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全局因子DasR和Crp对莫能菌素生物合成的转录调控

中文摘要第4-5页
abstract第5-6页
第1章 文献综述第12-30页
    1.1 引言第12页
    1.2 莫能菌素第12-14页
        1.2.1 莫能菌素理化性质第12-14页
        1.2.2 莫能菌素的应用第14页
    1.3 莫能菌素的生物合成第14-19页
        1.3.1 莫能聚酮合成基因第16-17页
        1.3.2 莫能修饰基因第17-18页
        1.3.3 莫能途径特异性调控基因第18-19页
    1.4 全局调控因子DasR第19-22页
        1.4.1 N-乙酰葡糖对DasR调控作用的影响第20页
        1.4.2 DasR对链霉菌形态分化的调控第20-21页
        1.4.3 DasR对抗生素生物合成的调控第21-22页
    1.5 全局调控因子Crp第22-24页
        1.5.1 Crp对链霉菌形态分化的调控第23页
        1.5.2 Crp对初级代谢与细胞功能的调控第23-24页
        1.5.3 Crp对抗生素生物合成的调控第24页
    1.6 代谢工程调控抗生素产量第24-28页
        1.6.1 调节前体供应第25页
        1.6.2 扩增生物合成基因簇或结构基因第25-26页
        1.6.3 生物合成途径的异源表达第26页
        1.6.4 操纵调控基因第26-28页
    1.7 研究内容与意义第28-30页
        1.7.1 研究内容第28页
        1.7.2 研究意义第28页
        1.7.3 技术路线第28-30页
第2章 DasR和Crp蛋白的异源表达与纯化第30-52页
    2.1 实验材料第30-34页
        2.1.1 菌种与质粒第30-31页
        2.1.2 实验仪器第31页
        2.1.3 实验试剂第31-32页
        2.1.4 培养基第32页
        2.1.5 溶液第32-34页
    2.2 实验方法第34-47页
        2.2.1 PCR反应第34-37页
        2.2.2 琼脂糖凝胶电泳第37-38页
        2.2.3 DNA片段的回收与纯化第38-39页
        2.2.4 酶切与连接第39-40页
        2.2.5 大肠杆菌质粒DNA的提取第40-42页
        2.2.6 CaCl_2转化法转化大肠杆菌质粒第42-43页
        2.2.7 电转化法转化大肠杆菌质粒第43-44页
        2.2.8 可溶性蛋白的纯化与鉴定第44-46页
        2.2.9 蛋白电泳第46-47页
    2.3 结果与分析第47-50页
        2.3.1 可溶性DasR蛋白的获得第47-49页
        2.3.2 可溶性Crp蛋白的获得第49-50页
    2.4 讨论第50-51页
    2.5 本章小结第51-52页
第3章 DasR对莫能菌素生物合成的调控效应第52-74页
    3.1 实验材料第52-56页
        3.1.1 菌种与质粒第52-53页
        3.1.2 实验仪器第53-54页
        3.1.3 实验试剂第54页
        3.1.4 培养基第54-55页
        3.1.5 溶液第55-56页
    3.2 实验方法第56-60页
        3.2.1 肉桂地链霉菌的培养与保存第56-57页
        3.2.2 肉桂地链霉菌的结合转移第57-58页
        3.2.3 肉桂地链霉菌基因组的提取第58-59页
        3.2.4 莫能菌素效价的测定第59-60页
    3.3 结果与分析第60-71页
        3.3.1 dasR过表达载体及菌株的构建第60-62页
        3.3.2 sRNA载体及菌株的构建第62-65页
        3.3.3 dasR敲除载体及菌株的构建第65-67页
        3.3.4 发酵与效价测定第67-69页
        3.3.5 N-乙酰葡糖对莫能菌素生物合成的影响第69-71页
    3.4 讨论第71-72页
    3.5 本章小结第72-74页
第4章 DasR调控莫能菌素生物合成的转录分析第74-94页
    4.1 实验材料第74-75页
        4.1.1 菌株与质粒第74页
        4.1.2 实验仪器第74页
        4.1.3 实验试剂第74-75页
        4.1.4 培养基第75页
        4.1.5 溶液第75页
    4.2 实验方法第75-82页
        4.2.1 凝胶迁移实验(EMSAs)第75-79页
        4.2.2 肉桂地链霉菌RNA的提取第79-80页
        4.2.3 RT-PCR反应第80-82页
    4.3 结果与分析第82-91页
        4.3.1 DasR结合的启动子第82-87页
        4.3.2 dasR过表达上调的转录单元第87-89页
        4.3.3 dasR在发酵周期内的转录水平变化第89-91页
    4.4 讨论第91-93页
    4.5 本章小结第93-94页
第5章 Crp对莫能菌素生物合成的调控效应第94-104页
    5.1 实验材料第94-96页
        5.1.1 菌种与质粒第94-95页
        5.1.2 实验仪器第95页
        5.1.3 实验试剂第95页
        5.1.4 培养基第95页
        5.1.5 溶液第95-96页
    5.2 实验方法第96页
    5.3 结果与分析第96-101页
        5.3.1 crp过表达载体与菌株的构建第96-97页
        5.3.2 sRNA载体及菌株的构建第97-99页
        5.3.3 发酵与效价测定第99-101页
    5.4 讨论第101-102页
    5.5 本章小结第102-104页
第6章 Crp调控莫能菌素生物合成的转录分析第104-122页
    6.1 实验材料第104-105页
        6.1.1 菌种与质粒第104-105页
        6.1.2 实验仪器第105页
        6.1.3 实验试剂第105页
        6.1.4 培养基第105页
        6.1.5 溶液第105页
    6.2 实验方法第105-107页
        6.2.1 转录组测序第105-106页
        6.2.2 差异表达基因分析第106页
        6.2.3 差异表达基因的GO和KEGG富集分析第106-107页
    6.3 结果与分析第107-119页
        6.3.1 Crp蛋白与莫能启动子的凝胶迁移电泳实验第107页
        6.3.2 转录组测序分析第107-113页
        6.3.3 Crp对初级代谢基因和莫能基因转录的调控作用第113-119页
    6.4 讨论第119-121页
    6.5 本章小结第121-122页
第7章 代谢调控构建莫能菌素高产菌株第122-132页
    7.1 实验材料第122-124页
        7.1.1 菌种与质粒第122-123页
        7.1.2 实验仪器第123页
        7.1.3 实验试剂第123-124页
        7.1.4 培养基第124页
        7.1.5 溶液第124页
    7.2 实验方法第124页
    7.3 结果与分析第124-129页
        7.3.1 monRI,monRII,monH过表达载体和菌株的构建第124-125页
        7.3.2 组合过表达载体及菌株的构建第125-127页
        7.3.3 菌株发酵与效价测定第127-129页
    7.4 讨论第129-130页
    7.5 本章小结第130-132页
第8章 结论与展望第132-136页
    8.1 结论第132-133页
    8.2 创新点第133页
    8.3 展望第133-136页
参考文献第136-148页
发表论文及参加科研情况第148-150页
致谢第150-151页

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