| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 信号通路的生物学背景和研究进展 | 第11-33页 |
| 1.1 生物网络的生物学背景及性质 | 第11-12页 |
| 1.2 生物网络中的反馈调控 | 第12-17页 |
| 1.3 信号通路中的信息传输 | 第17-22页 |
| 1.4 几个例子 | 第22-31页 |
| 1.4.1 骨重建过程中的信号通路 | 第22-27页 |
| 1.4.2 MAPK通路 | 第27-28页 |
| 1.4.3 mTOR通路 | 第28-30页 |
| 1.4.4 三个组分的一般级联 | 第30-31页 |
| 1.5 本文的主要内容和安排 | 第31-33页 |
| 第二章 非线性系统的时滞效应和随机动力学研究理论 | 第33-55页 |
| 2.1 时滞效应的研究方法 | 第33-41页 |
| 2.1.1 平稳概率密度的扰动理论 | 第37-39页 |
| 2.1.2 矩和方差 | 第39页 |
| 2.1.3 τ→0与τ→∞的极限情况 | 第39-40页 |
| 2.1.4 消失的概率流 | 第40-41页 |
| 2.2 随机动力学的理论研究 | 第41-47页 |
| 2.2.1 主方程 | 第41-42页 |
| 2.2.2 Fokker-Planck方程 | 第42-43页 |
| 2.2.3 线性噪声近似 | 第43-45页 |
| 2.2.4 Langevin理论 | 第45-47页 |
| 2.3 随机动力学的数值模拟方法 | 第47-55页 |
| 2.3.1 差分算法 | 第48-50页 |
| 2.3.2 Gillespie算法 | 第50-53页 |
| 2.3.3 τ跃算法 | 第53-55页 |
| 第三章 骨重建数学模型中的时滞效应 | 第55-67页 |
| 3.1 引言 | 第55-56页 |
| 3.2 具有时滞的骨重建模型 | 第56-58页 |
| 3.3 研究结果 | 第58-64页 |
| 3.3.1 无时滞时骨重建的振荡现象 | 第58-59页 |
| 3.3.2 时滞对肿瘤的由破骨细胞衍生的旁分泌信号的效应 | 第59-61页 |
| 3.3.3 时滞对破骨细胞的由肿瘤衍生的旁分泌信号的效应 | 第61-62页 |
| 3.3.4 治疗情况 | 第62-64页 |
| 3.4 结论和讨论 | 第64-67页 |
| 第四章 不同反馈机制下信号级联的信息传输中的协同性和冗余性 | 第67-83页 |
| 4.1 引言 | 第67-69页 |
| 4.2 四种反馈机制下信号级联的数学模型 | 第69-70页 |
| 4.3 各种反馈机制下信号级联系统性质的统计理论 | 第70-73页 |
| 4.4 研究结果和分析 | 第73-81页 |
| 4.4.1 不同反馈下降解率对输出组分Fano因子的影响 | 第73-75页 |
| 4.4.2 不同反馈下信号级联中信息传输的特征 | 第75-79页 |
| 4.4.3 不同反馈下信号级联中降解率对SNR的效应 | 第79-81页 |
| 4.5 不同方法之间的比较 | 第81-82页 |
| 4.6 小结与讨论 | 第82-83页 |
| 第五章 总结与展望 | 第83-85页 |
| 参考文献 | 第85-102页 |
| 在校期间发表的论文 | 第102-103页 |
| 致谢 | 第103页 |
