| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 英文缩写词表 | 第8-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-19页 |
| 1.1 对羟基苯甲酸酯类简介及其对动物的生殖毒性 | 第11-12页 |
| 1.2 测序技术研究进展 | 第12-15页 |
| 1.2.1 Sanger测序平台 | 第12页 |
| 1.2.2 454测序平台 | 第12-13页 |
| 1.2.3 Illumina/Solexa测序平台 | 第13页 |
| 1.2.4 ABI/SOLiD测序 | 第13-14页 |
| 1.2.5 RNA-seq技术特点及其与数字基因表达谱(DGE)的关系 | 第14-15页 |
| 1.3 RNA-seq面临的挑战 | 第15-16页 |
| 1.3.1 文库构建 | 第15页 |
| 1.3.2 生物信息学分析 | 第15-16页 |
| 1.3.3 测序覆盖率与成本 | 第16页 |
| 1.4 基因表达的研究方法 | 第16-17页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第17-19页 |
| 第2章 对羟基苯甲酸乙酯对雄果蝇生殖毒性的影响 | 第19-25页 |
| 2.1 材料与方法 | 第19-20页 |
| 2.1.1 实验材料及主要仪器与试剂 | 第19页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第19-20页 |
| 2.2 数据分析 | 第20页 |
| 2.3 结果 | 第20-23页 |
| 2.3.1 不同浓度EP对F0雄果蝇生殖力及F1羽化量的影响 | 第20-21页 |
| 2.3.2 不同浓度EP对F1果蝇繁殖力及F2羽化量的影响 | 第21-22页 |
| 2.3.3 不同浓度EP对果蝇后代发育及羽化天数的影响 | 第22-23页 |
| 2.4 讨论 | 第23-25页 |
| 第3章 基于RNA-seq检测对羟基苯甲酸乙酯对雄果蝇的DGE分析 | 第25-59页 |
| 3.1 材料与方法 | 第25-26页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第25页 |
| 3.1.2 仪器与设备 | 第25页 |
| 3.1.3 主要实验试剂 | 第25页 |
| 3.1.4 溶液配制 | 第25-26页 |
| 3.2 实验方法 | 第26-34页 |
| 3.2.1 实验动物处理 | 第26页 |
| 3.2.2 总RNA提取 | 第26-27页 |
| 3.2.3 DGE文库构建 | 第27-28页 |
| 3.2.4 上机测序 | 第28页 |
| 3.2.5 生物信息学分析 | 第28-32页 |
| 3.2.6 荧光实时定量PCR验证(qRT-PCR) | 第32-34页 |
| 3.3 实验结果 | 第34-54页 |
| 3.3.1 黑腹果蝇总 RNA 提取 | 第34-35页 |
| 3.3.2 DGE文库构建 | 第35页 |
| 3.3.3 测序原始数据说明 | 第35-37页 |
| 3.3.4 生物信息学分析 | 第37-54页 |
| 3.3.5 qRT-PCR验证结果 | 第54页 |
| 3.4 讨论 | 第54-59页 |
| 3.4.1 测序质量分析 | 第54-55页 |
| 3.4.2 序列注释到参考基因组的分析 | 第55页 |
| 3.4.3 RNA-Seq质量分析 | 第55-56页 |
| 3.4.4 差异表达基因分析 | 第56-59页 |
| 第4章 结论与展望 | 第59-61页 |
| 4.1 结论 | 第59页 |
| 4.2 展望 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-73页 |
| 致谢 | 第73-75页 |
| 攻读硕士学位期间科研成果 | 第75页 |
