| ACKNOWLEDGEMENT | 第9-11页 |
| Table of contents | 第11-14页 |
| List of Tables | 第14-15页 |
| List of Figures | 第15-18页 |
| Abstract | 第18-20页 |
| 摘要 | 第21-23页 |
| CHAPTER 1 Introduction | 第23-27页 |
| CHAPTER 2 Literature Review | 第27-38页 |
| 2.1. Burkholderia cepacia complex and ecology | 第27-28页 |
| 2.2. Biogical potentials of Bcc | 第28-31页 |
| 2.2.1. Plant disease control | 第28-29页 |
| 2.2.2. Plant growth-promoting rhizobacteria | 第29-30页 |
| 2.2.3. Role of Bcc in Bioremediation | 第30-31页 |
| 2.3. Potential Risk associated with Bcc | 第31-34页 |
| 2.3.1. Bcc as Phytopathogen | 第31页 |
| 2.3.2. Bcc as human opportunistic pathogen | 第31-34页 |
| 2.4. Genetics comparison of Bcc and niche adaptation | 第34-38页 |
| 2.4.1. Genomics study of Bcc | 第34-35页 |
| 2.4.2. Transcriptomics study of Bcc | 第35-36页 |
| 2.4.3. Proteomics study of Bcc | 第36-38页 |
| CHAPTER 3 Development of lettuce as an alternative infection model for Bcc and testing thevirulence status of isolates from bamboo rhizosphere China | 第38-50页 |
| 3.1. Abstract | 第38页 |
| 3.2. Introduction | 第38-40页 |
| 3.3. Materials and Methods | 第40-42页 |
| 3.3.1. Bacterial isolates and culture condition | 第40页 |
| 3.3.2. Inoculation of Bcc to lettuce | 第40-41页 |
| 3.3.3. Animal studies | 第41-42页 |
| 3.3.4. Detection of putative transmissibility markers | 第42页 |
| 3.3.5. Data Analysis | 第42页 |
| 3.4. Results | 第42-47页 |
| 3.4.1. Bamboo rhizosphere isolates and potential pathogenicity | 第42-43页 |
| 3.4.2. Virulence status of B. anthina | 第43-44页 |
| 3.4.3. Virulence status of B. stabilis | 第44-45页 |
| 3.4.4. Virulence status of B. pyrrocinia | 第45页 |
| 3.4.5. Virulence status of B. arboris | 第45-46页 |
| 3.4.6. Transmissibility characteristics in bamboo rhizosphere isolates | 第46-47页 |
| 3.5. Discussion | 第47-49页 |
| 3.6. Conclusions | 第49-50页 |
| CHAPTER 4 Diversity of potential pathogenicity and biofilm formation among Burkholderiacepacia complex from water,clinical,and agricultural isolates in China | 第50-66页 |
| 4.1. Abstract | 第50页 |
| 4.2. Introduction | 第50-52页 |
| 4.3. Materials and Methods | 第52-55页 |
| 4.3.1. Bacterial strains and culture conditions | 第52页 |
| 4.3.2. Alfalfa infection assay | 第52页 |
| 4.3.3. Lettuce infection assay | 第52-53页 |
| 4.3.4. Transmission electron microscopy | 第53页 |
| 4.3.5. G. mellonella virulence assay | 第53-54页 |
| 4.3.6. Animal studies | 第54页 |
| 4.3.7. Quantitation of Biofilm formation | 第54-55页 |
| 4.3.8. Statistical analyses | 第55页 |
| 4.4. Results | 第55-63页 |
| 4.4.1. Bcc strains and their infectivity to Alfalfa | 第55页 |
| 4.4.2. Bcc infectivity to lettuce detached midrib | 第55-58页 |
| 4.4.3. Susceptibility of G. mellonella to Bcc | 第58-59页 |
| 4.4.4. Bcc infectivity to lettuce intact leaves | 第59-60页 |
| 4.4.5. Susceptibility of SPD rat to Bcc | 第60-62页 |
| 4.4.6. Association of pathogenicity to biofilm formation | 第62-63页 |
| 4.5. Discussion | 第63-65页 |
| 4.6. Conclusions | 第65-66页 |
| CHAPTER 5 Outer membrane proteome analysis of Burkholderia cepacia complex underniche specific and independent growth condition by LC-MS/MS. | 第66-93页 |
| 5.1. Abstract | 第66-67页 |
| 5.2. Introduction | 第67-68页 |
| 5.3. Materials and Methods | 第68-72页 |
| 5.3.1. Bcc bacterial strains | 第68页 |
| 5.3.2. Culture conditions and growth curve | 第68-70页 |
| 5.3.3. Outer membrane protiens extraction | 第70页 |
| 5.3.4. One-Dimendional SDS-PAGE | 第70页 |
| 5.3.5. LC-MS/MS of trypsin-digested proteins | 第70-71页 |
| 5.3.6. Subcellular localaiztion of protiens | 第71-72页 |
| 5.4. Results | 第72-84页 |
| 5.4.1. Growth curve in host mimic conditions | 第72-73页 |
| 5.4.2. Outer membrane protien extraction and SDS-PAGE | 第73页 |
| 5.4.3. Protein profiling of major Bcc OM proteins | 第73-75页 |
| 5.4.4. Characterization of the OM proteome of B. multivorans | 第75-76页 |
| 5.4.5. Characterization of the OM proteome of B. cenocepacia | 第76-79页 |
| 5.4.6. Characterization of the OM proteome of B. veitnamiensis | 第79-80页 |
| 5.4.7. Characterization of the proteome of B. cepacia | 第80-82页 |
| 5.4.8. Proteins always present in the outer membrane of Bcc | 第82-84页 |
| 5.5. Discussion | 第84-92页 |
| 5.6. Conclusions | 第92-93页 |
| CHAPTER 6 Copper as an antimicrobial agent for human pathogenic multidrug resistantbacterium Burkholderia cepacia complex | 第93-109页 |
| 6.1. Abstract | 第93页 |
| 6.2. Introduction | 第93-95页 |
| 6.3. Materials and Methods | 第95-98页 |
| 6.3.1. Bacterial strains and culture condtions | 第95-96页 |
| 6.3.2. Copper metallic surfaces and copper powder | 第96页 |
| 6.3.3. Viability assays on copper and control surfaces | 第96-97页 |
| 6.3.4. Antibacterial activity of copper powder | 第97页 |
| 6.3.5. Single Cell Gel electrophoresis (SCGE) | 第97-98页 |
| 6.3.6. ICP-MS Analysis | 第98页 |
| 6.3.7. Testing Cell disintegration using general staining methods | 第98页 |
| 6.3.8. Statistical analyses | 第98页 |
| 6.4. Results | 第98-105页 |
| 6.4.1. Antibacterial efficiency of metallic copper surfaces toward Bcc | 第98-101页 |
| 6.4.2. Antibacterial efficiency of metallic copper powder toward Bcc | 第101-102页 |
| 6.4.3. Acute copper toxicity and DNA damage | 第102-103页 |
| 6.4.4. Cell disintegration by copper | 第103页 |
| 6.4.5. Accumulation of copper ions by bacterial cells | 第103-105页 |
| 6.5. Discussion | 第105-108页 |
| 6.6. Conclusions | 第108-109页 |
| General Conclusions | 第109-110页 |
| References | 第110-129页 |
| List of publication | 第129-131页 |
