摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
第一章 前言 | 第11-30页 |
1.1 研究背景 | 第11-26页 |
1.1.1 DNA甲基化与组蛋白修饰 | 第11-21页 |
1.1.2 小泛素类似修饰因子SUMO | 第21-26页 |
1.2 研究对象 | 第26-28页 |
1.2.1 转录基因沉默调控因子——MOM1 | 第26-27页 |
1.2.2 SUMO连接酶 | 第27-28页 |
1.3 研究的问题 | 第28-29页 |
1.4 研究的意义 | 第29-30页 |
第二章 实验材料 | 第30-35页 |
2.1 植物材料 | 第30-31页 |
2.2 菌株 | 第31页 |
2.3 载体 | 第31-32页 |
2.4 试剂 | 第32-33页 |
2.5 仪器与耗材 | 第33-35页 |
第三章 实验方法 | 第35-60页 |
3.1 植物培养 | 第35-36页 |
3.1.1 种子的消毒 | 第35页 |
3.1.2 播种 | 第35-36页 |
3.1.3 植物的培养 | 第36页 |
3.2 突变体的获得 | 第36-41页 |
3.2.1 遗传筛选体系的建立 | 第36-38页 |
3.2.2 突变体的遗传筛选 | 第38-39页 |
3.2.3 突变体的基因定位 | 第39-41页 |
3.2.4 转移DNA(T-DNA)插入突变体的鉴定 | 第41页 |
3.3 突变体表型的鉴定 | 第41-45页 |
3.3.1 沉默位点转录水平的检测 | 第42-44页 |
3.3.2 RNA深度测序分析 | 第44-45页 |
3.3.3 全基因组甲基化分析 | 第45页 |
3.4 突变体表型的互补验证 | 第45-52页 |
3.4.1 载体构建 | 第45-50页 |
3.4.2 农杆菌感受态的转化 | 第50页 |
3.4.3 农杆菌介导的花序侵染法转化拟南芥 | 第50-51页 |
3.4.4 转基因阳性苗的鉴定 | 第51-52页 |
3.5 酵母双杂交体系检测蛋白相互作用 | 第52-54页 |
3.6 蛋白的体外结合 | 第54-55页 |
3.7 植物体内蛋白互作的检测 | 第55-58页 |
3.7.1 植物体内蛋白复合体的亲和纯化 | 第55-56页 |
3.7.2 蛋白银染与质谱分析 | 第56-57页 |
3.7.3 蛋白免疫共沉淀 | 第57页 |
3.7.4 凝胶层析法 | 第57-58页 |
3.8 蛋白的体外SUMO化活性检测 | 第58-60页 |
第四章 实验结果与分析 | 第60-96页 |
4.1 新转录沉默调节因子PIAL1、PIAL2功能研究 | 第60-76页 |
4.1.1 遗传筛选新转录沉默调节因子 | 第60-64页 |
4.1.2 4-3突变体的基因定位与互补验证 | 第64-67页 |
4.1.3 PIAL1、PIAL2调控基因转录沉默功能部分冗余 | 第67-70页 |
4.1.4 PIAL1、PIAL2与MOM1调控共同位点转录沉默 | 第70-72页 |
4.1.5 PIAL1和PIAL2调控转录沉默但不改变DNA甲基化 | 第72-76页 |
4.2 MOM1、PIAL1、PIAL2形成复合体调控基因转录沉默 | 第76-90页 |
4.2.1 PIAL1、PIAL2、MOM1在植物体内形成高分子量复合体 | 第76-78页 |
4.2.2 PIAL1/2的IND结构域是形成同源聚合物以及与MOM1结合所必要的 | 第78-81页 |
4.2.3 PIAL2通过IND与MOM1在植物体内形成复合体调控基因转录沉默 | 第81-86页 |
4.2.4 MOM1二聚体是其调控基因转录沉默所必要的 | 第86-90页 |
4.3 PIAL2-MOM1复合体调控基因转录沉默不依赖SUMO | 第90-96页 |
4.3.1 PIAL2的SUMO连接酶活性不参与调控基因转录沉默 | 第90-93页 |
4.3.2 MOM1不是作为SUMO化的底物来调控基因转录沉默的 | 第93-96页 |
第五章 讨论 | 第96-100页 |
5.1 MOM1、PIAL1、PIAL2与RdDM的关系 | 第96页 |
5.2 MOM1与PIAL1、PIAL2形成紧密复合体调控基因转录 | 第96-98页 |
5.3 MOM1 -PIAL1/2与SUMO的关系 | 第98-100页 |
参考文献 | 第100-107页 |
致谢 | 第107-109页 |
发表的学术论文 | 第109-110页 |