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大肠杆菌RNA分子伴侶Hfq的结构以及与RNA相互作用的研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-13页
第1章 Hfq 蛋白的溶液核磁共振研究第13-48页
   ·背景第13-18页
     ·非编码 RNA 简介第13-14页
     ·大肠杆菌中的非编码 RNA 调控以及 Hfq 蛋白第14-16页
     ·Hfq 蛋白 RNA 分子伴侣的结构第16-18页
   ·针对大分子量蛋白的溶液核磁共振方法第18-24页
     ·针对大蛋白的标记方法第19-20页
     ·Methyl TROSY第20-21页
     ·选择性标记样品的甲基认证第21-22页
     ·动力学和 methyl CPMG第22-24页
   ·Hfq 蛋白 Sm 结构域(Hfq65)的核磁共振表征第24-33页
     ·Hfq65 的主链认证第24-28页
     ·全氘代 Hfq65 蛋白的 I,L,V 甲基选择性标记第28-33页
   ·Hfq 全长蛋白(Hfq FL)的核磁共振表征第33-36页
     ·Hfq FL 的克隆第33页
     ·Hfq FL 的表达和纯化第33-35页
     ·全氘代 Hfq FL 的 I,L,V 甲基选择性标记第35页
     ·Hfq FL 与 Hfq65 核磁共振谱的显著差异第35-36页
   ·NMR 研究 Hfq 蛋白 C 末端尾巴(HfqCTD)与 Hfq65 的相互作用第36-46页
     ·Hfq CTD 的克隆第36-37页
     ·Hfq CTD 的表达纯化第37-38页
     ·Hfq CTD 与 Hfq65 的相互的 NMR 滴定第38-40页
     ·Hfq CTD 的主链认证第40-42页
     ·基于镧系金属 Gd 的顺磁弛豫增强实验第42-46页
   ·Hfq 蛋白核磁共振研究的总结第46-48页
第2章 Hfq 蛋白介导 sRNA 对 mRNA 的转录后调控的结构基础研究第48-75页
   ·背景简介第48-50页
     ·目前对 Hfq 功能结构基础的认识第48-49页
     ·Hfq 帮助 DsrA 调控 rpoS 过程中的作用第49-50页
     ·Hfq 的 ATP 酶活性简介第50页
   ·Hfq 的 ATP 酶活性研究第50-60页
     ·Hfq 与 ADP 的复合物晶体结构第50-53页
     ·Hfq 上的点突变对 ATP 酶活性的影响第53-57页
     ·Hfq ATP 酶活性可能的生理功能第57-60页
   ·Hfq 与 DsrA 以及 rpoS 的相互作用研究第60-75页
     ·用荧光偏振实验测量 Hfq 与 DsrA 片段的结合亲和力第60-62页
     ·Hfq 与 DsrA 上 U-rich 片段的复合物晶体结构第62-65页
     ·Hfq 与 DsrA 上片断 AU6A 和 Uex的溶液核磁共振滴定实验第65-67页
     ·用荧光共振能量转移(FRET)检测不同 Hfq 六聚体的合作第67-71页
     ·用顺磁弛豫增强(PRE)检测 Hfq 六聚体在结合 DsrA 时的合作第71-73页
     ·有可能的基于多个六聚体合作的 Hfq 发挥功能的机制第73-75页
第3章 总结第75-76页
   ·研究结果和意义第75页
   ·对未来工作的展望第75-76页
参考文献第76-83页
致谢第83-84页
在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果第84-85页

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