| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第6-16页 |
| §1.1 引言 | 第6-8页 |
| §1.1.1 蛋白质的错误折叠、聚集与疾病 | 第6-8页 |
| §1.1.2 hIAPP研究目的及意义 | 第8页 |
| §1.2 人的胰岛淀粉样多肽(hIAPP)简介 | 第8-15页 |
| §1.2.1 hIAPP的结构 | 第8-10页 |
| §1.2.2 hIAPP的纤维化过程 | 第10-11页 |
| §1.2.3 hIAPP毒性的可能机理 | 第11-15页 |
| §1.3 POPG磷脂双层膜 | 第15-16页 |
| 第2章 计算方法 | 第16-25页 |
| §2.1 分子动力学模拟方法 | 第16-22页 |
| §2.1.1 分子动力学算法 | 第16-17页 |
| §2.1.2 能量优化方法 | 第17-19页 |
| §2.1.3 Berendsen温度压强耦合 | 第19-20页 |
| §2.1.4 分子动力学模拟经验力场 | 第20-22页 |
| §2.2 分析方法 | 第22-25页 |
| 第3章 hIAPP单体、二聚体与POPG膜相互作用的分子动力学研究 | 第25-44页 |
| §3.1 hlAPP单体、二聚体模拟体系 | 第25-27页 |
| §3.1.1 hIAPP单体、二聚体体系搭建及环境设置 | 第25-26页 |
| §3.1.2 模型及算法参数设置 | 第26-27页 |
| §3.2 模拟结果及分析 | 第27-43页 |
| §3.2.1 hIAPP单体模拟结果 | 第27-29页 |
| §3.2.2 hIAPP二聚体模拟结果 | 第29-32页 |
| §3.2.3 插入深度的讨论 | 第32-35页 |
| §3.2.4 肽链对膜稳定性影响的分析 | 第35-39页 |
| §3.2.4.1 膜表面磷原子z-displacement分析 | 第35-36页 |
| §3.2.4.2 SCD分析 | 第36-38页 |
| §3.2.4.3 膜厚度的分布 | 第38-39页 |
| §3.2.5 hIAPP中各氨基酸与POPG磷脂膜相互作用的能量分析 | 第39-41页 |
| §3.2.6 模拟结果和讨论 | 第41-43页 |
| §3.3 结论 | 第43-44页 |
| 总结 | 第44-46页 |
| 参考文献 | 第46-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 攻读硕士期间参加学术会议及论文发表情况 | 第51-52页 |
