| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第一章 综述 | 第11-17页 |
| 1.1 EST序列分析 | 第11页 |
| 1.2 电子克隆 | 第11-12页 |
| 1.3 植物MYB类转录因子研究进展 | 第12-15页 |
| 1.3.1 MYB类基因的结构特征及分类 | 第13-14页 |
| 1.3.2 植物MYB类转录因子的功能特点 | 第14-15页 |
| 1.4 同义密码子使用偏好性分析 | 第15页 |
| 1.5 立题依据、目的和意义 | 第15-17页 |
| 第二章 甘蔗MYB转录因子基因的预测和生物信息学分析 | 第17-37页 |
| 2.1 材料与方法 | 第17-18页 |
| 2.1.1 电子克隆获得新基因序列 | 第17-18页 |
| 2.1.2 生物信息学分析 | 第18页 |
| 2.2 结果与分析 | 第18-36页 |
| 2.2.1 甘蔗MYB类转录因子基因的分类 | 第18-20页 |
| 2.2.2 甘蔗MYB2转录因子基因的电子克隆与生物信息学分析 | 第20-25页 |
| 2.2.2.1 甘蔗MYB2蛋白疏水性/亲水性分析 | 第20-21页 |
| 2.2.2.2 甘蔗MYB2蛋白的等电点和分子量预测 | 第21页 |
| 2.2.2.3 甘蔗MYB2蛋白二级结构预测 | 第21-22页 |
| 2.2.2.4 甘蔗MYB2蛋白结构域分析及功能预测 | 第22-23页 |
| 2.2.2.5 甘蔗MYB2蛋白结构域三维结构预测 | 第23-24页 |
| 2.2.2.6 甘蔗MYB基因进化树分析 | 第24-25页 |
| 2.2.3 甘蔗MYB18转录因子基因的电子克隆与生物信息学分析 | 第25-30页 |
| 2.2.3.1 甘蔗MYB18蛋白疏水性/亲水性分析 | 第26-27页 |
| 2.2.3.2 甘蔗MYB18蛋白的等电点和分子量预测 | 第27页 |
| 2.2.3.3 甘蔗MYB18蛋白二级结构预测 | 第27-29页 |
| 2.2.3.4 甘蔗MYB18蛋白三维结构预测 | 第29-30页 |
| 2.2.4 甘蔗MYB59转录因子基因的电子克隆与生物信息学分析 | 第30-34页 |
| 2.2.4.1 甘蔗MYB59蛋白疏水性/亲水性分析 | 第31-32页 |
| 2.2.4.2 甘蔗MYB59蛋白的等电点和分子量预测 | 第32页 |
| 2.2.4.3 甘蔗MYB59蛋白二级结构预测 | 第32-33页 |
| 2.2.4.4 甘蔗MYB59蛋白质结构分析与功能预测 | 第33页 |
| 2.2.4.5 甘蔗MYB59蛋白三维结构预测 | 第33-34页 |
| 2.2.5 甘蔗MYB基因进化树分析 | 第34-36页 |
| 2.3 讨论与结论 | 第36-37页 |
| 第三章 甘蔗MYB18和MYB59基因的实验克隆 | 第37-53页 |
| 3.1 材料与方法 | 第37-43页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第37-38页 |
| 3.1.1.1 植物材料 | 第37页 |
| 3.1.1.2 主要试剂 | 第37-38页 |
| 3.1.1.3 主要仪器和设备 | 第38页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第38-40页 |
| 3.1.2.1 总RNA的提取 | 第38-39页 |
| 3.1.2.2 第一链cDNA的制备 | 第39页 |
| 3.1.2.3 基因组DNA的提取 | 第39-40页 |
| 3.1.3 引物设计 | 第40-41页 |
| 3.1.4 RT-PCR反应体系和程序 | 第41页 |
| 3.1.5 PCR反应体系和程序 | 第41页 |
| 3.1.6 PCR产物电泳检测 | 第41页 |
| 3.1.7 目的片段的回收 | 第41-42页 |
| 3.1.8 目的片段的克隆与测序 | 第42-43页 |
| 3.2. 结果与分析 | 第43-52页 |
| 3.2.1 斑茅蔗MYB18和MYB59转录因子的cDNA序列克隆 | 第43-45页 |
| 3.2.2 斑茅蔗MYB18和MYB59转录因子的基因组序列的克隆 | 第45-46页 |
| 3.2.3 斑茅蔗MYB18和MYB59转录因子的基因结构分析 | 第46-48页 |
| 3.2.4 甘蔗MYB18和MYB59转录因子基因的同源性分析 | 第48-52页 |
| 3.3 讨论与结论 | 第52-53页 |
| 第四章 MYB转录因子的同义密码子使用偏好性分析 | 第53-60页 |
| 4.1 材料和方法 | 第53-55页 |
| 4.1.1 序列数据 | 第53页 |
| 4.1.2 分析方法 | 第53-55页 |
| 4.1.2.1 对应性分析 | 第53页 |
| 4.1.2.2 密码子相对实用度的估算 | 第53-54页 |
| 4.1.2.3 最优密码子的确定 | 第54-55页 |
| 4.2 结果与分析 | 第55-58页 |
| 4.2.1 MYB基因的碱基组成 | 第55页 |
| 4.2.2 MYB基因密码子的对应性分析 | 第55-56页 |
| 4.2.3 最优密码子的确立 | 第56-58页 |
| 4.3 讨论与结论 | 第58-60页 |
| 第五章 甘蔗MYB18转录因子功能的初步鉴定 | 第60-69页 |
| 5.1 材料与方法 | 第60-63页 |
| 5.1.1 实验材料及其处理 | 第60-61页 |
| 5.1.2 实验方法 | 第61-63页 |
| 5.1.2.1 RNA提取及第一链cDNA的合成 | 第61页 |
| 5.1.2.2 定量PCR分析 | 第61-62页 |
| 5.1.2.3 甘蔗MYB18转录因子基因的原核表达载体构建 | 第62页 |
| 5.1.2.4 甘蔗MYB18转录因子基因的原核表达分析方法 | 第62-63页 |
| 5.2 结果与分析 | 第63-67页 |
| 5.2.1 甘蔗MYB18转录因子基因的定量PCR表达分析 | 第63-66页 |
| 5.2.2 甘蔗MYB18转录因子基因的原核表达载体构建与诱导表达 | 第66-67页 |
| 5.3 讨论与结论 | 第67-69页 |
| 全文小结 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-77页 |
| 附录 | 第77-85页 |
| 致谢 | 第85页 |
