微分方程系统在基因调控网络和代谢途径中的应用研究
| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| ·研究背景和意义 | 第10-11页 |
| ·课题的研究动态 | 第11-15页 |
| ·基因调控网络 | 第11-14页 |
| ·代谢途径 | 第14-15页 |
| ·本文的研究思路 | 第15-16页 |
| ·本文的研究结构和安排 | 第16-18页 |
| 第二章 微分方程模型 | 第18-22页 |
| ·微分方程模型 | 第18-19页 |
| ·实际的应用 | 第19页 |
| ·解微分方程 | 第19-22页 |
| 第三章 进化算法建模微分方程 | 第22-30页 |
| ·进化算法 | 第22-24页 |
| ·遗传编程 | 第23-24页 |
| ·多表达式编程 | 第24-28页 |
| ·MEP 编码方式 | 第24-25页 |
| ·MEP 适应值函数 | 第25-26页 |
| ·MEP 的遗传操作 | 第26页 |
| ·MEP 的优点 | 第26-27页 |
| ·MEP 的流程 | 第27-28页 |
| ·粒子群优化算法 | 第28-30页 |
| ·粒子群优化算法概述 | 第28页 |
| ·PSO 的流程 | 第28-30页 |
| 第四章 微分方程的演化 | 第30-40页 |
| ·微分方程的演化 | 第30-33页 |
| ·MEP 优化微分方程组 | 第30-31页 |
| ·适应值的度量 | 第31-32页 |
| ·方法的改进 | 第32页 |
| ·混合优化策略 | 第32-33页 |
| ·仿真实验 | 第33-40页 |
| ·化学反应模型 | 第34-35页 |
| ·Lotka-Volterra 模型 | 第35页 |
| ·双分子反应模型 | 第35-37页 |
| ·小规模基因调控网络 | 第37-39页 |
| ·中规模基因调控网络 | 第39-40页 |
| 第五章 灵活树模型 | 第40-54页 |
| ·灵活树模型 | 第40-43页 |
| ·灵活树参数优化 | 第42页 |
| ·灵活树优化流程 | 第42-43页 |
| ·灵活树模型仿真实验 | 第43-49页 |
| ·E_cell 仿真 | 第43-45页 |
| ·三类Lotka-Volterra 模型 | 第45-46页 |
| ·TCP 车辆数据测试 | 第46-49页 |
| ·限制性灵活树模型 | 第49-50页 |
| ·限制性灵活树模型仿真 | 第50-54页 |
| ·小规模基因调控网络 | 第51页 |
| ·中规模基因调控网络 | 第51-52页 |
| ·大规模基因调控网络 | 第52-54页 |
| 第六章 总结与展望 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-62页 |
| 致谢 | 第62-64页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第64页 |