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基于PCR-RFLP技术的当归根际土壤细菌研究

西北师范大学研究生学位论文作者信息第5-8页
文章中出现的缩略词第8-9页
摘要第9-11页
ABSTRACT第11-13页
第一章 绪论第14-28页
    1 当归的研究概况第14-18页
        1.1 当归简介第14页
        1.2 当归的栽培学研究第14-15页
        1.3 当归的化学成分第15页
        1.4 当归的药理作用第15-16页
        1.5 当归连作障碍及其防治第16-18页
            1.5.1 当归连作减产的原因第17页
            1.5.2 当归连作障碍的防治第17-18页
    2 根际微生物研究近况第18页
    3 根际微生物研究方法进展第18-27页
        3.1 传统的根际微生物研究方法第18-19页
        3.2 基于分子生物学的根际微生物研究方法第19-22页
            3.2.1 扩增 rDNA 限制性酶切片段分析法(ARDRA)第19-20页
            3.2.2 限制性片段长度多态性(RFLP)第20-21页
            3.2.3 变性梯度凝胶电泳(DGGE)第21-22页
        3.3 基于基因组学的根际微生物研究方法第22-25页
            3.3.1 荧光原位杂交(FISH)第22页
            3.3.2 稳定性同位素探针(SIP)第22-23页
            3.3.3 宏基因组文库第23-24页
            3.3.4 基因芯片第24-25页
        3.4 基于高通量测序的根际微生物研究第25-27页
    4 本研究的内容、目的和意义第27-28页
第二章 材料与方法第28-38页
    1 材料第28-31页
        1.1 土壤采样区概况第28页
        1.2 土壤样品采集第28-29页
        1.3 主要仪器设备第29页
        1.4 主要的试剂及配制第29-31页
            1.4.1 主要试剂第29-30页
            1.4.2 主要试剂配制第30-31页
            1.4.3 引物第31页
    2 实验方法第31-38页
        2.1 土壤理化性质的测定[85-86]第31-33页
            2.1.1 pH 值的测定第31页
            2.1.2 全氮含量的测定第31-32页
            2.1.3 速效磷含量的测定第32页
            2.1.4 土壤速效钾的测定第32-33页
            2.1.5 土壤有机质的测定第33页
        2.2 土壤微生物总 DNA 的提取第33-34页
        2.3 DNA 的纯化第34页
        2.4 16srDNA 的 PCR 扩增与纯化第34-35页
        2.5 PCR 纯化回收产物与 PTG19-T 载体连接第35页
        2.6 连接产物的转化第35-36页
        2.7 克隆文库的筛选第36页
        2.8 菌液 PCR 产物的酶切第36页
        2.9 RFLP 酶切图谱分析第36-37页
        2.10 16S rDNA 基因序列测定和系统发育树的构建第37-38页
第三章 结果与分析第38-69页
    1 土壤微生物总 DNA 的提取第38页
    2 细菌 16SRDNA 片段的扩增第38-39页
    3 克隆文库的菌落 PCR第39页
    4 不同限制性内切酶对采样地细菌 16SRDNA 克隆文库的酶切结果对比分析第39-56页
        4.1 不同限制性内切酶对采样地细菌 16S rDNA 的酶切结果及聚类分析第40-49页
            4.1.1 大豆-当归轮作地细菌 16S rDNA 酶切结果及聚类分析第40-43页
            4.1.2 当归种植地细菌 16S rDNA 酶切结果及聚类分析第43-46页
            4.1.3 荒地细菌 16S rDNA 酶切结果及聚类分析第46-49页
        4.2 不同限制性内切酶对采样地细菌 16S rDNA 的酶切类型统计第49-55页
        4.3 基于不同限制性内切酶的细菌 16S rDNA 克隆文库多样性分析第55-56页
    5 三种采样地细菌 16S RDNA 克隆文库的酶切结果对比分析第56-63页
        5.1 三种采样地细菌 16S rDNA 的酶切结果及聚类分析第56-57页
            5.1.1 大豆-当归轮作地细菌 16S rDNA 酶切结果及聚类分析第56页
            5.1.2 当归种植地细菌 16S rDNA 酶切结果及聚类分析第56-57页
            5.1.3 荒地细菌 16S rDNA 酶切结果及聚类分析第57页
        5.2 三种采样地细菌 16S rDNA 的酶切类型统计第57-61页
        5.3 三种采样地细菌 16S rDNA 克隆文库多样性分析第61-63页
    6 三种采样地 16S RDNA 克隆文库的测序结果与系统发育树的构建第63-69页
        6.1 大豆-当归轮作地 16S rDNA 克隆文库的测序结果与系统发育树的构建第63-64页
        6.2 当归种植地 16S rDNA 克隆文库的测序结果与系统发育树的构建第64-67页
        6.3 荒地 16S rDNA 的测序结果与系统发育树的构建第67-69页
第四章 讨论第69-72页
    1 轮作与连作对根际土壤细菌种群组成的影响第69页
    2 轮作与连作对根际土壤细菌种群多样性的影响第69-70页
    3 轮作与连作根际土壤细菌克隆文库的酶切分析第70页
    4 克隆文库的构建第70-72页
第五章 结论第72页
第六章 展望第72-73页
参考文献第73-80页
参与项目与科研成果第80-81页
致谢第81-82页
附录第82-84页

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