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谷氨酸棒状杆菌CRISPR/Cas9基因编辑系统的开发及外源蛋白高效表达宿主的改造

摘要第3-5页
ABSTRACT第5-6页
缩略词表第10-11页
第一章 前言第11-29页
    1.1 谷氨酸棒状杆菌概述第11页
    1.2 谷氨酸棒状杆菌蛋白表达系统第11-14页
    1.3 谷氨酸棒状杆菌表达系统优化策略第14-18页
        1.3.1 发掘新的启动子第14-15页
        1.3.2 表达载体的优化第15页
        1.3.3 宿主细胞的改造第15-17页
        1.3.4 基因改造工具的开发第17-18页
    1.4 CRISPR/CAS基因编辑系统第18-22页
        1.4.1 CRISPR/Cas基因编辑系统概述第18-19页
        1.4.2 CRISPR/Cas系统作用机制第19-20页
        1.4.3 CRISPR/Cas系统分类第20页
        1.4.4 CRISPR/Cas在基因编辑中的应用第20-21页
        1.4.5 CRISPR/Cas系统在谷氨酸棒状杆菌中的应用第21-22页
    1.5 潜在的谷氨酸棒状杆菌优化靶点第22-26页
        1.5.1 肽聚糖内切酶MepA第22-23页
        1.5.2 细胞表面阴离子通道蛋白PorB第23页
        1.5.3 谷氨酸棒状杆菌中蛋白酶系统第23-25页
        1.5.4 谷氨酸棒杆菌中的双组份系统第25-26页
    1.6 立题依据及主要的研究内容第26-29页
第二章 CRISPR/CAS9基因编辑系统的构建第29-53页
    2.1 前言第29页
    2.2 材料方法第29-38页
        2.2.1 材料第29-32页
        2.2.2 方法第32-38页
    2.3 结果与讨论第38-50页
        2.3.1 载体pFST及pFSC的构建第38-39页
        2.3.2 谷氨酸棒状杆菌中基因编辑效率的验证第39-42页
        2.3.3 不同同源修复片段长度的基因编辑效率第42-43页
        2.3.4 不同基因的基因编辑效率第43页
        2.3.5 用于基因定点突变及基因片段插入第43-45页
        2.3.6 不同sgRNA对基因敲除效率的影响第45-46页
        2.3.7 All-in-oneCRISPR/Cas9系统的构建第46-47页
        2.3.8 All-in-oneCRISPR/Cas9系统的检测第47-48页
        2.3.9 脱靶效应分析第48-49页
        2.3.10 质粒消除效果第49-50页
    2.4 本章小结第50-53页
第三章 谷氨酸棒状杆菌外源蛋白高效表达宿主的改造第53-69页
    3.1 前言第53页
    3.2 材料方法第53-61页
        3.2.1 材料第53-57页
        3.2.2 方法第57-61页
    3.3 结果与分析第61-68页
        3.3.1 不同溶氧浓度对C.glutamicum转录组的影响第61-62页
        3.3.2 MepA结构预测及基因保守结构域分析第62-63页
        3.3.3 PorB结构预测及保守域分析第63页
        3.3.4 mepA和porB基因与外源蛋白表达密切相关第63-64页
        3.3.5 mepA和porB敲除对具体生长的影响第64-65页
        3.3.6 三基因敲除菌株的构建第65-66页
        3.3.7 GFP表达检测第66页
        3.3.8 scFv表达检测第66-68页
    3.4 本章小结第68-69页
第四章 NT-PROBNP在谷氨酸棒状杆菌中的表达第69-85页
    4.1 前言第69-70页
    4.2 材料与方法第70-75页
        4.2.1 材料第70-71页
        4.2.2 方法第71-75页
    4.3 结果与讨论第75-82页
        4.3.1 谷氨酸棒状杆菌中GFP不同表达模式菌株的构建第75页
        4.3.2 GFP在谷氨酸棒状杆菌中的表达分析第75-76页
        4.3.3 不同表达模式下gfp转录水平分析第76-77页
        4.3.4 谷氨酸棒状杆菌中NT-proBNP不同表达模式菌株的构建第77页
        4.3.5 NT-proBNP蛋白在谷氨酸棒状杆菌中的表达分析第77-78页
        4.3.6 不同菌株中NT-proBNP的表达第78-81页
        4.3.7 分批补料发酵生产NT-proBNP第81-82页
        4.3.8 NT-proBNP的纯化及抗原特性分析第82页
    4.4 本章小结第82-85页
第五章 PORB与MEPA影响外源蛋白表达的机理研究第85-101页
    5.1 前言第85-86页
    5.2 材料方法第86-92页
        5.2.1 材料第86-88页
        5.2.2 方法第88-92页
    5.3 结果与分析第92-100页
        5.3.1 mprA、mprB、phoP、phoR敲除菌株的构建第92-93页
        5.3.2 mepA、porB、mprA和phoP过表达菌株的构建第93页
        5.3.3 MepA和PorB对细胞生存能力的影响第93-94页
        5.3.4 MepA对胞内ATP水平的影响作用第94-95页
        5.3.5 转录组中mepA和porB相关基因的转录水平变化第95-96页
        5.3.6 mepA和porB相关基因的荧光定量结果第96-99页
        5.3.7 mepA和porB与双组份系统及sigma因子之间的调控关系第99-100页
    5.4 本章小结第100-101页
主要结论与展望第101-103页
    主要结论第101-102页
    展望第102-103页
论文创新点第103-105页
致谢第105-107页
参考文献第107-119页
附表 第二章中所用引物序列第119-123页
附录:作者在攻读博士学位期间发表的论文第123页

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