第60页
        2.3.7 NCL参与网格蛋白依赖的内吞作用第60-62页
        2.3.8 NCL与网格蛋白轻链(CLTA)的C末端相互作用第62-64页
        2.3.9 NCL与CLTA的结合在RHDV的内化中发挥重要作用第64页
        2.3.10 DVN肽为实验兔提供部分抵抗RHDV感染的免疫力第64-67页
    2.4 讨论第67-70页
第三章 核仁素在兔出血症病毒复制中的作用及其分子机制第70-102页
    3.1 材料第71页
        3.1.1 细胞、病毒、菌种和载体第71页
        3.1.2 实验动物第71页
        3.1.3 主要仪器设备第71页
        3.1.4 主要试剂及抗体第71页
        3.1.5 主要缓冲液及试剂的配制第71页
    3.2 研究方法第71-76页
        3.2.1 细胞总RNA提取及c DNA合成第71-72页
        3.2.2 质粒构建第72-73页
        3.2.3 质粒和si RNA细胞转染第73页
        3.2.4 WB检测第73页
        3.2.5 亲和纯化RHDV复制复合体第73-74页
        3.2.6 哺乳动物双杂交实验第74页
        3.2.7 Co-IP实验第74页
        3.2.8 银染与质谱分析第74页
        3.2.9 GST融合蛋白的原核表达第74页
        3.2.10 GST-pulldown第74页
        3.2.11 激光共聚焦第74-75页
        3.2.12 定量RT-PCR第75页
        3.2.13 稳定过表达细胞系的构建第75页
        3.2.14 荧光素酶的测定第75-76页
        3.2.15 动物实验第76页
        3.2.16 数据分析第76页
    3.3 研究结果第76-99页
        3.3.1 HA和His插入RHDV复制子中的位点选择第76-77页
        3.3.2 含标签的RHDV复制子活性检测第77-79页
        3.3.3 鉴定RHDV复制酶相关的宿主蛋白第79-83页
        3.3.4 NCL参与RHDV的复制第83-85页
        3.3.5 NCL与RHDV Rd Rp相互作用第85-87页
        3.3.6 NCL与RHDV p16相互作用第87-89页
        3.3.7 NCL与RHDV p23相互作用第89-92页
        3.3.8 NCL与RHDV非结构蛋白的结合是保守的第92-94页
        3.3.9 NCL是RHDV复制所必需的宿主蛋白第94-97页
        3.3.10 NCL在RHDV复制复合体形成过程发挥桥梁作用第97-99页
    3.4 讨论第99-102页
第四章 宿主负调控核仁素在兔出血症病毒复制中的功能研究第102-120页
    4.1 材料第103-104页
        4.1.1 细胞、病毒、菌种和载体第103页
        4.1.2 实验动物第103页
        4.1.3 主要仪器设备第103页
        4.1.4 主要试剂及抗体第103-104页
        4.1.5 主要缓冲液及试剂的配制第104页
    4.2 研究方法第104-106页
        4.2.1 总RNA提取及c DNA合成第104页
        4.2.2 质粒构建第104页
        4.2.3 质粒和si RNA细胞转染第104页
        4.2.4 WB检测第104页
        4.2.5 Co-IP实验第104页
        4.2.6 激光共聚焦第104-105页
        4.2.7 定量RT-PCR第105页
        4.2.8 HDAC2酶活性测定第105页
        4.2.9 RHDV感染后的蛋白质组学和转录组学分析第105页
        4.2.10 数据分析第105-106页
    4.3 研究结果第106-118页
        4.3.1 RHDV感染后NCL转录水平升高而蛋白水平无差异第106-108页
        4.3.2 RHDV感染后激活宿主的泛素化途径第108页
        4.3.3 RHDV感染后NCL乙酰化水平降低而泛素化水平升高第108-110页
        4.3.4 NCL被HDAC2去乙酰化后与MDM2结合进入泛素化降解途径第110-112页
        4.3.5 HDAC2抑制RHDV的复制第112页
        4.3.6 RHDV激活JNK和STAT1通路上调HDAC2的表达第112-115页
        4.3.7 抑制JNK和STAT1通路促进RHDV复制第115页
        4.3.8 RHDV p16拮抗HDAC2的抗病毒作用第115-118页
    4.4 讨论第118-120页
第五章 全文结论第120-121页
参考文献第121-140页
附录第140-149页
致谢第149-150页
作者简历第150页

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