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绒山羊肌内脂肪沉积特征及脂肪细胞分化机理的研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
插图和附表清单第13-15页
縮略语表第15-16页
1 引言第16-32页
    1.1 肌内脂肪的研究概况第16页
    1.2 肌内脂肪的沉积第16-17页
        1.2.1 肌内脂肪的合成第16-17页
        1.2.2 肌内脂肪的分解第17页
        1.2.3 肌内脂肪的转运第17页
    1.3 肌内脂肪对羊肉品质的影响第17-19页
        1.3.1 肌内脂肪对大理石纹的影响第18页
        1.3.2 肌内脂肪对羊肉嫩度的影响第18页
        1.3.3 肌内脂肪对羊肉风味的影响第18-19页
    1.4 脂肪细胞研究进展第19-22页
        1.4.1 脂肪细胞的起源第19-20页
        1.4.2 前体脂肪细胞的研究模型第20-21页
        1.4.3 前体脂肪细胞的培养第21页
        1.4.4 前体脂肪细胞的诱导分化第21-22页
        1.4.5 成熟脂肪细胞第22页
    1.5 脂肪细胞分化的转录调控第22-24页
        1.5.1 PPARs第22-24页
        1.5.2 C/EBPs第24页
    1.6 动物脂肪组织和肌内脂肪代谢关键基因的研究进展第24-28页
        1.6.1 HSL第24-25页
        1.6.2 Lipin第25-26页
        1.6.3 FTO第26-27页
        1.6.4 LPL第27页
        1.6.5 FABPs第27-28页
        1.6.6 perilipin第28页
    1.7 基因研究技术进展第28-32页
        1.7.1 基因功能研究技术第28-30页
        1.7.2 基因筛选技术第30-32页
2 研究一:白绒山羊不同部位肌内脂肪含量与脂肪沉积关键基因相关性分析第32-48页
    2.1 试验材料第32-34页
        2.1.1 试验动物第32-33页
        2.1.2 主要试剂和仪器第33页
        2.1.3 引物设计与合成第33-34页
    2.2 试验方法第34-35页
        2.2.1 肌内脂肪含量的测定第34页
        2.2.2 总RNA的提取第34页
        2.2.3 总RNA反转录合成cDNA第34-35页
        2.2.4 脂肪沉积关键基因的克隆第35页
        2.2.5 脂肪沉积关键基因的实时定量检测第35页
    2.3 结果与分析第35-47页
        2.3.1 绒山羊不同部位肌内脂肪含量第35-36页
        2.3.2 标准曲线的绘制第36-38页
        2.3.3 绒山羊不同部位脂肪沉积关键基因mRNA的表达变化第38-40页
        2.3.4 脂肪沉积关键基因相关性变化第40页
        2.3.5 脂肪沉积关键基因对肌内脂肪含量相关性分析第40-41页
        2.3.6 同一组织下不同基因表达的多重比较分析第41-47页
    2.4 小结第47-48页
3 研究二:绒山羊肌内前体脂肪细胞的基因表达分析第48-60页
    3.1 试验材料第48-49页
        3.1.1 试验动物第48页
        3.1.2 主要试剂和仪器第48-49页
    3.2 试验方法第49-51页
        3.2.1 肌内前体脂肪细胞的分离培养第49页
        3.2.2 肌内前体脂肪细胞的传代培养第49页
        3.2.3 肌内前体脂肪细胞的诱导分化第49-50页
        3.2.4 细胞生长曲线的绘制第50页
        3.2.5 绒山羊肌内脂肪细胞的鉴定第50页
        3.2.6 细胞的冻存与复苏第50页
        3.2.7 引物设计第50页
        3.2.8 细胞总RNA的提取与检测第50-51页
        3.2.9 RT-PCR反应第51页
    3.3 结果与分析第51-57页
        3.3.1 绒山羊肌内前体脂肪细胞的形态学观察第51-52页
        3.3.2 山羊肌内前体脂肪细胞的传代培养第52页
        3.3.3 山羊肌内脂肪细胞的诱导分化及鉴定第52-54页
        3.3.4 肌内前体脂肪细胞的生长曲线第54-55页
        3.3.5 肌内前体脂肪细胞分化过程中成脂基因的表达第55-56页
        3.3.6 肌内前体脂肪细胞诱导过程中成脂基因的表达第56-57页
    3.4 讨论第57-59页
        3.4.1 构建白绒山羊肌内前体脂肪细胞体外培养体系第57-58页
        3.4.2 肌内前体脂肪细胞的增殖分化第58-59页
    3.5 小结第59-60页
4 研究三:RNAi沉默PPARγ基因对绒山羊肌内脂肪细胞的影响第60-77页
    4.1 试验材料第61-62页
        4.1.1 细胞、质粒第61页
        4.1.2 主要试剂和仪器第61-62页
    4.2 试验方法第62-66页
        4.2.1 siRNA设计第62-63页
        4.2.2 shRNA寡核苷酸链的退火第63页
        4.2.3 PPARγ—shRNA表达载体的构建第63页
        4.2.4 慢病毒载体质粒pHBLV-U6-Puro的回收与扩增第63-64页
        4.2.5 pHBLV-U6-Puro大片段与发卡状结构PPARγ-shRNA的连接第64页
        4.2.6 转化和测序第64页
        4.2.7 慢病毒的包装和浓缩第64页
        4.2.8 目的细胞慢病毒感染第64-65页
        4.2.9 检测PPARγ的mRNA和蛋白表达水平第65-66页
    4.3 结果与分析第66-74页
        4.3.1 酶切、测序结果第66-68页
        4.3.2 PPARγ-shRNA1、PPARγ-shRNA2、PPARγ-shRNA3干扰组转染293T细胞第68-69页
        4.3.3 慢病毒转染绒山羊肌内脂肪细胞第69-70页
        4.3.4 Real-time检测干扰后PPAR γ基因在脂肪细胞不同时间点的表达情况第70页
        4.3.5 WB检测干扰后PPARγ蛋白在脂肪细胞不同时间点的表达情况第70-71页
        4.3.6 下调PPARγ基因表达量对绒山羊肌内脂肪细胞增殖的影响第71-72页
        4.3.7 下调PPARγ基因表达量对绒山羊肌内脂肪细胞分化的影响第72-73页
        4.3.8 PPARγ基因表达量下降后其他成脂基因表达量的变化第73-74页
    4.4 讨论第74-77页
    4.5 小结第77页
5 研究四:绒山羊肌内脂肪细胞比较转录组分析第77-101页
    5.1 试验材料第77-78页
        5.1.1 试验样本第78页
        5.1.2 主要试剂和仪器第78页
    5.2 试验方法第78-81页
        5.2.1 样品RNA的提取第78页
        5.2.2 cDNA文库的制备第78-79页
        5.2.3 RNA-Seq文库测序第79-80页
        5.2.4 序列比对第80页
        5.2.5 转录本的构建及定量第80页
        5.2.6 基因差异表达分析第80-81页
        5.2.7 可变剪接分析第81页
    5.3 结果与分析第81-96页
        5.3.1 RNA提取与质量检测第82-83页
        5.3.2 与参考基因组对比分析第83-84页
        5.3.3 差异基因的筛选第84-86页
        5.3.4 差异表达基因GO分类第86-92页
        5.3.5 差异表达基因通路的富集第92-95页
        5.3.6 可变剪接第95-96页
    5.4 讨论第96-101页
    5.5 小结第101页
6 结论第101-103页
致谢第103-104页
参考文献第104-118页
作者简介第118页

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