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石斛新种鉴定及铁皮石斛(Dendrobium catenatum)组培苗丛枝病的分子机理研究

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-10页
符号说明第11-17页
第一章 文献综述第17-42页
    1.1 铁皮石斛概况第17-19页
    1.2 丛枝病第19-21页
        1.2.1 丛枝病的症状表现第19-20页
        1.2.2 丛枝病发病机理第20-21页
    1.3 细胞分裂素的分子机理第21-27页
        1.3.1 细胞分裂素的生物合成与代谢第21-23页
        1.3.2 细胞分裂素的运输第23-24页
        1.3.3 细胞分裂素的信号转导第24-27页
    1.4 细胞分裂素的作用方式第27-32页
        1.4.1 细胞分裂素对芽发育的转录调控第27-28页
        1.4.2 细胞分裂素对根发育的转录调控第28-29页
        1.4.3 细胞分裂素控制细胞生长周期第29-32页
    1.5 芽分枝的机理第32-34页
    1.6 根的发育机理第34-37页
    1.7 植株生长的阻遏第37-39页
    1.8 泛素与激素信号第39-40页
    1.9 研究目的与意义第40-42页
第二章 铁皮石斛及其它药用石斛的形态对比分标第42-53页
    2.1 材料与方法第42-43页
        2.1.1 材料第42页
        2.1.2 方法第42-43页
            2.1.2.1 微观和宏观形态观察第42页
            2.1.2.2 系统发育研究第42-43页
            2.1.2.3 测序和数据分析第43页
    2.2 结果与分析第43-52页
        2.2.1 与铁皮石斛容易混淆的4个已知石斛种形态描述第43-46页
        2.2.2 石斛新种鉴定第46-52页
            2.2.2.1 待鉴定石斛的形态描述第46页
            2.2.2.2 系统发育分析第46-47页
            2.2.2.3 新种命名第47-52页
    2.3 小结第52-53页
第三章 激素应用与铁皮石斛症状表型变化分析第53-71页
    3.1 材料与方法第53-56页
        3.1.1 材料第53页
        3.1.2 方法第53-56页
            3.1.2.1 培养条件第53页
            3.1.2.2 激素浓度梯度设置第53-56页
            3.1.2.3 发病程度的界定第56页
            3.1.2.4 不同发病程度小苗的表型鉴定第56页
    3.2 结果与分析第56-70页
        3.2.1 激素初选浓度梯度处理诱导发病的表型变化分析第56-58页
        3.2.2 BA不同浓度梯度诱导样本小苗发病的表型变化分析第58-64页
        3.2.3 BA不同浓度诱发丛枝病的分析第64-67页
        3.2.4 三种症状小苗的表型鉴定第67-70页
    3.3 小结第70-71页
第四章 不同症状植株的转录组差异分析第71-92页
    4.1 材料与方法第71-75页
        4.1.1 材料第71页
        4.1.2 方法第71-75页
            4.1.2.1 RNA提取第71页
            4.1.2.2 文库构建与De novo组装第71-72页
            4.1.2.3 功能注释第72-73页
            4.1.2.4 转录因子富集第73页
            4.1.2.5 三种症状小苗基因表达谱的比较第73页
            4.1.2.6 三种症状小苗差异表达基因的鉴定第73-75页
            4.1.2.7 转录组数据的qRT-PCR验证第75页
            4.1.2.8 症状相关基因的qRT-PCR分析第75页
    4.2 结果与分析第75-91页
        4.2.1 转录组分析第75-91页
            4.2.1.1 RNA完整性检测第75-76页
            4.2.1.2 测序与组装第76-77页
            4.2.1.3 Unigene的结构分析第77-78页
            4.2.1.4 转录因子富集第78-79页
            4.2.1.5 转录组数据的qRT-PCR实验验证第79-80页
            4.2.1.6 与分枝、无根及矮化症状相关的差异表达基因的分析第80-91页
    4.3 小结第91-92页
第五章 症状相关直系同源基因的鉴定与分析第92-135页
    5.1 材料与方法第92-93页
        5.1.1 材料第92页
        5.1.2 方法第92-93页
            5.1.2.1 症状相关直系同源基因的初步筛选第92页
            5.1.2.2 系统发育树的构建第92-93页
            5.1.2.3 直系同源基因的确定第93页
    5.2 结果与分析第93-133页
        5.2.1 细胞分裂素代谢相关直系同源基因的鉴定第93-95页
        5.2.2 细胞分裂素代谢相关直系同源基因及转录表达分析第95-114页
            5.2.2.1 细胞分裂素合成与代谢相关直系同源基因及转录表达分析第95-101页
            5.2.2.2 细胞分裂素运输相关直系同源基因及转录表达分析第101-106页
            5.2.2.3 细胞分裂素信号转导相关直系同源基因及转录表达分析第106-114页
        5.2.3 症状相关直系同源基因的鉴定第114页
        5.2.4 症状相关直系同源基因及转录表达分析第114-127页
            5.2.4.1 与分枝相关的直系同源基因及转录表达分析第114-119页
            5.2.4.2 与无根相关的直系同源基因及转录表达分析第119-123页
            5.2.4.3 与株高发育相关的直系同源基因及转录表达分析第123-127页
        5.2.5 与细胞分裂和代谢调节相关的直系同源基因及转录表达分析第127-132页
        5.2.6 部分重要直系同源基因的表达模式分析第132-133页
    5.3 小结第133-135页
第六章 讨论第135-141页
结论第141-142页
参考文献第142-161页
致谢第161-163页
附录第163-175页

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