摘要 | 第4-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
英文缩略词表 | 第13-15页 |
第1章 文献综述 | 第15-43页 |
1.1 TNFAIP3基因概述 | 第15-17页 |
1.2 自身免疫性疾病 | 第17-31页 |
1.2.1 自身免疫性疾病概述 | 第17-26页 |
1.2.2 遗传易感性基因与自身免疫性疾病 | 第26-31页 |
1.3 TNFAIP3基因多态性与自身免疫性疾病的相关性 | 第31-40页 |
1.3.1 TNFAIP3基因SNP与RA遗传易感性 | 第35-37页 |
1.3.2 TNFAIP3基因SNP与SLE遗传易感性 | 第37-39页 |
1.3.3 TNFAIP3基因SNP与TID的遗传易感性 | 第39-40页 |
1.3.4 TNFAIP3基因SNP与Ce D的遗传易感性 | 第40页 |
1.4 本研究理论依据 | 第40-43页 |
第2章 材料与方法 | 第43-85页 |
2.1 材料与试剂 | 第43-47页 |
2.2 实验方法 | 第47-83页 |
2.2.1 通过生物信息学方法,研究与类风湿关节炎易感性有关的SNP,比较RA关联SNP中,可能的功能性SNP | 第47-49页 |
2.2.2 利用CRISPR/Cas9技术敲除HEK293T细胞系中rs6927172元件 | 第49-56页 |
2.2.3 靶向结合rs6927172元件的TALE蛋白在HEK293T细胞系中的表达 | 第56-61页 |
2.2.4 工程细胞系功能表征实验 | 第61-78页 |
2.2.5 利用 3C-q PCR技术检测rs6927172元件与靶基因序列的相互作用频率 | 第78-83页 |
2.3 统计学方法 | 第83-85页 |
第3章 实验结果 | 第85-109页 |
3.1 利用HaploReg软件发现8个与rs6920220处于连锁不平衡的SNP | 第85页 |
3.2 利用UCSC数据库对rs6927172元件的组蛋白甲基化修饰以及结合转录因子情况的分析 | 第85-90页 |
3.3 利用CRISPR/cas9技术建立rs6927172元件敲除的HEK293T细胞系 | 第90-92页 |
3.4 敲除rs6927172位点影响包括IL-20RA与TNFAIP3在内的多种基因表达 | 第92-93页 |
3.5 利用PMA/离子霉素活化NF-κB等炎症通路观察敲除rs6927172元件的HEK293T细胞系中IL-20RA与TNFAIP3等基因的表达。 | 第93-94页 |
3.6 利用TALE蛋白的过度表达方法,确认HEK293T细胞内rs6927172元件是通过调控与转录因子复合物的结合,从而影响靶基因的表达 | 第94-96页 |
3.7 TALE阻断rs6927172元件的转录因子结合功能,影响了IL-20RA和TNFAIP3基因表达 | 第96-98页 |
3.8 在HEK293T细胞内过表达TALE蛋白,是否通过NF-ΚB信号通路降低了IL-20RA和TNFAIP3基因的表达水平 | 第98-101页 |
3.9 利用染色质构象捕获实验探讨敲除rs6927172元件与TALE蛋白过表达HEK293T细胞系rs6927172元件与TNFAIP3和IL-20RA基因的相互作用频率 | 第101-103页 |
3.10 讨论 | 第103-109页 |
第4章 结论 | 第109-110页 |
参考文献 | 第110-131页 |
作者简介及在学期间所取得的科研成果 | 第131-133页 |
致谢 | 第133页 |